Journal
/
유전학
/
Ett pathway association-studieverktyg för GWAS-analyser av information om metaboliska vägar
JoVE 신문
유전학
This content is Free Access.
JoVE 신문 유전학
A Pathway Association Study Tool for GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Ett pathway association-studieverktyg för GWAS-analyser av information om metaboliska vägar

DOI:
10.3791/61268-v

•

05:01 min

•

July 01, 2020

•

,
1Institute for Genomics, Biocomputing & Biotechnology,Mississippi State University, 2Corn Host Plant Resistance Research Unit,USDA-ARS

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:32Genome-Wide Association Study (GWAS) Data Loading
  • 00:57Load Linkage Disequilibrium (LD) Data Loading
  • 01:26Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Assignment
  • 01:56Significant Pathway Discovery
  • 02:35Rugplot Visualization
  • 03:21Results: Representative GWAS Analyses of Metabolic Pathway Information
  • 04:21Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Genom att köra Pathway Association Study Tool (PAST), antingen genom Shiny-applikationen eller genom R-konsolen, kan forskare få en djupare förståelse för den biologiska betydelsen av deras genomomfattande associationsstudie (GWAS) resultat genom att undersöka de metaboliska vägarna.

Tags

GWASGenome-wide Association AnalysisMetabolic PathwayPASTPathway Association Study ToolSNPsLinkage DisequilibriumGene AnnotationPathway AnalysisRug PlotsR ConsoleShiny

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

Mätning av Differentiellt Methylated<em> INS</em> DNA Arter i humana serumprover som en biomarkör för Islet β celldöd

Kvantifiering av Information kodas av genen uttryck nivåer under livslängden modulering enligt bred-range kosttillskott begränsning i C. elegans

Metaboliska märkning och profilering av överföring RNAs använder Macroarrays

Ultralåga ingående Genome Sequencing bibliotek förberedelse från enda Tardigrade prov

Metodik för korrekt upptäckt av mitokondrie-DNA metylering

Hög genomströmning identifiering av reglerande gensekvenser som använder nästa generations sekvensering av cirkulär kromosom konformation fånga (4C-seq)

Kromogent in situ hybridisering SS ett verktyg för HPV-relaterade huvud och hals cancer diagnos

Navigera i MARRVEL, ett webbaserat verktyg som integrerar Human Genomics och Modellorganismens gen etik information

Mass Spectrometry-baserad proteomik analyser med hjälp av databasen OpenProt att avslöja nya proteiner översatt från icke-kanoniska öppen läsning ramar

En metod för att studera de Novo bildandet av kromatin domäner

Read Article