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Isolement et analyse des communautés microbiennes dans le sol, rhizosphère et racines dans des expériences de graminée vivace
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Isolation and Analysis of Microbial Communities in Soil, Rhizosphere, and Roots in Perennial Grass Experiments
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Isolement et analyse des communautés microbiennes dans le sol, rhizosphère et racines dans des expériences de graminée vivace

DOI:
10.3791/57932-v

•

10:31 min

•

July 24, 2018

•

, , , ,
1Department of Agronomy and Horticulture and Center for Plant Science Innovation,University of Nebraska-Lincoln, 2USDA-ARS, Wheat, Sorghum and Forage Research Unit,University of Nebraska-Lincoln East Campus

Capítulos

  • 00:04Título
  • 00:36Plant Excavation, Soil Removal, and Bulk Soil Collection
  • 01:46Root and Rhizosphere Collection
  • 02:44Root Surface Sterilization
  • 03:54Processing Rhizosphere Samples
  • 05:02DNA Extraction and Soil Analysis Processing
  • 06:33DNA Extraction in 96-well Format
  • 07:45Rhizosphere Sample Loading
  • 08:47Results: Visualization and Statistical Methods Highlight Differences in Microbial Community Composition and Diversity Between Sample Types and Grass Species
  • 10:03Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Excavation des racines des plantes sur le terrain, ainsi que traitement d’échantillons dans la rhizosphère, endosphère et le sol sont décrites en détail, y compris les méthodes d’analyse de données et extraction de l’ADN. Cet article est conçu pour permettre aux autres laboratoires d’utiliser ces techniques pour l’étude du sol, endosphère et rhizosphère microbiomes.

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Keywords: Microbial CommunitiesSoilRhizosphereRoot EndospherePerennial GrassField ExperimentsSample CollectionSoil SamplingRoot SamplingRhizosphere ExtractionRoot SterilizationMicrobiome Analysis

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