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Chapters
- 00:04Title
- 01:10Preparation of MALDI Target Plates and Data Acquisition
- 02:02Installing the IDBac Software and Starting with Raw Data
- 02:47Work with Previous Experiments
- 03:22Setting up Protein Data Analysis and Creating Mirror Plots
- 04:07Clustering Samples Using Protein Data
- 04:49Customizing the Protein Dendrogram and Inserting Samples from a Separate Experiment into the Dendrogram
- 05:32Analyzing Specialized Metabolite Data and Metabolite Association Networks (MANs)
- 06:51Results: Analysis of Microbial Protein and Specialized Metabolite Data by IDBac
- 08:28Conclusion
IDBac est un pipeline bioinformatique à base de spectrométrie de masse open source qui intègre des données provenant à la fois de protéines intactes et de spectres de métabolites spécialisés, recueillis sur des matériaux cellulaires extraits de colonies bactériennes. Le pipeline permet aux chercheurs d'organiser rapidement des centaines à des milliers de colonies bactériennes en groupes taxonomiques putatifs, et de les différencier davantage en fonction de la production spécialisée de métabolites.
