Summary

En High-throughput Kompatibel Assay å evaluere Drug Effekt mot macrophage passert<em> Mycobacterium tuberculosis</em

Published: March 24, 2017
doi:

Summary

New models and assays that would improve the early drug development process for next-generation anti-tuberculosis drugs are highly desirable. Here, we describe a quick, inexpensive, and BSL-2 compatible assay to evaluate drug efficacy against Mycobacterium tuberculosis that can be easily adapted for high-throughput screening.

Abstract

The early drug development process for anti-tuberculosis drugs is hindered by the inefficient translation of compounds with in vitro activity to effectiveness in the clinical setting. This is likely due to a lack of consideration for the physiologically relevant cellular penetration barriers that exist in the infected host. We recently established an alternative infection model that generates large macrophage aggregate structures containing densely packed M. tuberculosis (Mtb) at its core, which was suitable for drug susceptibility testing. This infection model is inexpensive, rapid, and most importantly BSL-2 compatible. Here, we describe the experimental procedures to generate Mtb/macrophage aggregate structures that would produce macrophage-passaged Mtb for drug susceptibility testing. In particular, we demonstrate how this infection system could be directly adapted to the 96-well plate format showing throughput capability for the screening of compound libraries against Mtb. Overall, this assay is a valuable addition to the currently available Mtb drug discovery toolbox due to its simplicity, cost effectiveness, and scalability.

Introduction

Tuberkulose (TB) er fortsatt en alvorlig global helsetrussel tross for tilgjengeligheten av anti-TB kjemoterapiregimer i over 40 år 1. Dette skyldes delvis kravet for lange behandlingsperioder på over seks måneder ved hjelp av flere legemiddelkombinasjoner, noe som fører til pasient avvik 2. Fremveksten av multiresistent tuberkulose i de senere år har ytterligere forverret problemene i et felt hvor vellykket utvikling av klinisk godkjente legemidler er praktisk talt ikke-eksisterende tre. Faktisk, til tross uttømmende anti-TB narkotika utvikling, har bare et enkelt medikament er FDA godkjent for klinisk bruk i de siste 40 årene 4. Dermed er nye generasjoner av anti-tuberkulosemedisiner sterkt behov for å løse dette problemet.

Et sentralt problem i TB medisiner er mangel på vellykket overføring fra forbindelser med in vitro aktivitet til effekt i klinisk setting= "xref"> 5, 6, 7. I utgangspunktet var målet baserte tilnærminger brukes til å screene for anti Mtb narkotika 5, som ikke klarte å oversette til hele bakterieceller. Selv når Mtb-celler blir brukt, er det ofte utført ved anvendelse av buljong dyrket kulturer, som ikke nøyaktig forutsi legemidlets effekt in vivo 8, 9. Disse problemene har blitt anerkjent og narkotika screening-analyser mot makrofager som inneholder Mtb eller latent Mtb har blitt opprettet 8, 10, 11, 12. Men, selv om disse mer avanserte analyser ikke gir tilstrekkelig hensyn til holdbarhetstid barrierer som narkotika møter i de ikke-vaskularisert lungelesjoner, og i nekrotiske foci på stedet av infeksjon. Faktisk, Selv for den første linjen TB stoffet rifampicin, har sub-optimal dosering blitt avhørt på grunn av utilstrekkelig in vivo vev og spinalvæske (CSF) penetrasjon 13, 14, 15 samt redusert effekt mot intracellulære Mtb 8, 9. Som sådan, nye modeller og analyser som ville ta hensyn til disse parametrene i løpet av tidlig ledelse utviklingsprosessen vil utvilsomt forbedre TB legemiddel innsats.

For å møte dette behovet, har vi nylig etablert en billig, rask, og BSL-2 kompatibel alternativ infeksjonsmodell for Mtb legemidlets effekt testing 16. Denne infeksjonen modell produsert tettpakket Mtb innenfor store makro aggregerte strukturer, som rekapitulert fysiologisk relevante mobil penetrasjon barrierer og genererte makrofag-passeres <em> Mtb med en endret fysiologiske status ligner latent Mtb. Mtb avledet fra denne infeksjonsmodellen ble kombinert med den resazurin mikrotiter-analysen (REMA) for å vurdere medikament-effektivitet, noe som gir resultater i overensstemmelse med andre intracellulære infeksjonsmodeller, og korrelert godt med den rapporterte evnen til felles tuberkulose midler for å oppnå høy CSF-konsentrasjoner i forhold til serumkonsentrasjoner 16.

Her beskriver vi i detalj generering av Mtb / makro samlede strukturer for å produsere makrofag-passert Mtb egnet for resistenstesting ved hjelp av REMA. Spesielt viser vi hvordan denne infeksjonen systemet kunne tilpasses til et 96-brønners format for kompatibilitet med throughput screening av kandidat anti-tuberkulosemedisiner.

Protocol

MERK: Som M. tuberculosis mc 2 6206 er en avirulent stamme 17, 18, kan alt arbeid i denne protokollen bli utført i et biosikkerhetsnivå 2 anlegg (BSL-2). 1. Kultur betingelser for Green Fluorescent Protein Uttrykke M. tuberculosis mc 2 6206 (Mtb -GFP) MERK: M. tuberculosis H37Rv avledet auksotrop belastning mc 2 6206 (Δ panCD, …

Representative Results

For å bekrefte robustheten av å tilpasse denne infeksjonsmodellen til 96-brønners plateformat, vi her undersøkte resistens av Mtb avledet fra vår 96-brønners innrettet infeksjonsmodell mot rifampicin (RIF) og moxifloxacin (Moxi) i henhold til malen gitt i figur 1A. Vi viser at genereringen av Mtb / makrofag-aggregerte strukturer nøkkel til denne analysen kan bli pålitelig produsert i et 96-brønners plateformat (fig 2), for derv…

Discussion

Her har vi beskrevet i detalj en alternativ Mtb infeksjonsmodell egnet for legemidlets effekt testing. Denne modellen tar hensyn til to viktige faktorer som bør gis mer hensyn i løpet av tidlig TB narkotika utviklingsprosessen: tilstedeværelse av fysiologisk relevante barrierer mot narkotika penetrasjon og metabolske forandringer av Mtb under infeksjon. Mens vi tidligere har vist fordelene med vår infeksjonsmodell og foreslo muligheten for å skalere opp infeksjonen for gjennomstrømming kompatibil…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We thank Dr. Frank Wolschendorf for access to the Cytation 3 automated imaging plate reader. This work was funded in part by NIH grant R01-AI104499 to OK. Parts of the work were performed in the UAB CFAR facilities and by the UAB CFAR Flow Cytometry Core/Joint UAB Flow Cytometry Core, which are funded by NIH/NIAID P30 AI027767 and by NIH 5P30 AR048311.

Materials

7H9 BD Difco 271310 Follow manufacturer's recommendations
Middlebrook OADC BD Biosciences 212351
Tyloxapol Sigma T8761 Prepare 20% stock solution in H2O; filter sterilize
D-Pantothenic acid hemicalcium salt Sigma P5710 Prepare 24 mg/ml  stock solution in H2O; filter sterilize
L-leucine MP Biomedicals 194694 Prepare 50 mg/ml  stock solution in H2O; filter sterilize
Hygromycin B EMD Millipore 400051 Prepare 200 mg/ml  stock solution in H2O
Nalgene Square PETG media bottle Thermo Fisher 2019-0030
RPMI 1640 media Hyclone SH30027.01
Fetal Bovine Serum Atlanta Biologicals S12450H
L-glutamine Corning MT25005CI
HEPES Hyclone SH30237.01
Cytation 3 plate reader Biotek Interchangable with any fluorescent plate reader and microscope
Gen5 Software Biotek Recording and analysis of rezasurin coversion
Rifampicin  Fisher Scientific BP2679250 Prepare 10 mg/ml stock solution in H2O
Moxifloxacin Hydrochloride Acros Organics 457960010 Prepare 10 mg/ml stock solution in H2O
Resazurin Sodium Salt Sigma R7017 Prepare 800 μg/mL stock solution in H2O; filter sterilize
Tween-80 Fisher Scientific T164500 Prepare 20% stock solution in H2O; filter sterilize

References

  1. Barry, C. E. Lessons from seven decades of antituberculosis drug discovery. Curr Top Med Chem. 11 (10), 1216-1225 (2011).
  2. Bass, J. B., et al. Treatment of tuberculosis and tuberculosis infection in adults and children. American Thoracic Society and The Centers for Disease Control and Prevention. Am J Respir Crit Care Med. 149 (5), 1359-1374 (1994).
  3. Koul, A., Arnoult, E., Lounis, N., Guillemont, J., Andries, K. The challenge of new drug discovery for tuberculosis. Nature. 469 (7331), 483-490 (2011).
  4. Palomino, J. C., Martin, A. TMC207 becomes bedaquiline, a new anti-TB drug. Future Microbiol. 8 (9), 1071-1080 (2013).
  5. Zuniga, E. S., Early, J., Parish, T. The future for early-stage tuberculosis drug discovery. Future Microbiol. 10 (2), 217-229 (2015).
  6. Evangelopoulos, D., Fonseca, d. a., D, J., Waddell, S. J. Understanding anti-tuberculosis drug efficacy: rethinking bacterial populations and how we model them. Int J Infect Dis. 32, 76-80 (2015).
  7. Ekins, S., et al. Looking back to the future: predicting in vivo efficacy of small molecules versus Mycobacterium tuberculosis. J Chem Inf Model. 54 (4), 1070-1082 (2014).
  8. Christophe, T., et al. High content screening identifies decaprenyl-phosphoribose 2′ epimerase as a target for intracellular antimycobacterial inhibitors. PLoS Pathog. 5 (10), e1000645 (2009).
  9. Hartkoorn, R. C., et al. Differential drug susceptibility of intracellular and extracellular tuberculosis, and the impact of P-glycoprotein. Tuberculosis (Edinb). 87 (3), 248-255 (2007).
  10. Queval, C. J., et al. A microscopic phenotypic assay for the quantification of intracellular mycobacteria adapted for high-throughput/high-content screening. J Vis Exp. (83), e51114 (2014).
  11. Sorrentino, F., et al. Development of an intracellular screen for new compounds able to inhibit Mycobacterium tuberculosis growth in human macrophages. Antimicrob Agents Chemother. 60 (1), (2015).
  12. Sarathy, J., Dartois, V., Dick, T., Gengenbacher, M. Reduced drug uptake in phenotypically resistant nutrient-starved nonreplicating Mycobacterium tuberculosis. Antimicrob Agents Chemother. 57 (4), 1648-1653 (2013).
  13. Dutta, N. K., Karakousis, P. C. Can the duration of tuberculosis treatment be shortened with higher dosages of rifampicin?. Front Microbiol. 6, 1117 (2015).
  14. van Ingen, J., et al. Why Do We Use 600 mg of Rifampicin in Tuberculosis Treatment?. Clin Infect Dis. 52 (9), e194-e199 (2011).
  15. Donald, P. R. Cerebrospinal fluid concentrations of antituberculosis agents in adults and children. Tuberculosis (Edinb). 90 (5), 279-292 (2010).
  16. Schaaf, K., et al. A Macrophage Infection Model to Predict Drug Efficacy Against Mycobacterium Tuberculosis. Assay Drug Dev Technol. 14 (6), 345-354 (2016).
  17. Sampson, S. L., et al. Protection elicited by a double leucine and pantothenate auxotroph of Mycobacterium tuberculosis in guinea pigs. Infect Immun. 72 (5), 3031-3037 (2004).
  18. Jain, P., et al. Specialized transduction designed for precise high-throughput unmarked deletions in Mycobacterium tuberculosis. MBio. 5 (3), e01245-e01214 (2014).
  19. Davis, J. M., Ramakrishnan, L. The role of the granuloma in expansion and dissemination of early tuberculous infection. Cell. 136 (1), 37-49 (2009).
  20. Collins, L., Franzblau, S. G. Microplate alamar blue assay versus BACTEC 460 system for high-throughput screening of compounds against Mycobacterium tuberculosis and Mycobacterium avium. Antimicrob Agents Chemother. 41 (5), 1004-1009 (1997).
  21. Snewin, V. A., et al. Assessment of immunity to mycobacterial infection with luciferase reporter constructs. Infect Immun. 67 (9), 4586-4593 (1999).

Play Video

Cite This Article
Schaaf, K., Smith, S. R., Hayley, V., Kutsch, O., Sun, J. A High-throughput Compatible Assay to Evaluate Drug Efficacy against Macrophage Passaged Mycobacterium tuberculosis. J. Vis. Exp. (121), e55453, doi:10.3791/55453 (2017).

View Video