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Segmentación de volumen y análisis de materiales biológicos con SuRVoS (Super-región segmentación de volumen) Workbench
JoVE 신문
생물학
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JoVE 신문 생물학
Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench

Segmentación de volumen y análisis de materiales biológicos con SuRVoS (Super-región segmentación de volumen) Workbench

DOI:

11:38 min

August 23, 2017

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Chapters

  • 00:05Title
  • 00:53Preparing the Workplace, Data Representation, and Generating Appropriate Super-regions
  • 03:19Introduction to Annotation
  • 04:12Segmentation Using Model Training
  • 05:41Segmentation Using Super-regions
  • 06:42Classifiction and Analysis of Data Objects Based on Inherent Characteristics
  • 09:00Results: Model Training, Super-region Segmentation, and Label Splitting Using the SuRVoS Workbench
  • 10:55Conclusion

Summary

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Segmentación de datos tridimensionales de muchas técnicas de imagen es un cuello de botella importante en análisis de sistemas biológicos complejos. Aquí, describimos el uso de SuRVoS Workbench datos volumétricos de segmento semi-automáticamente en varias escalas de longitud utilizando conjuntos de datos de ejemplo de tomography del cryo-electrón, cryo suave tomografía de rayos x y técnicas de tomografía de rayos x de contraste de fase.

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