Cancer stamceller (CSCs) har identifierats i ett flertal maligniteter. I detta protokoll beskriver vi en flödescytometrisk metod att utnyttja aktivitet aldehyddehydrogenas och CD44 och CD24 uttryck för att isolera CSCs från mänsklig xenografter pankreas adenocarcinom. Dessa livsdugliga celler kan sedan användas i funktionella och analytiska studier.