Os vírus da influenza A (IAVs) são patógenos respiratórios contagiosos que causam epidemias anuais e pandemias ocasionais. Aqui, nós descrevemos um protocolo para rastrear infecções virais in vivo usando uma novela recombinante luciferase e fluorescência-expressando o bi-repórter IAV (BIRFLU). Esta abordagem fornece aos pesquisadores uma excelente ferramenta para estudar IAV in vivo.
Vírus da gripe A (IAVs) causam doença respiratória humana que está associada a consequências económicas e de saúde significativas. Tal como com outros vírus, estudar IAV requer o uso de abordagens secundárias trabalhosas para detectar a presença do vírus em células infectadas e/ou em modelos animais de infecção. Essa limitação foi recentemente contornada com a geração de IAVs recombinantes expressando proteínas de repórter fluorescentes ou bioluminescentes (luciferase) facilmente rastreáveis. No entanto, os pesquisadores foram forçados a selecionar genes de repórter fluorescentes ou luciferases devido à capacidade restrita do genoma do IAV para incluir sequências estrangeiras. Para superar esta limitação, nós geramos uma replicação recombinante-o bi-repórter competente IAV (BIRFLU) que expressa estàvel um gene fluorescente e de um luciferase do repórter para controlar facilmente infecções de IAV in vitro e in vivo. Para tanto, os segmentos virais não estruturais (NS) e hemaglutinina (HA) viral da influenza A/Puerto Rico/8/34 H1N1 (PR8) foram modificados para codificar a Vênus fluorescente e as proteínas bioluminescentes da luciferase Nanoluc, respectivamente. Aqui, nós descrevemos o uso de BIRFLU em um modelo do rato da infecção de IAV e a deteção de ambos os genes do repórter usando um sistema in vivo da imagem latente. Notavelmente, observamos uma boa correlação entre as expressões de ambos os repórteres e a replicação viral. A combinação de técnicas de ponta em biologia molecular, pesquisa animal e tecnologias de imagem, fornece aos pesquisadores a oportunidade única de usar esta ferramenta para pesquisa de gripe, incluindo o estudo de interações vírus-hospedeiro e dinâmica de infecções virais. É importante ressaltar que a viabilidade de alterar geneticamente o genoma viral para expressar dois genes estrangeiros de diferentes segmentos virais abre oportunidades para usar essa abordagem para: (i) o desenvolvimento de novas vacinas IAV, (II) a geração de IAVs recombinantes que pode ser usado como vetores de vacinas para o tratamento de outras infecções do patógeno humano.
O vírus da gripe A (IAV) é um vírus de RNA segmentado de sentido negativo, de forma única e envolto,da família Orthomyxoviridae 1,2,3. A Organização Mundial da saúde (OMS) estima 3-5 milhões de casos anuais de gripe e mais de 250.000 mortes por influenza no mundo4,5,6. Os grupos que são particularmente vulneráveis à gripe incluem os idosos, os indivíduos imunocomprometidos e as crianças7,8,9,10,11. Embora as vacinas estejam disponíveis e representem a intervenção mais comum e efetiva contra a infecção viral, o IAV é capaz de evoluir rapidamente e escapar da imunidade preexistente3,12,13 , 14 anos de , 15. a re-emergência de uma cepa pandêmica de H1N1 em 2009 e o surgimento de IAV patogénico reitera a constante ameaça à saúde pública humana no mundo4,16.
Durante uma epidemia ou pandemia, é crucial determinar rapidamente a patogenicidade e a transmissibilidade de vírus recém-isolados. As técnicas atualmente disponíveis para detectar o vírus são demoradas e, às vezes, requerem o uso de abordagens laboriosas, o que pode atrasar a realização dessas análises17,18,19,20. Além disso, os ensaios virais atuais são difíceis de escalar acima, que poderiam ser necessários durante o evento de um Outbreak. Finalmente, o uso de modelos animais validados de infecção, como camundongos, cobaias e furões são usados rotineiramente e são vitais no estudo de infecções da gripe, respostas imunes, e a eficácia de novas vacinas e/ou antivirais. No entanto, esses modelos são restritivos devido à incapacidade de observar a dinâmica viral em tempo real; Isto limita os estudos à imagem latente de estática de infecções virais21,22,23,24,25. Os animais utilizados nesses ensaios também são eutanasiados para determinar a carga viral, aumentando assim o número de animais necessários para a conclusão desses estudos26. Para contornar todas essas limitações, muitos pesquisadores dependem do uso de IAVs de replicação-competente, de expressão de repórter recombinante, capazes de acelerar os ensaios virológicos e detectar a carga viral e a disseminação in vivo em tempo real26 ,27,28,29,30,31,32,33,34,35 ,36,37,38,39,40,41. Importante, estes iAVS repórter-expressando são capazes de replicar similarmente ao selvagem-tipo (WT) iAVS na cultura de pilha e em modelos animais da infecção33,42.
As proteínas fluorescentes e bioluminescentes são dois sistemas de repórter comumente utilizados por pesquisadores devido à sua sensibilidade, estabilidade e facilidade de uso. Além disso, há um tremendo apoio e avanço nas tecnologias de detecção de proteínas fluorescentes e bioluminescentes43,44,45,46,47,48 . As proteínas fluorescentes e a luciferase têm propriedades diferentes que lhes permitem brilhar, diferindo especificamente em como os Estados excitados são gerados e como a emitância é detectada43,44,45, 46,47,48. As proteínas fluorescentes são excitadas primeiramente absorvendo a energia, que é liberada subseqüentemente como a luz em um comprimento de onda diferente enquanto as moléculas diminuem a um estado de energia mais baixo43. Por outro lado, a bioluminescência é derivada de uma reação química exotérmica que envolve um substrato, oxigênio e, às vezes, ATP, a fim de produzir luz45. Devido às propriedades de variação destes dois tipos de proteínas do repórter, um talvez mais vantajoso do que o outro dependendo do estudo do interesse. Quando as proteínas fluorescentes forem amplamente utilizadas observar a localização celular28,41, seus sinais in vivo têm a intensidade inadequada e são obscurecidos frequentemente pelo autofluorescence em tecidos vivos49. Portanto, os pesquisadores confiam nas luciferases para avaliar a dinâmica viral em organismos vivos, embora as proteínas fluorescentes possam ser preferidas para estudos ex vivo50,51,52,53. Ao contrário das proteínas fluorescentes, as luciferases são mais convenientes para estudos in vivo e mais aplicáveis em abordagens não invasivas26,27,28,29,30 , 31 de dezembro , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 , 41 , 54. em última análise, com base no tipo de estudo, os investigadores devem escolher entre o uso de uma proteína de repórter fluorescente ou uma luciferase como a sua leitura, que submete o seu estudo a um trade-off de funcionalidades e sensibilidades, e severamente restringe a utilidade dos vírus do repórter recombinante. Além disso, há preocupações quanto à correlação entre a expressão de diferentes genes de repórter utilizando sistemas de fluorescência ou luciferase e replicação ou disseminação viral, o que pode comprometer a interpretação dos dados obtidos com repórter-expressando IAVs.
Nós superamos esta limitação gerando uma replicação recombinante-bi-repórter competente IAV (BIRFLU) que codifica para uma proteína fluorescente e uma luciferase no mesmo genoma viral55 (Figura 1). Aqui, nanoluc luciferase (nluc), uma proteína bioluminescente pequena e brilhante48, foi inserida a montante da seqüência de hemaglutinina (ha) no segmento de ha viral da influenza a/Puerto Rico/08/1934 H1N1 (PR8)24,33, 40,55,56,57. Além disso, Vênus, uma proteína fluorescente monomérica freqüentemente utilizada, foi inserida no segmento viral não estrutural (ns)32,33,36,41,55. Desde que o birflu codifica para genes do repórter fluorescente e do luciferase, o sinal da proteína do repórter pode ser usado como o leitura para determinar a replicação viral e a disseminação in vitro ou in vivo55. Informações adicionais sobre a geração e in vitro ou in vivo caracterização de BIRFLU pode ser encontrada em nossa recente publicação55. BIRFLU pode ser usado para testar a eficácia de medicamentos antivirais ou neutralizando anticorpos através de um novo ensaio de microneutralização à base de fluorescência e bioluminescente55. Além disso, BIRFLU pode igualmente ser usado para avaliar a dinâmica viral em um modelo do rato da infecção55. Neste manuscrito, nós descrevemos os procedimentos para caracterizar BIRFLU55 in vitro e como estudar a infecção do birflu nos ratos usando sistemas in vivo da imagem latente da luminescência para a deteção de nluc in vivo ou de Venus ex vivo.
A combinação de técnicas de ponta na biologia molecular, na pesquisa animal e nas tecnologias da imagem latente, traz a investigadores a oportunidade original de usar BIRFLU para a pesquisa de IAV, incluindo o estudo de interações do vírus-anfitrião, dinâmica da infecção viral; o desenvolvimento de novas abordagens vacinais para o tratamento terapêutico de infecções por IAV ou o uso potencial de IAV como um vetor de vacina para o tratamento de outras infecções patogênicos.
Os investigadores confiaram em vírus de expressão de repórter recombinante como ferramentas moleculares vitais para compreender e expandir sobre a compreensão atual da replicação viral e da patogénese26,27,28, 29. º , 30 anos de , 31 de dezembro , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 , 41 , 54. os genes de repórter mais comumente favorecidos são luciferases e proteínas fluorescentes, principalmente devido aos avanços tecnológicos em sua identificação, desenvolvimento de variantes melhoradas e detecção por tecnologias de imagem43 , 44 , 45 , 46 , 47 , 48. os vírus do repórter recombinante são frequentemente utilizados para acelerar os ensaios virológicos, estudar a dinâmica dos vírus in vitro e in vivo, e testar a eficácia de vacinas e abordagens terapêuticas atualmente aprovadas ou novas26, 27,28,29,30,31,32,33,34,35, 36,37,38,39,40, 41,54. Infelizmente, no caso do IAV, estudos passados limitaram-se à expressão de um único gene repórter, o que dificulta o tipo de estudo que poderia ser conduzido 26,27,28,29 , 30 anos de , 31 de dezembro , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 , 41 , 54. para evitar esta limitação, nós geramos uma replicação-competente bi-repórter IAV que expressa uma luciferase nluc e uma proteína fluorescente Venus (birflu).
Neste relato, descrevemos a caracterização in vitro de BIRFLU e as abordagens experimentais para o uso de BIRFLU para rastrear a infecção viral in vivo usando um modelo de camundongo de infecção por IAV. A expressão de BIRFLU nluc e de Venus correlacionou com os Titers virais. Além disso, BIRFLU permaneceu estável e continuou a expressar ambos os genes de repórter após ser recuperado dos pulmões de camundongos infectados. Esta abordagem oferece aos pesquisadores uma excelente oportunidade para estudar IAV em células cultivadas e em modelos animais, incluindo a identificação e desenvolvimento de novas alternativas terapêuticas para o tratamento de infecções por IAV.
Embora o BIRFLU tenha sido gerado usando a espinha dorsal de PR8, outro IAV recombinante usando o tipo diferente, o subtipo ou os backbones virais da tensão poderiam ser gerados usando a mesma aproximação experimental. Da mesma forma, neste relato descrevemos os procedimentos experimentais para o uso de BIRFLU em um modelo de camundongo do IAV. No entanto, BIRFLU poderia ser uma tecnologia valiosa para avaliar a infecção por IAV em outros modelos animais.
The authors have nothing to disclose.
A pesquisa sobre o vírus da gripe no laboratório de LM-S é parcialmente financiada pelo centro de excelência da gripe de Nova York (NYICE) (NIH 272201400005C), um membro dos centros de excelência do NIAID para o contrato de pesquisa e vigilância da gripe (CHERDEIROS) não. HHSN272201400005C (NYICE) e pelo departamento de defesa (DoD) peer revisado programa de pesquisa médica (PRMRP) conceder W81XWH-18-1-0460.
12-well Cell Culture Plate | Greiner Bio-one | 665102 | |
24-well Cell Culture Plate | Greiner Bio-one | 662160 | |
6-well Cell Culture Plate | Greiner Bio-one | 657160 | |
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Adobe Photoshop CS4 | Adobe | This software is used in 3.1.10 and 4.4.7 | |
Bovin Albumin solution (BA) | Sigma-Aldrich | A7409 | Store at 4° C |
Bovin Serum Albumin (BSA) | Sigma-Aldrich | A9647 | Store at 4 °C |
Cell Culture dishes 100mm | Greiner Bio-one | 664-160 | |
ChemiDoc MP Imaging System | BioRad | This instrument is used in 4.4.7 | |
Crystal Violet | Thermo Fisher Scientific | C581-100 | Store at Room temperature |
Dounce Tissue Grinders | Thomas Scientific | 7722-7 | |
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM) | Corning Cellgro | 15-013-CV | Store at 4 °C |
Fetal Bovine Serum (FBS) | Seradigm | 1500-050 | Store at -20 °C |
Five- to seven-week-old female BALB/c mice | National Cancer Institute (NCI) | 555 | |
Isoflurane | Baxter | 1001936040 | Store at Room temperature |
IVIS Spectrum | PerkinElmer | 124262 | This instrument is used for in vivo imaging (4.2 and 4.3) |
IX81 Motorized Inverted Microscope | Olympus | Olympus IX81 | |
Living Image 4.7.2 software | PerkinElmer | This instrument is used for in vivo imaging (4.2 and 4.3) | |
Lumicount | Packard | This instrument is used for quantifying luciferase activity (3.2.6) | |
Madin-Darby Canine Kidney (MDCK) epithelial cells | ATCC | CCL-34 | |
Monoclonal Antibody anti-NP Influenza A Virus HB-65 | ATCC | H16-L10-4R5 | Store at -20 °C |
Nano-Glo Luciferase Assay Reagent | Promega | N1110 | This reagent is used to measure Nluc activity. Store at -20 °C |
Neutral Buffered Formalin 10% | EMD | 65346-85 | Store at RT |
Nunc MicroWell 96-Well Microplates | Thermo Fisher Scientific | 269620 | |
Penicillin/Streptomycin (PS) 100x | Corning | 30-00-CI | Store at -20 °C |
Penicillin/Streptomycin/L-Glutamine (PSG) 100x | Corning | 30-009-CI | Store at -20 °C |
Retiga 20000R Fast1394 Camera | Qimaging | Retiga 2000R | |
Scanner | HP | ||
Texas Red-conjugated anti-mouse -rabbit secondary antibodies | Jackson | 715-075-150 | Store at -20 °C |
Tosylsulfonyl phenylalanyl chloromethyl ketone (TPCK)-treated trypsin | Sigma-Aldrich | T8802 | Store at -20 °C |
Triton X-100 | J.T.Baker | X198-07 | Store at RT |
Vmax Kinetic plate reader | Molecular Devices |