Journal
/
생화학
/
JUMPn: تطبيق مبسط لتجميع التعبير المشترك للبروتين وتحليل الشبكة في البروتينات
JoVE 신문
생화학
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 생화학
JUMPn: A Streamlined Application for Protein Co-Expression Clustering and Network Analysis in Proteomics
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

JUMPn: تطبيق مبسط لتجميع التعبير المشترك للبروتين وتحليل الشبكة في البروتينات

DOI:
10.3791/62796-v

•

07:28 min

•

October 19, 2021

•

, , , , , , , ,
1Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology,St. Jude Children’s Research Hospital, 2Center for Proteomics and Metabolomics,St. Jude Children’s Research Hospital, 3Department of Computational Biology,St. Jude Children’s Research Hospital

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:03Setup of JUMPn Software
  • 01:31Demo Run Using an Example Dataset
  • 06:04Results: Workflow of JUMPn Software and the Protein-Protein Interaction Database
  • 07:00Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

نحن نقدم أداة بيولوجيا النظم JUMPn لإجراء وتصور تحليل الشبكة لبيانات البروتينات الكمية ، مع بروتوكول مفصل بما في ذلك المعالجة المسبقة للبيانات ، وتجميع التعبير المشترك ، وإثراء المسار ، وتحليل شبكة التفاعل بين البروتين والبروتين.

Tags

Protein Co-expressionClusteringNetwork AnalysisProteomicsJUMPn SoftwareCo-expression ClusteringPathway EnrichmentPPI Module DetectionUser-friendly InterfaceInteractive VisualizationPhosphoproteomicsInteractome DataWGCNA AlgorithmCo-expression PatternsTrends PlotPathway Ontology Enrichment Heatmap

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

طريقة لتحديد الصغيرة جزيء مثبطات التفاعل البروتين البروتين بين HCN1 وTRIP8b

الدهون عزل القطرة عن التحليل الكمي الطيف الكتلي

البروتين خارج الخلية ميكرواري تكنولوجيا للكشف عن ارتفاع الإنتاجية منخفضة تقارب مستقبلات-يجند التفاعلات

إعداد الأقسام الفرعية بلاستيدات الخضراء من نبات لتحليل البروتين التعريب Immunoblotting أو البروتيوميات

تحليل لطي البروتين، والنقل، وتدهور في الخلايا الحية بمطاردة نبض المشعة

الكشف عن مواقع اكتشاف البروتين من قبل إثراء الببتيد وقياس الطيف الكتلي

تطبيق قياس التداخل الحيوي (BLI) لدراسة تفاعلات البروتين والبروتين في النسخ

القياس الكمي لديناميات شبكة تفاعل البروتين باستخدام الترسيب المناعي المشترك المتعدد

PeptiQuick ، خطوه واحده لدمج البروتينات الغشائية في أقراص البيتيلات الحيوية لاختبارات ربط البروتين الانسيابية

إعداد عينة TMT لتقديم مرافق Proteomics وتحليل البيانات اللاحقة

Read Article