Her presenterer vi en protokoll for å optimalisere CRISPR-Cas9 for å oppnå en høyere spesifisitet uten tap av på målet aktivitet. Vi bruker en rettet utviklingen tilnærming kalt Sniper-skjermen for å finne en mutant Cas9 med de ønskede egenskapene. Sniper-Cas9 er kompatibel med avkortede single-guide RNAs og levering i et ribonucleoprotein format, kjente strategier for å oppnå høyere særegenheter.