يصف لنا بروتوكول مفصل للمقايسة الطفرة الاتحاد “حدد أمداً” في الخلايا المستزرعة من القوارض المعدلة وراثيا أو الحيوانات المقابلة تعامل مع عامل الكيماوية/الفيزيائية للفائدة. وقد استخدمت هذا النهج على نطاق واسع لاختبار المحدثة للطفرات من المواد المسببة للسرطان في خلايا الثدييات.
قد وضعت عددا من النماذج الحيوانية المعدلة وراثيا ونظم الكشف عن الطفرات المحدثة للطفرات في اختبار للمواد المسببة للسرطان في خلايا الثدييات. هذه، استخدمت الفئران المعدلة وراثيا و “لامدا” (λ) حدد الاتحاد “نظام الكشف عن الطفرات” للتجارب المحدثة للطفرات بالعديد من المجموعات البحثية في جميع أنحاء العالم. هنا، يمكننا وصف بروتوكول مفصل للمقايسة الطفرة الاتحاد “حدد أمداً”، التي يمكن تطبيقها على الخلايا المزروعة من الفئران المعدلة وراثيا/الفئران أو معاملة الحيوانات المقابلة مع وكيل الكيماوية/الفيزيائية للفائدة. البروتوكول يتكون من الخطوات التالية: (1) عزل الحمض النووي من الخلايا أو الأجهزة/الأنسجة من الحيوانات المحورة وراثيا تعامل في المختبر أو في الجسم الحي، على التوالي، مع مجمع اختبار؛ (2) استعادة ناقل المكوكية لامدا تحمل جين مراسل حيث (أي، التحوير الاتحاد ) من الحمض النووي الجينوم؛ (3) التعبئة والتغليف لناقلات المرض الذين تم إنقاذهم إلى bacteriophages المعدية؛ (4) إصابة بكتيريا المضيفة واستزراع تحت شروط انتقائية للسماح بنشر الطفرات المستحثة الاتحاد ؛ وسجل (5) الاتحاد-طفرات والحمض النووي تسلسل التحليل لتحديد تواتر متحولة الاتحاد والطيف الطفرة، على التوالي.
وضعت مجموعة واسعة من النماذج الحيوانية المعدلة وراثيا ونظم الكشف عن الطفرات المحدثة للطفرات في اختبار للمواد المسببة للسرطان في خلايا الثدييات. من هذه الفئران “الأزرق الكبير” (المشار إليها أدناه ك BB) المعدلة وراثيا و λ حدد الاتحاد “نظام الكشف عن الطفرات” قد استخدمت للتجارب المحدثة للطفرات بهذه المجموعة والعديد من غيرها بحوث المجموعات في جميع أنحاء العالم1،2، 3،4،5،،من67،،من89. لل 16 عاماً الماضية حققت التأثيرات الطفور عوامل كيميائية و/أو جسدية مختلفة باستخدام هذه الحيوانات المحورة وراثيا أو ثقافاتها خلية جنينية تنتجها الخلايا الليفية المقابلة تعامل مع مجمع لاختبار، وتحليلها في وقت لاحق النمط الظاهري والنمط الوراثي للتحوير الاتحاد λ حدد الاتحاد المقايسة وتسلسل الحمض النووي، على التوالي10،،من1112،،من1314 , 15 , 16 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 22 , 23 , 24-الجينوم من هذه الحيوانات المحورة وراثيا يحتوي على ناقل مكوك λ عاثية (λLIZ) المتكاملة على كروموسوم 4 نسخ متعددة الرأس إلى الذيل كونكاتيمير1،2،25. ناقل المكوك λLIZ يحمل اثنين من الجينات مراسل حيث، إلا وهي ﻻسي و الاتحاد المتسلسلات1،2،25،،من2627، ،من 2829،30،31،32،،من3334،35،36، 37،39،،من3840،42،41،43،،من4445 , 46 , 47-يستند التحليل حدد الاتحاد λ استرداد ناقلات المكوك λLIZ من الحمض النووي من الخلايا المشتقة من الأجهزة/الأنسجة من الحيوانات المحورة وراثيا1،2،25 . ثم يتم حزم ناقلات المكوك λLIZ المستردة في λ بالعاثية رؤساء قادرة على إصابة مضيف مؤشر الإشريكيّة القولونية. وفي وقت لاحق، تزرع البكتيريا المصابة تحت شروط انتقائية للسماح لتسجيل وتحليل الطفرات في الاتحاد التحوير1،3.
هنا، يمكننا وصف بروتوكول مفصل للمقايسة حدد الاتحاد λ، الذي يتألف من عزل الحمض النووي من الخلايا/أجهزة للحيوانات المحورة وراثيا التي تعامل في المختبر/في فيفو مع اختبار استرجاع مركبة، λLIZ مكوك ناقلات من الحمض النووي الجينوم، التعبئة وتغليف الناقلات إلى فاجيس λ المعدية، العدوى المضيفة كولاي مع bacteriophages، تحديد هوية الاتحاد-طفرات في ظروف الانتقائي لتحديد تواتر متحولة الاتحاد ، و تحليل تسلسل الحمض النووي إنشاء الاتحاد طفرة الطيف. يمكن تطبيق البروتوكول على الماوس/الفئران المعدلة وراثيا خلية الثقافات تعامل في المختبر مع عامل الكيماوية/الفيزيائية للفائدة، أو معاملة الأنسجة/أجهزة الحيوانات المقابلة في فيفو مع الاختبارات الكيميائية/عامل1، 2،4،،من4849،50،،من5152. عرض تخطيطي للمقايسة حدد الاتحاد λ يرد في الشكل 1.
يتم استخدام الفحص حدد الاتحاد λ للكشف عن الطفرات في التحوير الاتحاد ضبطت المجينية الحمض النووي للخلايا المشتقة من الأجهزة/أنسجة القوارض BB3. جينوم هذه الحيوانات المحورة وراثيا يحتوي على نسخ متعددة جنبا إلى جنب ناقل المكوك λLIZ تشروموسومالي المتكاملة، الذي يحمل الا?…
The authors have nothing to disclose.
نود أن نعترف بالمساهمات من جميع الزملاء والمتعاونين لدراساتنا الأصلي، أحيلت نتائجه في هذه المخطوطة (لأغراض توضيحية). دعم عمل المؤلفين من المنح المقدمة من المعهد الوطني لطب الأسنان والبحوث إحضارهما “المعاهد الوطنية للصحة” (1R01DE026043) على أساسها، ومن جامعة California Tobacco-Related برنامج بحوث الأمراض إلى AB ( TRDRP-26IR-0015) وشارع (تردرب-25IP-0001). وكان مقدمو الدراسة أي دور في تصميم الدراسة، وجمع البيانات وتحليل البيانات، وتفسير البيانات وكتابة التقرير، أو في قرار يقدم للنشر.
Agar | MO Bio Laboratories, Inc. | 12112-05 | Bacteriological grade |
BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit | Thermo Fisher Scientific | 4337455 | None |
Casein Peptone | Alfa Aesar | H26557 | None |
Gelatine | J. T. Baker | 2124-01 | Powder |
Glycerol | Fisher Scientific | BP 229-1 / M-13750 | None |
LB Agar | Fisher Scientific | BP 9724-500 | None |
QIAquick PCR purification kit | Qiagen | 8104 | 50 PCR purification reactions |
Sodium Acetate Trihydrate | Fisher Scientific | M-15756 | None |
Taq5000 DNA Polymerase | Qiagen | 201207 | None |
Thiamine Hydrochloride | Macron Fine Chemicals | 2722-57 | None |
Transpack Packaging Extract | Stratagene Corp., Acquired by BioReliance | Sigma-Aldrich Corp. | 200223 | 50 packaging reactions |
Tris Base | Fisher Scientific | BP 152-1 / EC 201-064-4 | None |
Trypton | Biosciences | RC-110 | None |