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Promotore cattura Ciao-c: Ad alta risoluzione, Genome-wide profilatura delle interazioni del promotore
1Nuclear Dynamics Programme, The Babraham Institute,Babraham Research Campus, 2IJC Building, Campus ICO-Germans Trias i Pujol,Josep Carreras Leukemia Research Institute, 3Departamento de Genética Molecular, Instituto de Fisiología Celular,Universidad Nacional Autónoma de México, 4Bioinformatics Group, The Babraham Institute,Babraham Research Campus, 5Department of Biological Science,Florida State University
Bölümler
- 00:04Başlık
- 00:52Formaldehyde Fixation
- 02:14HindIII Digestion and Biotinylation of Restriction Fragment Overhangs
- 04:09Hybrid In-solution Capture
- 06:53Isolation of Promoter Fragment-containing Ligation Products
- 08:55Results: IL8 PCHi-C Profile in Human Hematopoietic Cells
- 09:34Conclusion
Elementi regolatori del DNA, come rinforzatori, controllano l'espressione genica contattando fisicamente i promotori di geni bersaglio, spesso attraverso interazioni a lungo raggio cromosomiche, che coprono grandi distanze genomiche. Promotore Capture Hi-C (PCHi-C) identifica interazioni significative tra promotori e regioni distali, che consente l'assegnazione di potenziali sequenze regolatrici a loro geni bersaglio.
