Оценка Тератогенные Изменения в модели данио рерио внутриутробного развития плода алкоголь

1. Этанол Лечение эмбрионов Эмбрионов данио рерио, полученные от дикого типа спаривания были подняты на 28 ° C в 5 мл воды эмбриона. (Milli-Q воды с 60 мг / л мгновенных океан). Различные штаммы дикого типа эмбрионы имеют немного разные допуски в этанол воздействия 9. Воздействие этанола было начато на купол этапе (~ 4,3 часа после оплодотворения, HPF) для нужного времени, до 24 импульсов в час. Это начальный этап примерно эквивалентно имплантации стадии эмбрионов млекопитающих, незадолго до гаструляции. Этанол концентраций, используемых в диапазоне от 0,2% -2,5%, объем / объем. Испытания показали, что 25-50% раствора в воде, попадает в развивающийся эмбрион 10, 11. Эмбрионы поддерживается на 28 ° C для требуемого периода времени. После нужной длины этанола экспозиции, этанола водный раствор удаляется и заменяется тремя моет регулярно воды данио и поддерживается лг желаемое время. Специфика дефекта зависит от времени начала, доза и длительность импульса этанола. 2. Коллекция эмбрионов для РНК, в гибридизация, антител и хряща Окрашивание Для сбора мРНК КПЦР, возраст соответствует эмбрионов собираются в пробирки Эппендорф. После удаления воды данио, лизис буфера TCEP добавляется. Моторизованный пульверизатора используется для физически отделить эмбрионы в лизис решение. Это затем пропускают через колонку преклира, который удаляет все недиссоциированных большие куски. Полученный раствор содержит все макромолекулы выпущен лизис процесса. РНК экстрагировали выполнения этого решения на колонке, а затем моет и ДНКазы лечения. Элюирование затем выполняется с помощью воды или элюирования решение, предоставленной производителем (5'-премьер). РНК может быть преобразован в кДНК с использованием стандартных методов КПЦР или использовать в микро-Массив анализа. Ибо в гибридизация и антител окрашивания, эмбрионы от 6 до 24 HPF были зафиксированы в 4% параформальдегид ночи при 4 ° C. Далее следуют 3 мойки в PBS + 0.1% Tween (PBT), чтобы сохранить эмбрионов от слипания. Эмбрионы, которые затем передаются через серию из 3 метанола: PBT моет на 100% метанола, после чего их можно хранить при температуре -20 ° C. Эти эмбрионы могут быть использованы для в гибридизация или антитела окрашивания. Некоторые антитела не будут работать после того, как метанол лечения, так что это предостережение должно быть принято во внимание и ваши специфические антитела испытания, чтобы определить будет ли он работать после того, как метанол лечения. Для окрашивания хряща, эмбрионы должны быть подняты до 5 или 6 дней после оплодотворения (DPF). Затем они фиксировали в 4% параформальдегид ночи при 4 ° C, а затем на 3 мойки в PBT. 3. Оценка этанол-индуцированного изменения экспрессии генов и последствий <li> Для определения уровня экспрессии генов изменилось, целевые гены рассматриваются как КПЦР и гибридизация. КПЦР достигается с помощью праймеры ДНК со встроенным технологиям (IDT) программного обеспечения, а затем проверяются с помощью 3 отдельных биологических образцов. После грунтовки были утверждены, КПЦР осуществляется на кДНК создан из собранных образцов РНК. Каждый образец выполняется в трех экземплярах. ПЦР выполняются Платиновый SYBR Green КПЦР Супер смеси (Invitrogen) на Chroma-4 ПЦР машины (BioRad) или аналогичных машин ПЦР с системой обнаружения многоцветной. В дополнение к генам допрашивали, очень важно, чтобы управление набором праймеров используется, чтобы уравновесить небольшие различия в кДНК или РНК подготовки. Для наших эмбрионов данио рерио, мы используем GAPDH: 5'GAAGGTGGGAAACTGGTCAT3 и 5'TTGCACCACCCTTAATGTGA3. Гены анализируемых затем нормированы на GAPDH уровня относительной количественной оценки экспрессии генов рассчитывается Pfaffl изменение метода 2 <sup> – Ct, отображения данных как раз разница в экспериментальном по сравнению с диким типом 12. Нормальный расчет предполагает, что все гены дублирования ДНК в два раза для каждого цикла, и, таким образом выражает данных как отношение изменения в экспериментальной генной за изменения в справочных ген, выраженная в мощности вычислений над целыми "2", , которая является эффективность удвоения ДНК на цикл видели в идеальном реакции ПЦР. Pfaffl метод заменяет общий "2" с экспериментатором порожденных истинной эффективности ПЦР-праймеры выбрали. Это отражает более точно отражает разницу в реакции ПЦР. Полная формула: (Эффективность экспериментальной генной) (КТ-контрольного образца Ct очищенной выборке) ————————————————– ———————————– (Эффективность ведения ген) (КТКонтрольный образец – Ct очищенной выборке) Ибо в гибридизация, дигоксигенин (DIG)-меченных riboprobes строятся из плазмиды, содержащие части гена. Возраст соответствием эмбрионы подвергаются riboprobes с использованием стандартных условиях 13 и регистрируется с помощью анти-антител раскопки связаны с щелочной фосфатазы, которая позволяет расположения меченых riboprobes помощью цветной реакции (NBT / BCIP). Эмбрионы затем визуализировать помощью микроскопа Leica рассечения (рис. 1В-G). Для оценки морфогенетических развития эмбрионов собираются в нужное время и рассматривается в соответствии с рассечения микроскопом. Для сомитов формы, живые эмбрионы отображаемого 14. Для расстояния между глаз и длина тела эмбрионов зафиксированы в PFA. Во всех случаях, образы желаемого региона, снятые на вскрытии микроскопом на увеличении фиксированной и измерений, проведенных с помощью Adobe Photoshop softwarE 10,14. Для изучения влияния лечения на разработку структуры хряща в личиночной данио рерио, мы используем Альциановый Синий окрашивания. Фиксированные личинки данио относятся с Альциановый синий раствор, растворенного в 80% этанола: 20% ледяной уксусной кислоты (кислоты спирта) в течение нескольких часов или на ночь. Личинки обесцвечивают в нескольких стирок кислоты алкоголь затем был переведен в 1% КОН: 3% раствор перекиси водорода для дальнейшей очистки пигментные клетки. Данио рерио должна быть не менее 4 дней, чтобы показать структуры хряща, и это лучше, определенных в рыбе, что 5 или 6 дней. Гибель клеток в живых эмбрионов оценивали с помощью акридинового оранжевого (АО). АО не клетки проницаемы для живых клеток, и связывается с ДНК в клетках с нарушением мембраны, в том числе апоптоза и некроза. Живые эмбрионы инкубировали с 5 мг / мл в АО PBS в течение 1 часа, затем на 3 мойки в PBS. Эмбрионы затем отображаемого помощью конфокальной микроскопии. Digital Z-Serх годов образы объединяются для создания композиционных материалов. 4. Управление данио рерио эмбрионов После идентификации генов, которые снизились на этанол экспозиции, можно попробовать заменить их с помощью инъекции РНК предназначен для замены недостающих генов. Capped мРНК транскрибируется с линеаризованной плазмиды ДНК с помощью РНК-полимеразы в пробирке комплекты транскрипции, в соответствии с инструкциями производителя (mMessage машина, Applied Biosystems). Между 25-200 пг / п РНК вводят в клетки 1-2 яйца этап данио, в растворе 0,1 М KCl. Эмбрионы затем позволили восстановиться, прежде чем рассматривать с этанолом, как описано выше (рис. 5). Для любого гена стенограмм, которые увеличились на этанол воздействия, они могут быть сокращены, или "разобранном" с использованием технологии антисмысловых морфолино. Антисмысловые morpholinos (AMOS) разработаны средства компании Джин, и блокирует перевод РНК в белок или Блоск созревание и сплайсинг РНК, в зависимости от экспериментальной необходимостью. Это действие morpholinos ограничить количество активного белка гена целевых, дефицит которого может быть измерена с помощью anitibodies если они имеются. Эффективность morpholinos РНК сплайсинга может быть измерена с помощью RT-PCR для выявления относительного количества сращенных и unspliced ​​стенограммы. Титрования в морфолино может привести к зависимости от дозы деятельности 15. AMOS разводят до рабочей концентрации (стр. титровать до нг концентрацию) в Danieau решение (58 мМ NaCl, 0,7 мМ KCl, 0,4 мМ MgSO 4, 0,6 мМ Ca (NO 3) 2, 5 HEPES мМ, рН 7,6). Инъекция происходит на 1-2-клеточной стадии, то эмбрионы позволили разработать до подвергается этанола лечение как указано выше. 5. Представитель Результаты Данио воздействие на эмбрион этанола приводит в ряде развития и генетических дефектов, которые связаны сфенотипа в других позвоночных. Мы зафиксировали аномальное развитие осевых тканей, в том числе хорды (данные не представлены 14). Задержка в развитии производства этанола, по-видимому, приводит к нарушению надлежащего удлинение хорды, что привело к укороченным, а иногда нарушается хорды (данные не представлены 14). Эта ранняя задержка и хорды дефектов, которые могли приводит, в частности на более поздний отклонения в сомитов (рис. 2), которые потеряли свои сильные форме шеврона, как показано на необработанных контрольных, а ближе к П-образной сомитов характеристика фенотипов видно, когда звуковой сигнализации снижается 14. Угол сомитов можно измерить с помощью стандартного программного обеспечения, а угол увеличивается с 92,1 ± 4,6 ° в необработанных контрольных в 122,6 ± 6,6 ° в этанол рассматривается эмбрионов (р <0,001). Другим следствием воздействия этанола, который может быть downstreaм ранней задержки развития, а затем хорды дефектов сокращенной длины эмбриона (рис. 3). Даже измерения эмбрионов с учетом кривизны производства этанола экспозиции, этанол воздействие приводит к укороченным стволом, который зависит от дозы этанола эмбрион подвергался (Рисунок 3E 14). Этот результат похож на сохранение prepuberty невысокого роста у детей подвергаются этанола в течение 16 развитию, 17, предполагая, что модель данио имеет важное значение для понимания человека врожденный дефект. Один из классических характеристик ФАС является классическим фации, в том числе снижение челюсти, небольшое отверстие глаза, и гладкая перегородка. Большая часть этих функций, связанных с сокращением средней линии ткани. Это было продемонстрировано в моделях на животных, которые интенсивного воздействия этанола приводит к еще более выраженным фенотипом, в том числе и synopthalmia циклопия. Когда выставкапеть эмбрионов данио рерио на увеличение дозы этанола, внутриглазное расстояние (НОР) уменьшается в зависимости от дозы образом (рис. 4) в соответствии с природой человека врожденный дефект. Циклопия можно найти только в очень высоких дозах, но меньших дозах они производят значительное снижение НОР (рис. 4), предполагая, что это животное модель имеет аналогичный дефект средней линии лица развития 10. Для того чтобы понять механизм, лежащий в основе дефектов, как в теле и лице производства этанола экспозиции, мы стремились создать экспрессии генов изменения, которые происходят на ранних стадиях развития, и что было бы разумно ожидать, чтобы способствовать позже пороки развития. Мы делаем это двумя способами, добыча мРНК из эмбрионов позволяет дать количественную оценку уровня экспрессии гена в этанол рассматривается эмбрионов по сравнению с контролем (рис. 1А). Кроме того, мы можем выполнить на местегибридизации, чтобы посмотреть на структуру генов, независимо от того, или нет сигнала уменьшается (рис. 1В-G 18). В этом примере двух генов, экспрессия которых снижается после воздействия этанола показано, gli1 и six3b. Когда мы изучили на месте шаблона для six3b, мы нашли снижение пространственной протяженности экспрессии этого гена (рис. 1 EG) в эмбрионы подвергаются этанола. Аналогичное снижение было обнаружено в гене GSC (рис. BD). Оба six3b и GSC выражены в тканях суждено способствовать черепно-лицевых тканей средней линии. Таким образом, сокращение этих генов в 8 HPF согласуется с сокращением НОР найдены позже, как показано на рисунке 4. Как только гены, которые влияют на этанол определены, существуют механизмы, с помощью которых выражение из них может быть увеличена или уменьшена. В данном EXAmple, мы показали, 2 гена, которые снизились (gli1 и six3b) по КПЦР. Мы решили придать мРНК, чтобы определить, вспять этих генов изменения могут улучшить результаты. Для этого эксперимента, а не инъекционным gli1, мы решили придать Тсс, лиганд, который увеличивает gli1 уровнях. Для six3b, мы смогли внедрить six3b себя. Мы не нашли никаких изменений, когда мы вводили six3b (данные не приведены), но и смогли принципиально спасти крупных дефектов у эмбрионов данио рерио с дополнительными Тсс инъекций (рис. 5). Рисунок 1. Этанол воздействие изменяет ранний образец и экспрессии генов уровня развития выбранных генов. А) КПЦР результаты эмбрионов на 8hpf. Результаты для двух генов отображаются: six3b и gli1. Результаты показали, как среднее из трех отдельных экспериментах,и доза этанола показано составляет 2,5%. Оба гена снижается таким образом, что является значительным с контролем (т-тест, р <0,05). BG) в гибридизация 8 эмбрионов данио HPF. Оба РКГ и six3b модели изменяются в это время точка по сравнению с контрольной группой. (Изменения с разрешения Лукс и соавт., 2007). Рисунок 2. Сегменты развития меняется в обработанных эмбрионов. Сегменты структуры и углов рассматриваются в 48 HPF. В контрольных эмбрионов (А), сомитов имеют форму шеврона и под острым углом. Этанол подвергается данио больше I-или П-образной сомитов, и меньше острых углов. (Изменения с разрешения Лукс и Ahlgren 2009). Рисунок 3. Этанол лечения значительно уменьшается длина тела у рыбок данио.Длина необработанного и этанола, подвергшихся воздействию эмбрионов были измерены функции организма крыс на 5 дней. Значительное сокращение длины видели во всех рассматриваться эмбрионов (ANOVA, р <0,001). BD. Был небольшой, но значительное снижение общей длиной эмбрионов лечение с 1,0% и 1,5% этанола, в то время как большее снижение наблюдалось в эмбрионы вводили 2,0% и 2,5% этанола. Е. Чтобы контролировать размер различий в каждой кладке, контрольных эмбрионов для каждого эксперимента были нормированы на 100, а брат обработанных эмбрионов, выраженное в процентах из 100. (Изменения с разрешения Лукс и Ahlgren 2009). Рисунок 4. Этанол воздействие приводит к снижению внутриглазного расстояние (йод) у эмбрионов данио рерио. А) фронтальная вид эмбрионов продемонстрировать нормальный фенотип и плавленого глаз. B) Различные дозы этанола вводят в течение 3 часов во время гаструляции разрешенияULTS снижению йод, когда рыба рассматривается через 24 часа. Плавленый глаза и циклопия видели только на самом высоком дозе (2,4%). * Означает значительное снижение йод сравнению с контрольной группой. (Изменение с разрешения Ahlgren, 2004). Рисунок 5. Тсс-N мРНК инъекции спасает крупных дефектов производства этанола воздействия данио. Один-два эмбриона клетки вводили 100 пг / п тсс-N мРНК и половину вводят эмбрионы подвергались стандартной дозы этилового спирта от 4,3 до 24 HPF. Эмбрионы были проанализированы на 5 DPF. Эмбрионы относиться с 2,0% этанола демонстрируют сверху изогнутые короткие хвосты, я форму сомитов, а глаза дефекты, включая циклопия. Спасение этих фенотипов наблюдается в 71/76 введенных эмбрионов (93%). В этих эмбрионов, тело прямое, сомитов являются шеврон формы, и глаза полностью разделены.