Journal
/
Bioquímica
/
Provberedning för Mass Spectrometry-baserade identifiering av RNA-bindande regioner
JoVE Journal
Bioquímica
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Bioquímica
Sample Preparation for Mass Spectrometry-based Identification of RNA-binding Regions
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Provberedning för Mass Spectrometry-baserade identifiering av RNA-bindande regioner

DOI:
10.3791/56004-v

•

10:52 min

•

September 28, 2017

•

, , , ,
1Epigenetics Institute,University of Pennsylvania Perelman School of Medicine, 2Department of Cell and Developmental Biology,University of Pennsylvania Perelman School of Medicine, 3Department of Biochemistry and Biophysics,University of Pennsylvania Perelman School of Medicine, 4Graduate Group in Biochemistry and Biophysics,University of Pennsylvania Perelman School of Medicine

Capítulos

  • 00:05Título
  • 01:04Crosslink of Protein-RNA Interactions in Live Cells
  • 03:26Isolation of Nuclei
  • 04:27Lysis of Nuclei and Trypsin Digestion
  • 05:51Desalting of Peptides
  • 07:39Removal of Crosslinked RNA
  • 08:44Results: RNA-binding Protein and RNA-binding Region Identification
  • 10:04Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Vi beskriver ett protokoll för att identifiera RNA-bindande proteiner och kartlägga deras RNA-bindande regioner i levande celler med hjälp av UV-medierad photocrosslinking och masspektrometri.

Tags

Keywords: Sample PreparationMass SpectrometryRNA-binding ProteinsUV Cross-linking4sU LabelingCell FractionationImmunoprecipitationProtein-RNA InteractionsEpigeneticsCell CultureMouse Embryonic Stem Cells

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

check_url/pt/56004?article_type=v

En Tandem vätskekromatografi-masspektrometri baserad strategi för metabolit analys av<em> Staphylococcus aureus</em
check_url/pt/56004?article_type=v

Fånga och identifiering av RNA-bindande proteiner med hjälp av klick kemi-assisted RNA-interactome Capture (CARIC) strategi
check_url/pt/56004?article_type=v

Identifiering av funktionellt Protein regioner genom chimära Protein konstruktion
check_url/pt/56004?article_type=v

Nitropeptid profilering och identifiering illustrerad av angiotensin II
check_url/pt/56004?article_type=v

Ett plasmaprovförberedelse för masspektrometri med hjälp av en automatiserad arbetsstation
check_url/pt/56004?article_type=v

Provberedning för probe electrospray jonisering Masspektrometri
check_url/pt/56004?article_type=v

Oriktad flytande kromatografi-Mass Pektrometri-Baserade metabolomika analys av vetekorn
check_url/pt/56004?article_type=v

TMT Provberedning för Proteomics Facility Submission och efterföljande dataanalys
check_url/pt/56004?article_type=v

En masspektrometribaserad proteomikmetod för global och högkonfidensprotein R-metyleringsanalys
check_url/pt/56004?article_type=v

Beredning av högtemperaturprovgaller för kryo-EM

Read Article