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Une méthode rapide et Quantitative pour Modification post-traductionnelle et variante compatible cartographie des Peptides aux génomes
1Department of Neurobiology, F. M. Kirby Neurobiology Center,Boston Children’s Hospital, Harvard Medical School, 2Proteomic Mass Spectrometry,Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Genome Campus, 3Centre for Molecular Informatics, Department of Chemistry,University of Cambridge, 4Functional Proteomics Group, Chester Beatty Laboratories,Institute of Cancer Research
Bölümler
- 00:05Başlık
- 00:51Mapping of Peptides using PoGoGUI
- 02:36Visualizing in the Integrative Genomics Viewer
- 03:57Mapping Peptides Identified Through a Custom Variant Database to a Reference Genome
- 04:44Mapping Peptides from Multiple Files Using PoGoGUI
- 05:48Generating a Track Hub from Mapped Peptides and Visualizing a Track Hub in the UCSC Genome Browser
- 06:50Results: Post-translational Modification and Varient Enabled Mapping of Peptides to Genomes
- 08:21Conclusion
Nous présentons ici l’outil proteogenomic PoGo et protocoles de modification poteau-de translation, quantitative, rapide et variante a permis la cartographie des peptides identifiés par le biais de la spectrométrie de masse sur les génomes de référence. Cet outil est utile pour intégrer et visualiser des proteogenomic et des études protéomiques personnelle s’interfaçant avec des données de génomique orthogonale.
