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PDGFRα + 低細胞クロマチン免疫沈降塩基配列解析法による細胞を精製した急性の転写因子 Olig2 ゲノム結合部位の特定
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Identifying Transcription Factor Olig2 Genomic Binding Sites in Acutely Purified PDGFRα+ Cells by Low-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Analysis
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PDGFRα + 低細胞クロマチン免疫沈降塩基配列解析法による細胞を精製した急性の転写因子 Olig2 ゲノム結合部位の特定

日本語

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12:29 min

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April 16, 2018

DOI:

10.3791/57547-v

DOI:
10.3791/57547-v

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12:29 min
April 16, 2018

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1The Vivian L. Smith Department of Neurosurgery, Center for Stem Cell and Regenerative Medicine,University of Texas Health Science Center

Summary

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低細胞クロマチン免疫沈降 (チップ) を実行することによってゲノム内でバインド オリゴデンドロ サイトのトランスクリプション要因 2 の (Olig2) 鋭く精製脳オリゴデンドロ サイト前駆細胞 (Opc) を分析するように設計されたプロトコルを紹介します。、ライブラリの準備、高スループット シーケンスおよびバイオインフォマティクス データ解析。

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Transcription Factor Olig2PDGFR-α+ CellsChIP-seqLow-cell ChIP-seqOligodendrocyte Precursor CellsImmunopanningGenome-wide Transcriptional RegulationEpigenetic MechanismsCell DifferentiationCell Development

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Dong, X., Cuevas-Diaz Duran, R., You, Y., Wu, J. Q. Identifying Transcription Factor Olig2 Genomic Binding Sites in Acutely Purified PDGFRα+ Cells by Low-cell Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Analysis. J. Vis. Exp. (134), e57547, doi:10.3791/57547 (2018).

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