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Un protocole pour la structure des protéines Computer-Based et prédiction de la fonction
JoVE 신문
생물학
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JoVE 신문 생물학
A Protocol for Computer-Based Protein Structure and Function Prediction
DOI:

16:41 min

November 03, 2011

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Chapters

  • 00:05Title
  • 02:21Running the I-TASSER Server
  • 03:37Structure Analysis
  • 05:58LOMETS Target Template Alignment
  • 07:30Structural Analogs in PDB and Enzyme Commission Number Prediction
  • 09:20Gene Ontology (GO) Term and Protein-ligand Bind site Predictions
  • 12:05Representative I-TASSER Results
  • 15:43Conclusion

Summary

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Lignes directrices pour l'informatique basée caractérisation structurale et fonctionnelle de protéines en utilisant le pipeline I-Tasser est décrite. A partir de la séquence protéique de requête, les modèles 3D sont générés à l'aide de plusieurs alignements de filetage et itératif des simulations assemblage structural. Inférences fonctionnelles sont ensuite tirées à partir des matches à protéines avec une structure connue et fonctions.

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