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September 26, 2011
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検出限界（50〜75コピー/ ml）以下のウイルス量の個体から血漿とクエンシングにおけるHIV - 1 RNAのレベルを定量シングルHIV - 1ゲノムは困難です。ここでは、確実に0.3コピー/ mLにHIV - 1 RNAを測定すると非常に低いウイルス量の試料から、単一のゲノムの配列決定によってウイルスゲノムを増幅する方法を、リアルタイムPCRアッセイを用いて血漿中ウイルスRNAを抽出し、定量化する方法について説明します。
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AmplifyingQuantifyingHIV-1 RNAViral LoadsLimit Of DetectionStandard Clinical AssaysViral GenesInsightViral DynamicsVirus Host InteractionsPatientsNatural ControlCombination Antiretroviral Therapy (cART)Single Genome Sequencing (SGS Protocol)Single-copy Assay (SCA Protocol)Real-time PCR AssaySensitivityVolume Of PlasmaRNA Copy NumberInternal Control TestingDNA ContaminationTriplicate MeasurementsSingle-genome Sequencing Assay (SGS)Non-labor IntensiveLimiting Dilution AssayEndpoint Diluted CDNA Product
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Mens, H., Kearney, M., Wiegand, A., Spindler, J., Maldarelli, F., Mellors, J. W., Coffin, J. M. Amplifying and Quantifying HIV-1 RNA in HIV Infected Individuals with Viral Loads Below the Limit of Detection by Standard Clinical Assays. J. Vis. Exp. (55), e2960, doi:10.3791/2960 (2011).
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