Öanalys: En metod med hög genomströmning för att utvärdera Drosophila Locomotors beteende
Published: April 30, 2023
Abstract
Källa: Eidhof, I., et al. Hög genomströmning Analys av lokomotoriskt beteende i Drosophila Island Assay. J. Vis. Exp. (2017).
Denna video beskriver öns analys, en beteendemetod som används för att studera Drosophila-rörelse. Exempelprotokollet har en inställning för analysen som är kompatibel med halvautomatisk avbildningsanalys.
Protocol
Detta protokoll är ett utdrag från Eidhof et al., High-throughput Analysis of Locomotor Behavior in the Drosophila Island Assay, J. Vis. Exp. (2017). 1. Konstruktion av öns analyslåda Förbered en bricka av ett robust material, såsom polymetylmetylmetylrylat (PMMA), för att innehålla ett lager vatten(dvs. ett bad). Se till att materialet inte är vitt.OBS: Måtten 40 x 35 x 2,5 cm3 rekommenderas (…
Representative Results
Figur 1: Flödesschema som beskriver kraven, försöksförfarandet och analysen av öanalysen. A)Ö-analysutrustning. B)Experimentell inställning för ö-analysen. C)Ö-analys. D)Bearbetning av öanalysdata med makrot”Drosophila Island Assay”. Makrot “Drosophila Island Assay ” består av 3 delmakron: 1) gör stack och projektion, 2) def…
Materials
| 25 x 95 mm Drosophila vials | Flystuff | 32-116SB | – |
| Logitech C525 HD Webcam | Logitech | – | Any webcam with USB connection is suitable. |
| Stand to hold webcam | – | – | – |
| Lamp | – | – | 12 V LED lights are appropriate |
| Pounding pad | – | – | Any mouse pad works |
| Island Assay box | – | – | Dimensions 40x35x2.5 cm. Hole 20×30 cm. Transparent. |
| Island Assay bath | – | – | Dimensions 42x38x25 cm. Non white. |
| Island/platform | – | – | Dimensions 42x38x25 cm. Uniform white. |
| Soap | – | – | Standard dishwashing detergent is suitable. |
| Computer | – | – | Scripts run both on Windows and Mac |
| Image-recording software: HandiAvi® | AZcendant® | – | HandyAvi is only compatible with Windows and has been described throughout the manuscript. It can be downloaded from: http://www.azcendant.com/DownloadHandyAvi.html (version 5.0) |
| Image-recording software: WebcamCapture | – | – | Fiji/ImageJ plugin that can be used on Mac alternative to HandyAvi for image-recordings and can be downloaded from: https://imagej.nih.gov/ij/plugins/webcam-capture/ When using this method, the user has to use the same folder setup and image-recording settings indicated in this manuscript, with the exception that for each experimental replicate, the captured image stack should be exported as Stack.tiff to the corresponding experimental replicate folder. Upon running the "Drosophila Island Assay" macro on this data, no text should be present in the "First frame identifier" setting. |
Cite This Article
Island Assay: A High-Throughput Method to Evaluate Drosophila Locomotor Behavior. J. Vis. Exp. (Pending Publication), e20103, doi: (2023).