Dit protocol beschrijft hoe menselijke intestinale organoïden kunnen worden geïnfecteerd vanaf hun apicale of basolaterale kant om gastheer / pathogeeninteracties op eencellig niveau te karakteriseren met behulp van eencellige RNA-sequencing (scRNAseq) -technologie.
Stanifer, M. L., Boulant, S. Adapting Gastrointestinal Organoids for Pathogen Infection and Single Cell Sequencing under Biosafety Level 3 (BSL-3) Conditions. J. Vis. Exp. (175), e62857, doi:10.3791/62857 (2021).