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Analyse à haut débit des données de cartographie optique à l'aide d'ElectroMap
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High-Throughput Analysis of Optical Mapping Data Using ElectroMap
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Analyse à haut débit des données de cartographie optique à l'aide d'ElectroMap

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07:36 min

•

June 04, 2019

DOI:

10.3791/59663-v

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10.3791/59663-v

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07:36 min
June 04, 2019

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1Institute of Cardiovascular Sciences,University of Birmingham, 2EPSRC Centre for Doctoral Training in Physical Sciences for Health, School of Chemistry,University of Birmingham, 3School of Computer Science,University of Birmingham, 4Institute of Clinical Sciences,University of Birmingham, 5Institute of Microbiology and Infection, School of Biosciences,University of Birmingham

Summary

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Ce protocole décrit la configuration et l'utilisation d'ElectroMap, une plate-forme logicielle open source basée sur MATLAB pour l'analyse des données de cartographie optique cardiaque. ElectroMap fournit un outil polyvalent à haut débit pour l'analyse de la tension de cartographie optique et des ensembles de données de calcium à travers un large éventail de modèles expérimentaux cardiaques.

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Optical MappingCardiac ResearchElectrophysiology DataElectroMapMulti-arrayFluorescent DyesAction Potential DurationConduction VelocitySignal ProcessingRegion Of InterestThresholdMATLABHigh-throughput Analysis

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O’Shea, C., Holmes, A. P., Yu, T. Y., Winter, J., Wells, S. P., Parker, B. A., Fobian, D., Johnson, D. M., Correia, J., Kirchhof, P., Fabritz, L., Rajpoot, K., Pavlovic, D. High-Throughput Analysis of Optical Mapping Data Using ElectroMap. J. Vis. Exp. (148), e59663, doi:10.3791/59663 (2019).

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