जबकि मल्टीफोटॉन इमेजिंग केवल ऊतक की सतह से सीमित गहराई पर प्रभावी है, पीसीएलई के माध्यम से किसी भी गहराई पर 3 μm रिज़ॉल्यूशन इमेजिंग प्राप्त करना संभव है। यहां, हम आईसीटीऔर जंगली प्रकार के चूहों के हिप्पोकैम्पस में माइक्रोवस्कुलर गतिशीलता को मापने के लिए पीसीईएल इमेजिंग का संचालन करने के लिए एक प्रोटोकॉल प्रस्तुत करते हैं।