É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo. Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
خط أنابيب المعلوماتية الحيوية لتحليل بدقه وكفاءه الناسخ ميكرورنا في النباتات
8,015 Views
•
06:34 min
•
January 21, 2020
DOI:
1Beijing Key Laboratory of Agricultural Genetic Resources and Biotechnology, Beijing Agro-Biotechnology Research Center,Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, 2State Key Laboratory of Protein and Plant Gene Research, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, School of Advanced Agricultural Sciences and School of Life Sciences,Peking University
Summary
Automatically generated
وهناك خط أنابيب المعلوماتية الحيوية ، وهي miRDeep-P2 (miRDP2 لفتره قصيرة) ، مع تحديث معايير ميرنا النبات وخوارزميه إصلاحها ، يمكن بدقه وكفاءه تحليل ميكرورنا النصوص في النباتات ، وخاصه بالنسبة للأنواع مع الجينوم المعقدة والكبيرة.
Explore More Videos
Bioinformatics PipelineMicroRNA TranscriptomesPlantsMiRDeep2Plant MicroRNAsTranscriptional RegulatorsPlant DevelopmentEnvironmental ChallengesFalse PositivesProcessing TimeHigh Confidence MicroRNA AnnotationGenome FunctionMiRDeep2 PipelineArabidopsis ThalianaGenome Reference IndexNoncoding RNA Reference IndexDeep Sequencing ReadsAdaptersFASTA Identifiers
Read Article
Cite this Article
Wang, Y., Kuang, Z., Li, L., Yang, X. A Bioinformatics Pipeline to Accurately and Efficiently Analyze the MicroRNA Transcriptomes in Plants. J. Vis. Exp. (155), e59864, doi:10.3791/59864 (2020).
Copy