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Perfil proteômico de EPS-urina através da Digestão FASP e Análise Independente de Dados
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1Research Centre for Advanced Biochemistry and Molecular Biology, Department of Experimental and Clinical Medicine,Magna Graecia University of Catanzaro, 2Department of Health Science,Magna Graecia University of Catanzaro, 3Romolo Hospital, 4Department of Experimental and Clinical Medicine,Magna Graecia University of Catanzaro
Capítulos
- 00:00Introduction
- 00:55Protocol
- 01:25Protocol: FASP Digestion
- 05:29Protocol: SCX Purification
- 08:08Protocol: Protein Quantifcation by External Standard
- 09:23Protocol: NanoLC-MS/MS and DIA Analysis
- 11:31Protocol: High-pH C18 Fractionation for Spectral Library
- 13:09Protocol: Data Analysis
- 13:35Expected Results
- 13:53Conclusion
Aqui, apresentamos um protocolo de digestão otimizado no filtro com informações detalhadas sobre o seguinte: digestão de proteínas, purificação de peptídeos e análise de aquisição independente de dados. Esta estratégia é aplicada à análise de amostras de urina de secreções prostáticas expressas e permite alta cobertura proteome e perfil livre de rótulos de baixo valor ausente do proteome urinário.
