В эукариотической клетке, митохондрия и пластиды, категория органелл растительных клеток, включая хлоропласты, самостоятельно размножаются в цитоплазме и у каждой из них есть свой набор генов, который направляет их воспроизведение и функции. Митохондриальная и пластидная ДНК принимает форму малых, круглых молекул ДНК и называется неядерной или цитоплазматической ДНК. Каждая органелла несёт много идентичных копий её ДНК, в отличие от ядра, где обычно только две копии каждой хромосомы.Далее, во время деления клетки, органеллы случайным образом сегрегированы в новую дочернюю клетку, таким образом, неядерная ДНК, которая передаётся дальше не соответствует заданной схеме. При воспроизведении у животных и большинства растений, цитоплазма в зиготе происходит из яйца. Таким образом, в то время как оба родителя вносят вклад на равных для ядерной ДНК, не-ядерная ДНК передаётся только от матери.Это означает, что определенные черты, такие как нарушения обмена веществ в результате мутаций в митохондрии, прослеживаются по материнской линии. Кроме того, некоторые физические характеристики в растениях, такие как цвет листьев, контролируется неядерными генами, а также передаются только от одного родителя.