يصف هذا البروتوكول طريقة Capture Hi-C المستخدمة لتوصيف تنظيم 3D للمناطق الجينومية المستهدفة ذات الحجم الضخم بدقة عالية ، بما في ذلك حدود المجالات المرتبطة طوبولوجيا (TADs) وتفاعلات الكروماتين طويلة المدى بين عناصر تسلسل الحمض النووي التنظيمية وغيرها.