É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo. Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
Capítulos
- 00:04Introduction
- 02:23Conduct Analyses and Generate Visualizations
- 05:17Results: Heuristic Mining of Hierarchical Genotypes and Accessory Genome Loci in Salmonella enterica
- 06:58Conclusion
Denna analytiska beräkningsplattform ger praktisk vägledning för mikrobiologer, ekologer och epidemiologer som är intresserade av bakteriell populationsgenomik. Specifikt visade det arbete som presenteras här hur man utför: i) fylogenistyrd kartläggning av hierarkiska genotyper; ii) Frekvensbaserad analys av genotyper. iii) släktskaps- och klonalitetsanalyser, iv) Identifiering av härstamningsdifferentierande tillbehörsplatser.
