Journal
/
Genética
/
جمعية الجينوم الهجين دي نوفو لتوليد الجينوم الكامل للبكتيريا البولية باستخدام تقنيات التسلسل قصيرة وطويلة القراءة
JoVE Journal
Genética
This content is Free Access.
JoVE Journal Genética
Hybrid De Novo Genome Assembly for the Generation of Complete Genomes of Urinary Bacteria using Short- and Long-read Sequencing Technologies
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

جمعية الجينوم الهجين دي نوفو لتوليد الجينوم الكامل للبكتيريا البولية باستخدام تقنيات التسلسل قصيرة وطويلة القراءة

4,394 Views

•

12:08 min

•

August 20, 2021

DOI:

10.3791/62872-v

DOI:
10.3791/62872-v

•

12:08 min
August 20, 2021

•

39 Views
, , , , ,
1Department of Biological Sciences,University of Texas at Dallas, 2Department of Urology,University of Texas Southwestern Medical Center

Summary

Automatically generated

هذا البروتوكول تفاصيل نهج شامل لزراعة وتسلسل، ودي نوفو تجميع الجينوم الهجين من البكتيريا البولية. وهو يوفر إجراء قابل للتكرار لتوليد تسلسلات الجينوم الدائرية الكاملة المفيدة في دراسة كل من العناصر الوراثية الكروموسومية وخارج الكروموسومية التي تساهم في استعمار المسالك البولية، والتسبب في الإمراض، ونشر مقاومة مضادات الميكروبات.

Explore More Videos

Hybrid Genome AssemblyUrinary BacteriaShort-read SequencingLong-read SequencingComplete GenomesGenome ArchitectureMobile Genetic ElementsCulturable BacteriaGenome ContentAdapter LigationFlow Cell PrimingDNA Library PreparationSequencing Run

Read Article

Cite this Article

Sharon, B. M., Hulyalkar, N. V., Nguyen, V. H., Zimmern, P. E., Palmer, K. L., De Nisco, N. J. Hybrid De Novo Genome Assembly for the Generation of Complete Genomes of Urinary Bacteria using Short- and Long-read Sequencing Technologies. J. Vis. Exp. (174), e62872, doi:10.3791/62872 (2021).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy