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HOX Loci Focused CRISPR/SgRNA Bibliothek Screening identifizieren kritische CTCF Grenzen
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HOX Loci Focused CRISPR/sgRNA Library Screening Identifying Critical CTCF Boundaries
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HOX Loci Focused CRISPR/SgRNA Bibliothek Screening identifizieren kritische CTCF Grenzen

Deutsch

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8,047 Views

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10:10 min

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March 31, 2019

DOI:

10.3791/59382-v

DOI:
10.3791/59382-v

•

10:10 min
March 31, 2019

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1Department of Pediatrics,Pennsylvania State University College of Medicine, 2Department of Physiological Sciences,University of Florida, 3Department of Anatomy and Cell Biology,University of Florida

Summary

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Eine CRISPR/SgRNA-Bibliothek wurde zur Vernehmung Protein-kodierenden Gene angewandt. Die Machbarkeit einer SgRNA Bibliothek um die Funktion einer CTCF Grenze in Genregulation zu entdecken bleibt jedoch unerforscht. Hier beschreiben wir eine HOX Loci spezifische SgRNA Bibliothek um die Funktion von CTCF Grenzen in HOX Loci zu erhellen.

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CRISPR/sgRNA LibraryCTCF BoundariesHOX Gene RegulationPooled SgRNA ScreeningLentiviral TransductionMOLM13 CellsPuromycin SelectionMOI OptimizationNoncoding Regulatory Elements

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Luo, H., Sobh, A., Vulpe, C. D., Brewer, E., Dovat, S., Qiu, Y., Huang, S. HOX Loci Focused CRISPR/sgRNA Library Screening Identifying Critical CTCF Boundaries. J. Vis. Exp. (145), e59382, doi:10.3791/59382 (2019).

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