Journal
/
Genética
/
Transcriptomic ניתוח<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA רצף נתונים באמצעות Suite טוקסידו על פרויקט גלקסי
JoVE Journal
Genética
É necessária uma assinatura da JoVE para visualizar este conteúdo.  Faça login ou comece sua avaliação gratuita.
JoVE Journal Genética
Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Transcriptomic ניתוח<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA רצף נתונים באמצעות Suite טוקסידו על פרויקט גלקסי

DOI:
10.3791/55473-v

•

10:19 min

•

April 08, 2017

•

,
1Department of Pediatrics,University of Pittsburgh School of Medicine, Children’s Hospital of Pittsburgh

Capítulos

  • 00:05Título
  • 00:56Getting Started with Galaxy
  • 03:28Data Analysis with Tuxedo Suite
  • 06:19Gene Ontology (GO) Term Analyses Using DAVID
  • 07:56Results: Transcriptome Dictated by the Transcription Elongation Factor TCER-1, that Extends Lifespan of Germline-less C. elegans
  • 09:39Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

גלקסי והדוד צמחו ככלים פופולריים המאפשרים לחוקרים ללא הכשרה ביואינפורמטיקה לנתח ולפרש נתוני RNA-seq. אנו מתארים פרוטוקול לחוקרי אלגנס לבצע ניסויים-Seq RNA, גישה ולעבד את הנתונים באמצעות גלקסי ולקבל מידע ביולוגי משמעותי מרשימות הגן באמצעות DAVID.

Tags

C. ElegansRNA SequencingTranscriptomic AnalysisTuxedo SuiteGalaxy ProjectBioinformaticsDifferential Gene ExpressionGene OntologyNGS RNA AnalysisFASTQData UploadWorkflow

Article

Embed

ADICIONAR À PLAYLIST

Usage Statistics

Vídeos Relacionados

Optogenetic mutagenesis אקראי באמצעות היסטון-miniSOG ב<em> C. elegans</em

מבחני מזווג Conjugative עבור ניתוח רצף ספציפי של חלבוני העברה מעורבים קוניוגציה

איתור של שינוי מספר העתקה באמצעות רצף תא יחיד

ביטוי ערוץ יון לשליטה באמצעות Transfection ועין מתנהל חלוף

ניתוח של C-KIT ליגנד האמרגן באמצעות Immunoprecipitation הכרומטין

מניפולציה של פלואידיות ב Caenorhabditis elegans

Informatic ניתוח של נתוני רצף אצווה שמרים 2-היברידית המסכים

תא בודד RNA רצף וניתוח של איי הלבלב האנושי

זיהוי של טביעות רגליים של RNA: מכלולי חלבון באמצעות RNA Immunoprecipitation בטנדם ואחריו רצף (RIPiT-Seq)

זיהוי של RNAs מעגלית באמצעות רצפי RNA

Read Article