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定量染色体立体構造捕捉による胚体におけるエンハンサー・プロモーター接触の同定(4C)

JoVE Journal
Genetics

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Identification of Enhancer-Promoter Contacts in Embryoid Bodies by Quantitative Chromosome Conformation Capture (4C)

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定量染色体立体構造捕捉による胚体におけるエンハンサー・プロモーター接触の同定(4C)

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10:02 min

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April 29, 2020

DOI:

10.3791/60960-v

DOI:

10.3791/60960-v

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10:02 min

April 29, 2020

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Tian V. Tian^1,2,3, Enrique Vidal^1,2, Thomas Graf^1,2, Grégoire Stik^1,2

¹Center for Genomic Regulation (CRG),The Barcelona Institute of Science and Technology, ²Universitat Pompeu Fabra, ³Vall d’Hebron Institute of Oncology

Summary

我々は、胚性幹細胞から生成された胚体における高スループットシーケンシングに続く定量染色体立体構造捕捉の適用を報告する。この技術は、胚性幹細胞分化中に所定の遺伝子の推定エンハンサーとプロモーター領域との接触を同定し、定量することを可能にする。

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4C Chromosome Conformation Capture Enhancer-promoter Contacts Embryoid Bodies Mouse Embryonic Stem Cells Gene Regulation Cis-regulatory Elements Chromatin Interactions Cell Culture Cell Differentiation

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