Мы демонстрируем среднепроизводительный метод количественного определения афлатоксинов и стильбеноидных фитоалексинов в одиночных семенах арахиса с использованием ультраэффективной жидкостной хроматографии. Этот метод был специально разработан для анализа диких видов арахисов , которым угрожает афлатоксигенный вид Aspergillus .
Афлатоксины являются высококанцерогенными вторичными метаболитами некоторых видов грибов, в частности Aspergillus flavus. Афлатоксины часто загрязняют экономически важные сельскохозяйственные товары, включая арахис, представляя высокий риск для здоровья человека и животных. Из-за узкой генетической базы сорта арахиса демонстрируют ограниченную устойчивость к грибковым патогенам. Таким образом, многочисленные виды дикого арахиса с устойчивостью к аспергилляциям получили значительное внимание ученых в качестве источников устойчивости к болезням.
Изучение устойчивости зародышевой плазмы растений к афлатоксинам затруднено, поскольку накопление афлатоксина не имеет нормального распределения, что диктует необходимость анализа тысяч отдельных семян арахиса. Достаточно увлажненные семена арахиса (Arachis spp.) при заражении видами Aspergillus способны продуцировать биологически активные стильбены (стильбеноиды), которые считаются защитными фитоалексинами. Стильбены арахиса подавляют развитие грибков и выработку афлатоксина. Поэтому крайне важно проанализировать те же семена на стильбеноиды арахиса, чтобы объяснить природу устойчивости/восприимчивости семян к инвазии аспергилл. Ни один из опубликованных методов не предлагает анализ на афлатоксины и/или фитоалексины стильбена.
Мы постарались удовлетворить спрос на такой метод, который был бы экологически чистым, использовал недорогие расходные материалы, был бы чувствительным и избирательным. Кроме того, этот метод является неразрушающим, поскольку он использует только половину семени, а другую половину, содержащую эмбриональную ось, оставляет нетронутой. Такой метод позволяет проращивать и выращивать растение арахиса до полной зрелости из тех же семян, которые использовались для анализа афлатоксина и стильбеноидов. Неотъемлемая часть этого метода, ручная протравливание семян с помощью Aspergillus, является ограничивающим этапом, который требует больше времени и труда по сравнению с другими этапами метода. Этот метод был использован для исследования зародышевой плазмы дикого арахиса с целью идентификации видов, устойчивых к Aspergillus , а также для определения и характеристики новых источников генетической устойчивости к этому грибковому патогену.
Арахис (Arachis hypogaea L.) является одной из основных продовольственных культур в мире. Его культивируют более чем в 100 странах мира с общим объемом производства более 45 миллионовтонн1. Сельскохозяйственные товары, такие как арахис, кукуруза и семена хлопчатника, часто подвергаются вторжению видов Aspergillus, почвенных грибов, которые продуцируют афлатоксины2. Эти товары особенно восприимчивы к загрязнению афлатоксином перед сбором урожая, когда условия окружающей среды характеризуются высокими температурами и засухой. Афлатоксины относятся к числу самых мощных канцерогенов из известных3. Они загрязняют четверть сельскохозяйственной продукциив мире4, в результате чего около половины населения мира хронически подвергается воздействию афлатоксинов5. Из-за их высокой канцерогенности и токсичности присутствие афлатоксинов в продуктах питания регулируется на минимально практически допустимых уровнях в большинстве стран мира6.
Европейский союз (ЕС) законодательно установил максимальный уровень афлатоксинаВ1 в 2 нг/г и 4 нг/г общего содержания афлатоксинов (В1,В2, G1 и G2) в продуктах для потребления человеком7. Такие низкие лимиты оказывают существенное давление на сельское хозяйство и пищевую промышленность, которые перерабатывают товары, загрязненные афлатоксинами. Мониторинг афлатоксина и переработка зараженного арахиса можно рассматривать как пассивную и дорогостоящую стратегию предотвращения попадания афлатоксинов в пищевую цепь. Именно поэтому все основные сегменты арахисовой промышленности испытывают огромные потери прибыли из-за загрязнения афлатоксинами современных сортов арахиса, которые часто демонстрируют ограниченную устойчивость к грибковым заболеваниям. Перспективным подходом к решению проблемы афлатоксина является получение устойчивых к грибку сортов арахиса путем генной интрогрессии, то есть передачи генетической информации от устойчивых диких видов арахиса к элитным сортам. В последние годы 8,9 дикие виды арахиса стали широко рассматриваться в качестве источников генетической устойчивости к болезням, поскольку узкая генетическая база культивируемого арахиса больше не может обеспечить необходимый уровень устойчивости к растению арахиса10,11. Успешная интрогрессия диких видов арахиса требует анализа тысяч отдельных мелких и редких семян (Рисунок 1А) 12.
Рисунок 1: Блок-схема анализа одного семени. (A) Сравнительный размер различных сортов арахиса рыночного типа по сравнению с диким Arachis spp. (1) Вирджиния; (2) бегунок; (3) Испанский; (4) дикий Arachis spp. (B) дикий Arachis spp. (пластина А, семя 4) разрезанный на три части, (5) полусеменной с зародышевой осью; эта часть семян используется для выращивания растения (E). (C) Детали (6) и (7) просверливаются сверлом и (D) инокулируются спорами грибов. После инкубации в течение 72 часов при 30 °C одну из частей семени, (6) или (7), используют для анализа афлатоксина и фитоалексина, а другую используют для секвенирования РНК/транскриптома. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
Устойчивость арахиса к грибковым патогенам тесно связана с фитоалексинами 13,14,15,16,17. Фитоалексины арахиса представлены антимикробными стильбеноидами, которые биосинтезируются и накапливаются в тканях растений после воздействия экзогенных раздражителей, в частности, грибковой инвазии 16,17,18. Быстрое накопление достаточных концентраций фитоалексинов в месте грибковой инвазии ингибирует рост грибов и имеет решающее значение для защиты растений 19,20,21. Возбудитель прекращает рост при накоплении фитоалексинов до ингибирующих концентраций16,22. Роль стильбеноидов в качестве защитных соединений против афлатоксигенных грибов арахиса была оценена более 30 лет назад в полевых экспериментах13. Эти эксперименты ясно подтвердили гипотезу о том, что стильбеноиды арахиса являются решающим фактором устойчивости к загрязнению афлатоксином перед сбором урожая. Такие доказательства основаны на фактах того, что стильбены естественным образом образуются в поврежденном полями арахисе; стильбены проявляют заметную биологическую активность в отношении афлатококсигенных грибов; А загрязнение афлатоксинами семян было обнаружено только тогда, когда арахис потерял способность к синтезу фитоалексина из-за обезвоживания семян, вызванного засухой. Еще одна серия полевых экспериментов подтвердила связь между продукцией фитоалексина и устойчивостью генотипа арахиса к сельскохозяйственным заболеваниям арахиса17.
Лучшее понимание основанного на фитоалексине механизма устойчивости арахиса к грибковой инвазии является перспективной стратегией для борьбы с загрязнением афлатоксином 15,17.Поэтому, помимо анализов на афлатоксины, важно количественно проанализировать те же семена на фитоалексины. Хотя этот механизм устойчивости до конца не изучен и понят, тем не менее, он имеет решающее значение для селекции и генетической модификации растений арахиса для новых сортов, устойчивых к грибкам. Несмотря на существование различных аналитических процедур для определения афлатоксина в различных товарах, все еще существует потребность в простых методах для конкретных исследований, особенно в тех случаях, когда традиционные методы не удовлетворяют аналитическим и экономически эффективным требованиям. Наиболее современными методами очистки, используемыми в арахисовой промышленности, сельском хозяйстве и частных лабораториях, являются устройства на основе антител24 и иммуноферментные анализы 25,26,27. Они селективны и чувствительны, но значительно дороже миниколонок, наполненных обычными адсорбентами. Кроме того, ни один из этих методов не был разработан для анализа образцов весом в несколько миллиграммов. Основываясь на наших предыдущих исследованиях по аналитическому использованию миниколонок28, упакованных в силикагель магния (Флорисил), мы модифицировали эту процедуру в соответствии с потребностями текущих и перспективных программ предварительного разведения и разведения.
Целью данной работы явилась разработка неразрушающего, среднепроизводительного, экологически чистого метода количественного определения афлатоксинов и фитоалексинов в отдельных семенах арахиса. Такой метод уже разработан. Его преимущества перед опубликованными методами заключаются в более высокой чувствительности, возможности анализа афлатоксинов и фитоалексинов в экстракте одного семени, отсутствии необходимости взвешивать образцы и более низкой стоимости благодаря меньшим объемам расходных материалов. Блок-схема интегрированного метода представлена на рисунке 1. Генетический анализ и другие этапы упоминаются в этом тексте и показаны на рисунке, чтобы показать важность предлагаемого метода и то, как он интегрирован со всей процедурой.
Основываясь на нашемпредыдущем опыте, мы разработали простую, недорогую, экологически чистую, химическую процедуру, подходящую для исследования коллекций зародышевой плазмы дикого арахиса с целью идентификации видов, устойчивых к Aspergillus , а также для определения и характеристики новых источников генетической устойчивости к этому условно-патогенному грибу. Этот метод основан на очистке экстракта семян методом твердофазной экстракции (SPE) и количественном определении афлатоксина с помощью Ultra Performance Liquid Chromatography (UPLC) и характеризуется достаточно высоким извлечением, прецизионностью и аккуратностью. Предложенный метод «Флорисил» представляет собой модификацию процедуры очистки одной миниколонки, основанной на уникальном свойстве флоризила (силикагель магния) сильно и избирательно удерживать афлатоксины28. Как и в оригинальном методе, образцы семян экстрагировали смесью MeOH-H2O, но в другой пропорции 90:10 (v/v) по сравнению с опубликованными 80:20 (v/v). Это изменение увеличило скорость потока растворителей через очистительную колонну до 2,5 раз при той же скорости восстановления афлатоксина. Эта смесь метанола и воды в соотношении 90:10 (v/v) обеспечила почти 100% извлечение афлатоксинов стандартовB1, B2,G1 иG2 , добавленных в экстракционный растворитель при пиковых концентрациях, эквивалентных 5-50 нг концентраций афлатоксина в 1 г субстрата, а также обеспечила достаточно высокие извлечения из образцов семян арахиса с шипами (Таблица 1).
Показано, что афлатоксины могут быть элюированы из адсорбента Флоризил только большими объемами ацетона30, ацетона-метанола31,32 и ацетон-водных смесей 33,34,35,36. В ходе настоящего исследования было обнаружено, что подкисленный ацетонитрил ведет себя аналогично ацетону в своей способности вымывать афлатоксины из флорисила. Насколько нам известно, об этом свойстве ацетонитрила в литературе не сообщалось. Открытие этого свойства позволяет вводить очищенный экстракт непосредственно в систему УПЛК, минуя стадию испарения растворителя, что существенно сокращает время приготовления. Даже когда ацетонитрил смешивали с ацетоном (ацетон-ацетонитрил-вода-88% муравьиной кислоты (65:31:3.5:0,5, v/v)), он обеспечивал плавное, полное и быстрое удаление воды из очищенных элюатов, значительно сокращая время испарения растворителя. Присутствие ацетонитрила позволило использовать смесь одного растворителя, метанола и воды (90:10, v/v) для эффективного удаления примесей из колонки Флорисила по сравнению с опубликованным методом, где требовались два дополнительных промывочных растворителя, метанол и смесь хлороформа-метанола. 28
В среднем, стандартное восстановление афлатоксинаВ1 составило ~98% при использовании 1,2 мл для элюирования афлатоксинов. Количество 50 мг Флорисила подбирали таким образом, чтобы 1,2 мл элюирующего растворителя заполняли миниколонку до верха бочки и, в то же время, обеспечивали удовлетворительное извлечение (табл. 1). Такой подход ускоряет процедуру очистки, так как бочку колонны необходимо заполнить только один раз. На ранних стадиях этого проекта было неясно, будет ли подходить коммерческая фракция Florisil с относительно большим размером частиц, 100-200 меш, для небольшой колонны, содержащей всего 3-миллиметровый слой адсорбента. Поэтому мы исследовали различные фракции Флорисила, полученные из коммерческого продукта размером 100-200 меш, используя США стандартные тестовые сита 120-140, 140-170, 170-200, 200-270, 270-400 и >400 меш. Все эти фракции обеспечили воспроизводимые, почти совпадающие результаты с удовлетворительным извлечением. Несмотря на то, что фракции меньшего размера частиц демонстрировали более узкие полосы афлатоксина в колонке под действием ультрафиолетового излучения, эти фракции не превосходили их в любом отношении по сравнению с коммерческим продуктом размером 100-200 меш. Кроме того, фракция 100-200 меш продемонстрировала самое короткое время элюирования (8-12 мин) за всю процедуру.
Градиентная подача растворителя UPLC позволила обеспечить удовлетворительное отделение афлатоксинов, а также полное удаление неполярных примесей из колонки (рис. 5G). Такой подход привел к безупречной работе колонны и воспроизводимым результатам анализов сотен образцов. Идентичность афлатоксинов, элюированных из колонки Флорисила, была подтверждена так, как описано ранее. 28 Использованная здесь аналитическая колонка UPLC диаметром 3 мм продемонстрировала более высокую селективность и более надежное разделение афлатоксинов B1, B2, G1 и G2 в более высоких концентрациях по сравнению с колонкой диаметром 2,1 мм того же химического состава. Более того, долговечность 3-миллиметровой колонки (более 1200 инъекций) была значительно выше, чем у 2,1-мм колонки (до 800 инъекций). Несмотря на то, что колонна диаметром 3 мм требовала более высокой скорости подвижной фазы (на 40% больше), этот недостаток был перекрыт вышеуказанными преимуществами колонны.
Миниколонка Florisil была эффективна для очистки экстрактов семян арахиса, сильно загрязненных метаболитами Aspergillus (рис. 5G); Такие семена также содержали высокий уровень стильбеноидных фитоалексинов, которые вырабатывались семенами в ответ на грибковое вторжение. Концентрация афлатоксина в семенах может превышать концентрацию афлатоксина в семенах до 10в 6 раз22, что делает эти семена сложными объектами для анализа афлатоксинов. На рисунке 5G показано отсутствие мешающих пиков на хроматограмме в течение времени удержания афлатоксина, что сделало обнаружение и количественное определение афлатоксина бескомпромиссным на всех испытуемых уровнях (Таблица 1). Как видно из таблицы 1, точность и прецизионность метода были достаточно высокими в пределах исследуемого диапазона 1,0-50,0 нг/г, который также является наиболее критическим диапазоном для обнаружения афлатоксина. Восстановление на разных уровнях для различных генотипов дикого арахиса было равномерным, а стандартные отклонения для пяти различных экстракций были в основном низкими.
Метод также был протестирован на семенах арахиса, хлопка, кукурузы и риса, загрязненных естественным образом от нуля до чрезвычайно высоких уровней – более 10 000 нг/г общего афлатоксина. Извлечение афлатоксиновВ1,В2, Г1 иГ2 из кукурузы, хлопчатника и риса в концентрации 5 нг/г варьировало от 76,1% до 93,7%, от 77,1% до 86,6% и от 90,5% до 96,2% соответственно. Высочайшее восстановление афлатоксинов из риса сопровождалось «чистотой» элюента, то есть практически отсутствием каких-либо примесей. Кроме того, рис представлял собой самый маленький из протестированных объектов, в среднем 19 мг/семя.
Общее время подготовки одного зернышка арахиса (включая шелушение, взвешивание, экстракцию, центрифугирование и очистку) с использованием колонки Florisil не превышало 20 минут. Стоимость миниколонки Florisil в >10 раз меньше, чем у коммерческих колонок для очистки. Дополнительная экономия достигается за счет использования меньших объемов адсорбентов, растворителей и газообразного азота по сравнению с опубликованной методикой28. Миниколонка не требует для работы насосных или вакуумных устройств и имеет неограниченный срок годности.
Изучение устойчивости зародышевой плазмы растений к афлатоксинам исключительно затруднено, поскольку накопление микотоксинов не следует нормальному распределению37,38; Для преодоления этого явления необходимо большое количество анализов афлатоксина в отдельных семенах. В дополнение к содержанию афлатоксина, информация о количественном составе фитоалексина очень ценна в свете большого объема информации, которая может быть получена из одного семени (рисунок 1A) и отслежена до конкретного растения (рисунок 1E). Этот метод был успешно использован для скрининга сотен образцов, включая местные сорта, передовые селекционные линии и элитные сорта арахиса. Метод предлагается для использования в программах исследований по предварительному разведению и селекции арахиса и может помочь в характеристике генов арахиса на устойчивость к грибкам.
The authors have nothing to disclose.
Данная работа получила финансовую поддержку проекта USDA-ARS CRIS 6044-42000-011-00D и проекта CRIS 6044-21000-005-000-D. Мы благодарим Дэна Тодда за создание стеллажа для миниколонн. Упоминание торговых наименований или коммерческих продуктов в этой статье осуществляется исключительно с целью предоставления конкретной информации и не подразумевает рекомендации или одобрения со стороны Министерства сельского хозяйства США.
Acetone, Optima | Fisher Scientific | A929-4 | |
Acetonitrile, Optima | Fisher Scientific | A996-4 | |
Acquity BEH C18 2.1 x 5mm Van-Guard pre-column | Waters Corporation | 186003975 | |
Acquity BEH C18 3 x 100mm column | Waters Corporation | 186004661 | |
Acquity BEH C18 2.1 x 100mm column | Waters Corporation | 186002352 | |
Aflatoxins B1, B2, G1, and G2 | Sigma-Aldrich | A9441-1VL | Dissolve the contents of the commercial vial in 5 mL of methanol to obtain 5 µg/mL for aflatoxins B1 and G1 and 1.5 µg/mL for B2 and G2 |
Aflatoxin B1 (1mg) | Sigma-Aldrich | A6636-1MG | |
Aflatoxin B2 (1mg) | Sigma-Aldrich | A9887-1MG | |
Aflatoxin G1 (1mg) | Sigma-Aldrich | A0138-1MG | |
Aflatoxin G2 (1mg) | Sigma-Aldrich | A0263-1MG | |
Aflatoxin M1 (10 µg) | Sigma-Aldrich | CRM46319 | |
Agar, Granulated (2kg) | Becton Dickinson | BD214510 | |
Alumina oxide basic (60-325 mesh) | Fisher Scientific | A941-500 | |
Basal medium | Murashige and Skoog | M5519 | |
Bead Ruptor 24 | Omni International | 19-042E | |
Beaker (1000mL) | Corning (Pyrex) | 10001L | |
Beaker (250mL) | Corning (Pyrex) | 1000250 | |
Beaker (400mL) | Corning (Pyrex) | 1000400 | |
Beaker (600mL) | Corning (Pyrex) | 1000600 | |
Blade, scalpel | Feather | #10 | |
Centrifuge (LSE Compact) | Corning | Model: 6755 | |
Centrifuge, micro | Corning | Model: 6770 | |
Ceramic beads (2.8 mm) | Omni International | 19-646 | |
Ceramic beads (6.5 mm) | Omni International | 19-682 | |
Chromeleon 7 series Software | Thermo Scientific | ||
Drill bit | Kyocera | 07896 | 1.6 mm |
Drill bit | Kyocera | 07357 | 2.0 mm |
Drill bit | Kyocera | 07985 | 2.34 mm |
Ethanol (200 proof) | Decon Labs | 2805M | |
Evaporator, nitrogen | organimation | 11106 | 6-position |
Excel, Microsoft | Microsoft | Office 365 | |
Filter paper (#4) | Cytiva Whatman | 1004-090 | |
Filter paper cutter, stainless steel (ID 11.5mm) | Unknown | ||
Filter paper, glass fibre | Cytiva Whatman | 934-AH | |
Flask (2800mL) | Corning (Pyrex) | 44202XL | |
Florisil (100-200 mesh) | Fisher Scientific | F101-500 | |
Forceps | Integra Lifescience (Miltex) | PM-0300 | |
Formic acid (88%, ACS) | Fisher Scientific | A118P-500 | |
Freezer (-80oC) | Fisher Scientific | TSX70086D | |
Funnel (15 x 80mm) | DWK Life Sciences (Kimax) | 2902060 | |
Gelzan (medium) | Caisson Labs | G024 | |
Glass rod (custom) | Custom made | ||
Glass wool | Corning (Pyrex) | 3950 | |
Handle, scalpel | Feather | #7 | |
Hemocytometer | Hausser Scientific | 3100 | |
Hydrogen peroxide | Fisher Scientific | H325-4 | 30%, Certified ACS |
Ice bucket, round with lid | Corning | 432122 | |
Incubator | Percival | 136VL | |
Kimtech SCIENCE Brand Kimwipes | Kimtech | 34120 | 8.2" x 4.39" |
Kimtech SCIENCE Brand Kimwipes | Kimtech | 34256 | 16.4" x 14.43" |
Lab coat | Cenmed | B113660SBXL | |
Methanol, Optima | Fisher Scientific | A454-4 | |
Mini column rack (custom) | Custom made | ||
Mixer, touch (maxi mix II) | Thermolyne | 37600 (model 231) | |
Nitrile gloves | Microflex | XC310M | |
Nitrogen gas, compressed (ultra high purity) | Jones Welding | ||
Paper towel | Georgia-Pacific | 20023 (D400) | |
pH meter | Fisher Scientific (Accumet) | 13-636-AB15 | |
pH/ATC electrode | Fisher Scientific (Accumet) | 13-620-111 | |
PhCR Photochemical Reactor | Waters (Vicam) | 600001222 | |
Pipette, pasteur | Fisher Scientific | 13-678-20D | 9" |
Pipettor (1 mL) (Reference 2) | Eppendorf | 4924000088 | |
Pipettor (10 μL) (Reference) | Eppendorf | 022470051D | |
Pipette tips: 10 μL, 200 μL, 1 mL | Eppendorf | F144054M | |
Pipettor (200 µL)(Ergofit) | Fisher Scientific | 12-146-679 | |
Plates, petri (100x15mm) | Fisher Scientific | FB0875713 | |
Potato Dextrose Agar (500g) | Becton Dickinson | BD213400 | |
Reinforced bead tube (2 mL) | Omni International | 19-660 | |
Reinforced bead tube (7 mL) | Omni International | 19-651 | |
Repipettor, Dispensette III (10mL) | Brandtech | 4701141 | |
Resveratrol | Sigma-Aldrich | R5010-100MG | |
Scoop (custom) | Custom made | ||
screwcap jar (250 mL) | Corning (Pyrex) | 1395250 | |
Silica gel, spherical (200-400 mesh) | Supelco | 97727-U | 100 g |
Sodium Hydroxide | Fisher Scientific | S318-500 | |
SPE extract clean 1.5-mL polypropylene column | American Chromotography Supplies | SP-5122382 | |
SPE extract clean PP frits (for 1.5 mL minicolumn) | American Chromotography Supplies | SP-3119414 | |
Spectrophotometer, UV-visible | Fisher Scientific | 14-385-351 (Genesys 50) | |
Test tube | Corning (Pyrex) | 982516X | 16x125mm |
Test tube (Disposable)(16x125mm) | Fisher Scientific | 14-961-31 | |
Test tube (Disposable)(150x250mm) | Fisher Scientific | 14-961-34 | |
Thermo Vanquish DAD detector (UPLC) | Thermo Scientific | VF-D11-A-01 | |
Thermo Vanquish Fluourescense detector (UPLC) | Thermo Scientific | VF-D51-A | |
Thermo Vanquish quaternary pump F (UPLC) | Thermo Scientific | VF-P20-A | |
Thermo Vanquish Split Sampler FT (UPLC) | Thermo Scientific | VF-A10-A-02 | |
Tween 20 (polysorbate 20) (enzyme grade) | Fisher Scientific | BP337-500 | |
Vial caps (4mL) | Fisher Scientific | C4015-75A | |
Vial caps (autosampler) | Fisher Scientific | C4010-60A | |
Vials & caps (16 mL) | Thermo Scientific | B7800-4 | |
Vials, glass (4mL) | Fisher Scientific | C4015-1 | |
Vials, polypropylene (autosampler) (400mL) | Fisher Scientific | C4010-11 | |
Water, Optima | Fisher Scientific | W6-4 |