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메지노믹 데이터의 생물학적 시퀀스를 분류하기 위해 딥 러닝을 사용하기 위한 비컴퓨터 전문가를 위한 가상 머신 플랫폼

JoVE Journal
Genetics
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JoVE Journal Genetics

A Virtual Machine Platform for Non-Computer Professionals for Using Deep Learning to Classify Biological Sequences of Metagenomic Data

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메지노믹 데이터의 생물학적 시퀀스를 분류하기 위해 딥 러닝을 사용하기 위한 비컴퓨터 전문가를 위한 가상 머신 플랫폼

DOI:

10.3791/62250-v

•

09:34 min

•

September 25, 2021

•

Zhencheng Fang², Hongwei Zhou³

¹Microbiome Medicine Center, Department of Laboratory Medicine, Zhujiang Hospital,Southern Medical University, ²Center for Quantitative Biology,Peking University, ³State Key Laboratory of Organ Failure Research,Southern Medical University

Chapters

00:07Introduction
01:35The Installation of the Virtual Machine
04:11Create Shared Folders and Prepare the Files for the Training Set and Test Set
06:55Digitize the Biological Sequences Using “One‐Shot” Encoding Form
07:27Train and Test the Artificial Neural Network
08:12Result
08:52Conclusion

Summary

Automatic Translation

이 자습서는 메타게노믹 데이터의 2클래스 시퀀스 분류를 수행하기 위한 딥 러닝 알고리즘을 구성하는 간단한 방법을 설명합니다.

Tags

Virtual Machine Deep Learning Biological Sequence Classification Metagenomic Data Species Classification Gene Function Classification Host Classification Deep Learning Framework Sequence Classification VirtualBox Ubuntu

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