Червь выравнивания и Worm_CP, два трубопровода с открытым исходным кодом для выпрямления и количественной оценки флуоресценции изображения данных, полученных от Caenorhabditis elegans
5,654 Views
•
11:16 min
•
May 28, 2020
DOI:
Summary
Automatically generated
Worm-align/Worm_CP - это простой рабочий процесс FIJI/CellProfiler, который может быть использован для выпрямления и выравнивания образцов Caenorhabditis elegans и оценки анализа изображений на основе всего червя без необходимости предварительного обучения. Мы применили Worm-align/Worm_CP к количественной оценке теплового шока индуцированного выражения у живых животных или липидных капель в фиксированных образцах.
Read Article
Cite this Article
Okkenhaug, H., Chauve, L., Masoudzadeh, F., Okkenhaug, L., Casanueva, O. Worm-align and Worm_CP, Two Open-Source Pipelines for Straightening and Quantification of Fluorescence Image Data Obtained from Caenorhabditis elegans. J. Vis. Exp. (159), e61136, doi:10.3791/61136 (2020).
Copy