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Kombination von Laser Capture Microdissection und Microfluidic qPCR zur Analyse von Transkriptionsprofilen einzelner Zellen: Ein systembiologischer Ansatz zur Opioidabhängigkeit
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Combining Laser Capture Microdissection and Microfluidic qPCR to Analyze Transcriptional Profiles of Single Cells: A Systems Biology Approach to Opioid Dependence
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Kombination von Laser Capture Microdissection und Microfluidic qPCR zur Analyse von Transkriptionsprofilen einzelner Zellen: Ein systembiologischer Ansatz zur Opioidabhängigkeit

Deutsch

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09:54 min

•

March 08, 2020

DOI:

10.3791/60612-v

DOI:
10.3791/60612-v

•

09:54 min
March 08, 2020

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3 Views
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1Daniel Baugh Institute for Functional Genomics and Computational Biology, Department of Pathology, Anatomy, and Cell Biology,Thomas Jefferson University, 2Sidney Kimmel Medical College,Thomas Jefferson University, 3Department of Pharmacology & Physiology,Drexel University College of Medicine

Summary

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Dieses Protokoll erklärt, wie einzelne Neuronen, Mikroglia und Astrozyten aus dem zentralen Kern der Amygdala mit hoher Genauigkeit und anatomischer Spezifität mit Laser-Capture-Mikrodissektion zu sammeln. Darüber hinaus erklären wir unsere Verwendung von mikrofluidischem RT-qPCR, um eine Teilmenge des Transkriptoms dieser Zellen zu messen.

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Laser Capture MicrodissectionMicrofluidic QPCRTranscriptional ProfilesSingle CellsSystems BiologyOpioid DependenceGene ExpressionCellular SubphenotypesAnatomic SpecificityBiological ProblemsNeuronsBrain RegionsAmygdalaEthanol DehydrationXyleneFluorescenceLCM SoftwareInfrared Laser

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O'Sullivan, S. J., Reyes, B. A., Vadigepalli, R., Van Bockstaele, E. J., Schwaber, J. S. Combining Laser Capture Microdissection and Microfluidic qPCR to Analyze Transcriptional Profiles of Single Cells: A Systems Biology Approach to Opioid Dependence. J. Vis. Exp. (157), e60612, doi:10.3791/60612 (2020).

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