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Chapters
- 00:05Title
- 02:21Running the I-TASSER Server
- 03:37Structure Analysis
- 05:58LOMETS Target Template Alignment
- 07:30Structural Analogs in PDB and Enzyme Commission Number Prediction
- 09:20Gene Ontology (GO) Term and Protein-ligand Bind site Predictions
- 12:05Representative I-TASSER Results
- 15:43Conclusion
Diretrizes para computador baseado caracterização estrutural e funcional da proteína usando o pipeline I-TASSER é descrito. A partir de seqüência de proteína de consulta, os modelos 3D são gerados usando vários alinhamentos threading e iterativo simulações de montagem estrutural. Inferências funcionais são posteriormente elaborado com base em correspondências às proteínas com estrutura conhecida e funções.
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ProtocolComputer-basedProtein StructureFunction PredictionGenome Sequencing ProjectsProtein SequenceStructure And Function KnowledgeExperimental MethodsComputational ModelingI-TASSER ServerSecondary Structure PredictionSolvent Accessibility PredictionHomologous Template ProteinsStructure AlignmentsTertiary Structural ModelsStructure-based Functional AnnotationsConfidence ScoreEnd UsersUser-specified Inter-residue DistanceContact MapsI-TASSER ModelingTemplate ProteinsStructure Assembly Simulations
