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Novel Sequence Discovery by Subtractive Genomics
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Neue Sequenz Entdeckung durch subtraktive Genomics

DOI:
10.3791/58877-v

•

09:40 min

•

January 25, 2019

•

, ,
1Biology Department,American University

Capítulos

  • 00:04Título
  • 01:08De novo Assemble Starting Sequence
  • 02:03BLAST the Assembly Against the Reference Sequence
  • 04:44Design Primers for the Sequence that Remains
  • 06:25qPCR Validation of the Remaining Sequence
  • 07:51Results: Example Data of qPCR Results Including Negative and Positive Outcomes
  • 08:53Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Dieses Protokoll soll verwenden eine Kombination aus Rechenleistung und Bank-Forschung, um neue Sequenzen zu finden, die leicht von einer Co reinigende Sequenz, die nur teilweise bekannt sein kann nicht getrennt werden können.

Tags

Novel Sequence DiscoverySubtractive GenomicsGenomic SequencesInexpensiveFlexibleBacterial Vaccine TargetsVirus IdentificationUnknown SeparationReference SequenceTrimmomaticPearReptileTrinityBlastTransdeckorTblastn

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