Kapillar isoelektrisk fokusering er en antistof-baseret, ultrasensitive, høje overførselshastighed teknik, muliggør detaljeret karakterisering af proteiner og deres isoformer fra ekstremt lille biologiske prøver. I det følgende beskrives en protokol til påvisning og kvantificering af specifikke proteiner og deres isoformer i en automatiseret og robotiserede måde.