Burada, çift odacıklı, geçirgen bir destek sisteminde köpek bağırsak organoidlerinin kültürünü tanımlayan bir protokol sunuyoruz. Geçirgen desteklerde organoid tohumlama, tek katmanlı bakım ve ardından ilaç geçirgenliği deneyleri anlatılmaktadır.
Geçirgen destek sistemi tipik olarak geleneksel iki boyutlu (2D) hücre hatları ile birlikte, yeni terapötik ilaç adaylarının oral geçirgenliğini değerlendirmek için in vitro bir araç olarak kullanılır. Bununla birlikte, bu geleneksel hücre hatlarının kullanımı, sıkı bağlantıların değiştirilmiş ekspresyonu, kısmi hücre farklılaşması ve anahtar nükleer reseptörlerin yokluğu gibi sınırlamalara sahiptir. Bu eksikliklere rağmen, Caco-2 ve MDCK modelleri, insan in vivo oral geçirgenliğinin tahmini için yaygın olarak kabul edilmekte ve doğrulanmaktadır.
Köpekler, gastrointestinal anatomi ve bağırsak mikroflorasındaki insanlarla benzerlikleri nedeniyle biyomedikal araştırmalar için uygun bir translasyonel modeldir. Buna göre ve paralel ilaç geliştirmeyi desteklemek için, hem köpeklerde hem de insanlarda in vivo ilaç geçirgenlik özelliklerini tahmin etmek için etkili ve doğru bir in vitro aracın detaylandırılması oldukça arzu edilmektedir. Böyle bir araç, yetişkin kök hücrelerden türetilen üç boyutlu (3D), kendiliğinden monte edilmiş epitel yapıları ile karakterize edilen köpek bağırsak organoid sistemi olabilir.
(1) Geçirgen Destek Tohumlama Protokolü, eklerdeki köpek organoidlerinin ayrışması ve tohumlanması için deneysel yöntemleri açıklar. Köpek organoid izolasyonu, kültürü ve hasadı daha önce bu özel sayıda ayrı bir protokol setinde açıklanmıştır. Köpek bağırsak organoid monokatmanının genel bakımı için yöntemler (2) Tek Katmanlı Bakım Protokolü’nde ayrıntılı olarak tartışılmıştır. Ek olarak, bu protokol, transepitelyal elektrik direnci (TEER) ölçümleri ve ışık mikroskobu yoluyla tek katmanın yapısal bütünlüğünü değerlendirmek için yöntemleri açıklamaktadır. Son olarak, (3) Geçirgenlik Deney Protokolü, deneysel sonuçların in vitro doğrulaması da dahil olmak üzere, bir deneyden hemen önceki görevleri tanımlar.
Genel olarak, köpek organoid modeli, çift odacıklı bir hücre kültürü teknolojisi ile birleştirildiğinde, 2D deneysel modellerle ilişkili sınırlamaların üstesinden gelir, böylece hem köpek hem de insan hastada terapötik ilaç adaylarının görünür oral geçirgenliğinin tahminlerinin güvenilirliğini arttırır.
Geçirgen destek sistemleri tipik olarak terapötik ilaç adaylarının bağırsak epitel bariyeri 1,2 yoluyla görünür geçirgenliğini belirlemek için kullanılır. Ayrıca hücresel sekresyon3, hücre göçü4 ve ilaç toksisitesi5’i değerlendirmek için de kullanılabilirler. In vitro oral ilaç geçirgenlik testleri, ilaç keşif ve geliştirme süreci2’de önemli bir adımdır ve bireysel ilaç adayları ilaç Ar-Ge yaşam döngüsünün erken aşamasında test edilmektedir6. Geçirgen destek sistemi, çok kuyulu bir plakaya yerleştirilmiş yarı gözenekli bir zara sahip bir uçtan oluşan çift odacıklı bir hücre kültürü aparatıdır. Bu sistem, kesici uç7’de yetiştirilen bir hücre monokatmanının apikal ve bazolateral taraflarına doğrudan erişim sağlar. Bu sistemlerde kullanılan tek katmanlı tipik olarak gastrointestinal epitel hücrelerinden (örneğin, insan kolorektal adenokarsinomu Kako-2 hücre hattı)8 türetilir. Hücre kültürleri, bağırsak epitel hücrelerinin doğal mikromimarisini taklit eden polarize bir durumda büyür ve daha fazla hücresel farklılaşma, benzer mikroanatomi ve işlev7’yi mümkün kılar. Geçirgen destek ekinin ayrıntıları Şekil 1’de bulunabilir. Geleneksel olarak bağırsak ilaç geçirgenliğini değerlendirmek için kullanılan 2D hücre kültürlerine sahip eklerin tohumlanması, nispeten uygun fiyatlı ve kültür9’a kolaydır. Bu sistemler, terapötik ilaç adaylarının bağırsak metabolizmasını tahmin etme kapasitelerinin sınırlı olması da dahil olmak üzere birkaç önemli sınırlama sunar10,11. Bu, epitel hücreleri arasındaki sıkı kavşaklardan pasif emilim, efflux yoluyla aktif transepitelyal absorpsiyon veya alım taşıyıcıları (örneğin, P-glikoprotein, monokarboksilat taşıyıcı 1) ve enterositler tarafından metabolize edilen ilaçlar gibi tüm ilaç emilim mekanizmaları için geçerlidir.
Köpekler insanlarla ortak bir ortamı ve diyeti paylaşırlar12. Köpek bağırsak anatomisi ve mikrobiyom bileşimi, son 36.000 yılda evcilleştirmeye ve paylaşılan diyetlere atfedilen 13 insanlarınkine çok benzemektedir14. Ne yazık ki, bu benzerlikler hastalık gelişimi için yaygın nedenler / tetikleyiciler de olabilir. Köpekler, obezite 15, inflamatuar bağırsak hastalığı 16, kolorektal adenokarsinom17, gastrointestinal stromal tümör (GİST)18 ve göreceli uzun ömürlülükleri 19 ile ilişkili diğer çeşitli patolojiler gibi insanlara benzer kronik morbiditeler geliştirir. Buna göre, köpek organoidleri, Tek Sağlık Girişimi20’nin ruhuna uygun olarak bu kronik multifaktöriyel hastalıkların ters translasyonel araştırması için başarıyla kullanılabilir.
Kako-2 hücreleri, ilaç oral absorpsiyon tahlilleri21 için en çok kullanılan hücre hatlarıdır. Bu hücreler şu anda in vitro bağırsak geçirgenlik testleri2,22,23 için “altın standart” model olarak kabul edilmektedir. Caco-2 hücre hattı, insan bağırsak sisteminde bulunan efflux ve alım taşıyıcılarını ifade eder, ancak farklı ekspresyon seviyelerinde24,25,26. Kako-2 hücreleri ayrıca bir ilacın bağırsak efflux taşıyıcılarının bir substratı mı yoksa inhibitörü mü olduğunu belirlemek için model olarak yaygın olarak kullanılmaktadır22,27. Caco-2 hücreleri kolonik kökenli olmasına rağmen, bir enterosit hücresini taklit ederler. Ne yazık ki, Caco-2 hücreleri, ince bağırsak9’un epitel tabakasından sadece bir hücre tipini temsil eder, bu da karmaşık bağırsak epitel hücre tipi bileşimini doğru bir şekilde özetleyemez. Örneğin, mukus üretimine adanmış kadeh hücreleri Kako-2 kültürlerinde yoktur, böylece mukus-ilaç etkileşimleri diğer hücre hatları28 ile kokültür olmadan değerlendirilemez. Ayrıca, Caco-2 kültürleri, gebelik X reseptörü (PXR), steroid X reseptörü (SXR) ve kurucu androstan reseptörü (CAR)29 gibi bağırsakta tipik olarak bulunan önemli nükleer reseptörlerin birkaçını ifade etmez. Sonuç olarak, Kako-2 kültürleri, bu reseptörlerin indükleyicileri olan bazı ilaçlar (örneğin, rifampin) tarafından ilaç taşıyıcılarının ve enzimlerinin indüksiyonunu modellemede başarısız olurlar30.
3D intestinal organoid teknolojisi bu sınırlamaların bazılarını ele alır19. Organoidler, mikroinvaziv teknikler kullanılarak toplanan doku örneklerinden oluşturulabilen yetişkin kök hücrelerden elde edilen kendiliğinden monte edilmiş yapılardır20. İnsan kaynaklı pluripotent kök hücreler bağırsak geçirgenlik modelleri için kullanılmaktadır31,32. Köpek organoidleri, insan organoidlerine uygun bir alternatif sağlar, çünkü insan kök hücre araştırması etik konularla sınırlıdır33. Ayrıca, köpek organoidleri, köpek ilacı geçirgenliğini, metabolizmasını, aktif taşınmasını ve ilaç-ilaç etkileşimlerini keşfetmek için in vitro bir sistem sağlar. Bu teknoloji boşluğunu gidermek için, geçirgen bir destek sisteminde köpek bağırsak organoidlerinin tutarlı ve güvenilir büyümesi tanımlanmıştır34. Köpek bağırsak organoidleri ile yapılan bir geçirgenlik testi, şu anda kullanılan testlere (Caco-2) kıyasla köpek bağırsak geçirgenliğini ve küçük ilaç moleküllerinin metabolizmasını potansiyel olarak öngörebilir. Bu önemli özelliklerin doğrulanması, bu yeni in vitro sistemi, indükleyicilerin hücre içi metabolizma ve aktif taşıma üzerindeki potansiyel etkisini araştıran gelecekteki çalışmalara ödünç vermektedir.
Köpek organoidleri, tipik olarak bağırsağın epitel tabakasında bulunan tüm hücre tiplerinden oluşur. İşlevsel ve mikroanatomik bir bakış açısıyla, köpek bağırsağının epitel tabakasının ortamını güvenilir bir şekilde çoğaltırlar19,35. Ayrıca, mukus, köpeklere özgü ilaç taşıyıcıları ve enzimlerin varlığı ve köpek bağırsak organoidlerinde genel hücresel farklılaşma, köpeklerde in vivo olarak görülenlerle karşılaştırılabilir34. Böylece, organoidler hastalıklı veteriner hastalardan izole edilebilir ve çeşitli hastalık süreçlerinin (örneğin, kronik bağırsak iltihabı) köpek oral ilaç geçirgenliği üzerindeki etkisini modellemek için kullanılabilir19,36. Köpek bağırsak organoid sistemi, ilaç geçirgenlik deneylerinden başka ortamlarda da kullanılabilir. Bu 3D yapılar, Chandra ve ark. tarafından daha önce tanımlandığı gibi hastalıklı hastalardan izole edilebilir. inflamatuar bağırsak hastalığı, kolorektal adenokarsinom ve gastrointestinal stromal tümör19.
Geçirgen Destek Tohumlama Protokolü, eklerde köpek bağırsak organoid kültürleri oluşturma yöntemlerini açıklar. Bu ilk protokol, hücre dışı membran matrisinde kaplanmış yerleşik köpek organoid kültürlerini ayrıştırma yöntemlerini özetlemektedir. Ayrıca, eklerin kollajen I ve hücre dışı membran matrisi ile ön kaplaması bu protokolde tartışılmıştır. Köpek organoidlerinin geçirgen destek uçlarına gömülmesi de ayrıntılı olarak açıklanmaktadır.
İkinci protokol, bir kesici uçta kaplanmış köpek 3D organoidlerinin genel bakımını içeren Tek Katmanlı Bakım Protokolüdür. Kültürü yenilemek için kullanılan organoid ortamın sıklığı ve hacimleri ve hücre kültürü hasarını önlemenin yolları, epitel tek katmanının akıcılığını değerlendirmek için deneysel yöntemlerle birlikte bu ikinci protokolde sunulmaktadır.
Son olarak, Geçirgenlik Deneysel Protokolü, bir geçirgenlik testindeki köpek bağırsak 3D organoidlerinin deneysel kullanıma hazır olup olmadığını ve herhangi bir deney yapmadan önce gerekli doğrulama adımlarını belirlemenin yollarına odaklanmaktadır. Bu bölüm ayrıca, tek katmanlı kültürün odalarında terapötik ilaç adaylarının inkübasyonu ve örneklemesi ile birlikte bir geçirgenlik deneyinin kurulumunu ve başarılı bir şekilde yürütülmesini açıklamaktadır. Tek katmanlı bütünlüğü izlemek için düşük geçirgenliğe sahip floresein izotiyosiyanatın (FITC-dextran) kullanımı da tartışılmaktadır. Son olarak, bir deneyin sonuçlanmasından sonra sonuçları doğrulamak için in vitro bir değerlendirme yöntemi açıklanmaktadır. Geçirgenlik deneyleri son derece geniş bir konudur ve Hubatsch ve ark.37 tarafından çok iyi özetlenmiştir. Protokollerin iş akışı Şekil 2’de özetlenmiştir.
Şekil 1: Geçirgen bir destek sistemi üzerindeki köpek bağırsak organoidleri. Geçirgen destek kesici ucu, 24 delikli bir plakanın kuyuğuna yerleştirilmiştir. Mikro gözenekli membran, ayrışmış köpek bağırsak organoidlerinin tohumlanmasına izin verir ve bu hücreler sonunda bir organoid 2D tek katman oluşturur. Bu teknoloji, tek katmanın hem AP hem de BL taraflarına erişim sağlar. Organoid ortam, geçirgen desteğin hem AP hem de BL odalarına sokulur. İlaç adayının absorpsiyonu (AP→BL) ve sekresyonu (BL→AP) ve iki olası ilaç taşıma şekli gösterilmiştir. Kısaltmalar: AP = apikal; BL = bazolateral. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 2: Köpek organoid geçirgen destek protokollerinin iş akışı. Geçirgen destek parçası, hücre dışı membran matrisi ve kollajen I karışımı ile önceden kaplanır ve 1 saat boyunca inkübe edilir. Kuluçka işlemi sırasında, organoid kültür ayrışır. Bireysel organoid hücreler ekte tohumlanır, bazolateral odadaki ortam tohumlamadan hemen sonra eklenirken, tohumlama işlemi tamamlandıktan 24 saat sonra apikal odaya orta eklenir. Organoidlerin bakımı ve izlenmesi, düzenli ortam değişikliklerini, TEER değer ölçümlerini ve tek katmanın bütünlüğünü değerlendirmek için ışık mikroskobunu içerir. Deneyden önce, organoidler ROCK inhibitörü ve GSKiβ’yi ortamdan çıkararak ayırt edilmelidir. TEER değerleri deney gününde ölçülür ve organoid tek katmanlı hücrelere zarar vermek için ışık mikroskobu ile incelenir. Ortam daha sonra uygun bir tampon ile değiştirilir ve deneyden önce inkübe edilir. FITC-dextran testi, bağırsak geçirgenlik deneyleri39 sırasında tek katmanlı bütünlüğün bir belirteci olarak kullanılır. TEER ölçümleri deneyden sonra alınır ve ışık mikroskobu 24 saat sonra sonuçları doğrular. Kısaltmalar: TEER = transepitelyal elektrik direnci; ROCK = rho ile ilişkili kinaz; GSKiβ = glikojen sentaz kinaz beta; F = floresan. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Geçirgen destek cihazındaki köpek bağırsak organoid kültürleri, geleneksel ilaç geçirgenlik tahlilleri40’ı yeni bir in vitro köpek modeli41 ile birleştiren benzersiz bir kavramdır. Farklı köpek bağırsak organoidleri türleri, minimum ayarlamalarla deneyin amacına göre kullanılabilir ve değerlendirilebilir. İlgilenilen ilacın çoklu konsantrasyonlarının grup başına 3-4 kuyuda test edilmesi önerilir. Konsantrasyonlar, ilacın beklenen bağırsak konsantrasyonuna dayanabilir. Ayrıca, önceki araştırmaları kullanmak, çalışma tasarımı için uygun zaman noktalarının belirlenmesine yardımcı olabilir. Tekrarlanabilirliği artırmak ve sorun gidermeye yardımcı olmak için çalışma tasarımının uygun dokümantasyonu yapılmalıdır.
Bu teknolojinin, yöntem42’nin yeniliği nedeniyle, çoğunlukla deneysel tasarımda standardizasyon eksikliği ve protokolün laboratuvarlar arasında yürütülmesi nedeniyle çeşitli sınırlamaları vardır. Bu standardizasyon eksikliği diğer grup43 tarafından kabul edilmiştir ve Köpek 3D Organoid Tek Katmanlı Protokolleri laboratuvarlar arası tekrarlanabilirliğe yol açacak ve bu sisteme standardizasyon getirecektir. Veri analizine standartlaştırılmış yaklaşımlar tekrarlanabilirliği artırır ve farklı laboratuvarlarda geçirgen destek sistemindeki köpek organoidlerini kullanarak ön uyuşturucu testinin sonuçlarını güçlendirebilir. Köpek 3D organoid modeli ayrıca, model ilaçların in vitro Puygulama değerlerini, Caco-2 hücreleri44,45,46 gibi, bilinen insan veya köpek in vivo bağırsak emilimiyle karşılaştıran veri setlerinden yoksundur. Bu tür veriler üretildikten sonra, bu köpek organoid modeli, ilaç geliştirme sırasında bağırsak geçirgenliğini değerlendirmek için kullanılabilir.
Organoidleri geçirgen destek sistemine tohumlarken, uygun şekilde ayrışmış hücrelerin yeterince yüksek bir yoğunluğunu tohumlamak için dikkatli olunması çok önemlidir. Sistemin TEER değerleri, katı monokatmanlar halinde yetiştirildiğinde daha güvenilir ve tekrarlanabilir. Tek katmanların uzun süreli kültürü, TEER değerlerinde bağırsağın fizyolojik değerlerinden daha uzağa ulaşan üstel bir artışa yol açabilir. Bu tür 3D yapıların H & E bölümleri daha sonra zara daha yakın enterositlerin değiştirilmiş yapıları ile birbirlerinin üzerinde birkaç hücre katmanı gösterir.
Köpek bağırsak organoid monokatmanının başarılı bir şekilde genişlemesinden sonra, sonuçlar bir ilacın görünür geçirgenlik katsayısı (Puygulaması) formülü44 hesaplanarak geleneksel 2D hücre tahlilleriyle aynı şekilde analiz edilebilir. Puygulaması değeri (bkz. Eq (2)), hücresel tek katmanlı47 boyunca taşıma hızını tanımlar.
(2)
Bu , konsantrasyonun zaman eğrisine karşı başlangıç eğimidir (örneğin, nmol / s). A , kesici ucun alanıdır (cm2) ve C0 , donör odasındaki ilacın veya bileşiğin başlangıç konsantrasyonudur37. Tek katmanlı bütünlüğün güvenilir bir şekilde tanınması, standardizasyon gerektiren geçirgenlik testinin çok önemli bir parçasıdır. Geçirgen bir destek sistemindeki köpek organoidlerini değerlendirmek ve deneyin doğru zamanlamasını belirlemeye yardımcı olmak için ışık mikroskobu ve TEER ölçümleri önerilir. Ek olarak, sıfır moleküler geçirgenlik belirteçleri (örneğin, FITC-dextran, Lucifer sarısı, PEG-400) organoid tek katmanlı bütünlüğü fonksiyonel olarak değerlendirmek için kullanılabilir. Test edilen bileşiğin bir taşıyıcıdan etkilenmesi durumunda dikkat edilmelidir. P-glikoprotein (P-gp) yaygın bir efflux pompası örneği olarak kullanılır. İyi bilinen bir P-gp prob substratı ile karşılaştırıldığında bir efflux oranı (Puygulaması, BL-AP / Puygulaması, AP-BL) oluşturulmalıdır.
Işık mikroskobu (düz veya faz kontrastı ile güçlendirilmiş), olası hücresel aşırı büyümeyi değerlendirirken 2D veya 3D tek katmanın ve filtre ekinin bütünlüğünü kontrol etmek için paha biçilmez bir yöntemdir. Şekil 7 , sağlıklı köpek bağırsak organoid hücre kültürlerini tanımak için bir rehber görevi görebilir. TEER değerleri, hücreler arası bileşkelerin oluşumunun ve organoid kültürlerin sağlam bir bağırsak epiteline farklılaşmasının önemli bir ölçüsüdür. Köpek bağırsak organoidleri enterositlere ve kadeh hücrelerine farklılaşır (Şekil 6). Bu mukus üreten hücreler, geleneksel 2D hücre kültürleri kullanılarak elde edilmesi zor olan ilaç-mukus etkileşimlerinin incelenmesine izin verir48. Enteroendokrin hücrelerin varlığı daha önce Chandra ve ark.33 tarafından köpek bağırsak organoidlerinde doğrulanmıştır.
TEM kullanılarak jejunal, ileal ve kolonik organoidlerden türetilen köpek organoid monokatmanlarının daha fazla karakterizasyonu sağlanmaktadır. TEM görüntüleri, sıkı kavşaklar ve mikrovillus oluşumu da dahil olmak üzere hücresel mikromimariyi göstererek, bu organoid modellerin translasyonel tıptaki karmaşıklığını ve kullanışlılığını daha da göstermektedir. Deney sonuçlarına dayanarak, geçirgen destek üzerindeki organoid kültürler, tohumlama sonrası 11. ve 13. günler arasında deneye hazırdı (Şekil 9). Bu zaman noktasındaki TEER değerleri 1.500 ila 2.500Ω.cm2 arasında değişmiştir. TEER değerlerinin plato aşaması, TEER değerleri yavaş yavaş düşmeye başlamadan önce deneyin başlatılması gereken çok sınırlı bir zaman dilimi boyunca sürer. TEER değerleri, bazı ilaçlar veya ilaç ürünü eksipiyanları tek katmanla (örneğin, sıkı bağlantılar) etkileşime girebileceğinden, TEER değer okumalarını büyük ölçüde etkileyebileceğinden, önemli deneysel sonuçların gösterilmesinin önemli bir parçası olabilir. Bu tek başına bir deneme için veri görevi görebilir.
Çift odacıklı bir hücre kültürü aparatındaki köpek bağırsak organoidleri, ortaya çıkan hücre tek katmanının benzersiz mimarisi nedeniyle oral ilaç geçirgenliği dışındaki alanlarda uygulanabilir. Örneğin, mikrobiyoloji araştırmalarında (örneğin, GI mikrobiyal florasını değiştirmenin etkisi), viral alım çalışmalarında, ilaç-ilaç etkileşimlerinde ve ilaç taşıma mekanizmalarında kullanılabilirler49. Donör odası tipik olarak test ilacı veya tercih edilen bileşik ile doldurulur ve alıcı odasından alikotlar çeşitli zaman noktalarında alınır. Bu alikotlar, yüksek performanslı sıvı kromatografisi, kütle spektrometrisi, enzime bağlı immünosorbent testi veya çözünenin tek katmana nüfuz ettiği miktarı ve hızı belirlemek için diğer teknikler kullanılarak analiz edilebilir.
Bu çalışmalar, ilaç geçirgenliğini doğru bir şekilde değerlendirmek için sağlam bir tek katman gerektirir. Bu tipik olarak, kullanılamaz kuyuları hesaba katmak için gerekli olanlardan daha fazla monokatman yetiştirmeyi gerektirir. Organoid hücre monokatmanları, bir monokatmanın apikal veya bazal tarafından viral alımı ölçmek için de kullanılabilir; virüsün hücresel alımını tespit etmek için immünofloresan tahlilleri kullanan antikorları içeren okumalar da kullanılabilir. Son olarak, taşıyıcı bazlı ilaç-ilaç etkileşimlerini tanımlamak için donör odasına birden fazla ilaç (yani, substrat ve inhibitör) uygulanabilir.
Mevcut gözlemlere dayanarak, bu yöntemler sadece kültür eklerindeki köpek organoidlerine uygulanmakla kalmayacak, aynı zamanda diğer veteriner türleri ve organ sistemleri için de uygun olacak ve tercih edilen türlere veya organ modeline en uygun şekilde uyacak küçük değişiklikler yapılacaktır. Köpek bağırsak organoid büyümesi için protokoller, kültürün benzersiz özelliklerine göre ayarlanmalıdır. Böylece, protokol başka bir türe göre ayarlanabilir, ancak protokolde ince değişiklikler gerektirecektir. Modifikasyonlar, hücre tohumlama yoğunluğundaki değişikliklerle başlayabilir ve ilgilenilen organoidleri düzgün bir şekilde ayırt etmek için ortam bileşimindeki değişikliklere genişleyebilir.
Standardizasyon, deneysel prosedürlerin ayrıntılı dokümantasyonu ve hücre monokatmanlarının tutarlı bir şekilde izlenmesi, geçirgen destek tahlillerinde ihtiyaç duyulan çok önemli uygulamalardır ve köpek sistemi ile sınırlı değildir. Bu olası türler veya organ modifikasyonları, alandaki daha ileri ilerlemeler için belgelemek ve raporlamak için kritik öneme sahiptir. Bu modelin, örneğin maliyet gereksinimleri, laboratuvarlar arası değişkenliği ve bağırsak emilimini in vivo olarak tahmin etme yeteneği hakkında sınırlı veriler gibi çeşitli sınırlamaları vardır. Köpekler, bazı durumlarda, insanlardan farklı ilaç taşıyıcılarına ve metabolize edici enzimlere sahiptir50.
Ayrıca, köpek organoid sistemi, böyle bir modelin uygunluğunu belirlemek için diğer üreticilerin çeşitli çift odacıklı aparatları üzerinde test edilmelidir (örneğin, farklı filtre membranı bileşimlerinin uygunluğu belirlenmelidir). Diğer bir dezavantaj, makalenin ilaç geçirgenliği deneyi bölümünün önceki bölümlere göre daha az açıklayıcı olmasıdır. Bu, bu alandaki aşırı bilgiden kaynaklanmaktadır. Makalenin bu bölümünün amacı, bu deneylerin temel taşlarının kenarlarını kesmeden, bu yöntemleri değiştirilebilir bir şekilde tanımlamaktı. Geçirgenlik deneyleri hakkında daha ayrıntılı bilgi Hubatsch ve ark.37 tarafından toplanmıştır. Ek olarak, geçirgen ekler kokültür, hücre göçü ve invazyon testi deneylerinde kullanılabilir4.
Sonuç olarak, çift odacıklı kültür cihazlarındaki köpek bağırsak organoidleri, biyomedikal alanlar ve translasyonel tıp da dahil olmak üzere çok çeşitli uygulamalarda kullanılma potansiyeline sahiptir. Protokoller, bir deneyi planlamak ve biyoloji alanındaki organoid modeller için laboratuvarlar arası veri güvenilirliğini teşvik etmek için çeşitli stratejiler oluşturur.
The authors have nothing to disclose.
Iowa Eyalet Üniversitesi çalışanlarının Veteriner Teşhis Laboratuvarı’na, yani Haley Lambert, Emily Rahe, Rosalyn Branaman, Victoria Green ve Jennifer Groeltz-Pamukçuk’a, numunelerin zamanında işlenmesi için şükranlarımızı sunmak istiyoruz. Ayrıca Jodi Smith ve Bethann Valentine’e geçirgenlik deneyleri için malzeme sağladıkları için teşekkür ederiz. Ayrıca David Diaz-Regannon’a Şekil 9 ile ilgili yardımları için teşekkür etmek istiyoruz. Şekil 6 hariç, tüm rakamlar BioRender.com olarak oluşturulmuştur. Yazarlar, Fakülte Başlangıcı, ISU VPR Miller Ödülü, ISU VPR Miller Ödülü ve ISU # 1912948’ye NSF SBIR alt ödülünün desteğini kabul etmek istiyor.
Organoid media | |||
ROCK inhibitor (Y-27632) | EMD Millipore Corp. | SCM 075 | |
[Leu15]-Gastrin I human | Sigma | G9145-.5MG | |
A-83-01 | PeproTech | 9094360 | |
Advanced DMEM/F12 | Gibco | 12634-010 | |
B27 supplement | Gibco | 17504-044 | |
FBS | Corning | 35-010-CV | |
Glutamax | Gibco | 35050-061 | glutamine substitute |
HEPES | VWR Life Science | J848-500ML | |
Human R-Spondin-1 | PeproTech | 120-38-500UG | |
Murine EGF | PeproTech | 315-09-1MG | |
Murine Noggin | PeproTech | 250-38-250UG | |
Murine Wnt-3a | PeproTech | 315-20-10UG | |
N2 supplement | Gibco | 17502-048 | |
N-Acetyl-L-cysteine | Sigma | A9165-25G | |
Nicotinamide | Sigma | N0636-100G | |
Primocin | InvivoGen | ant-pm-1 | |
SB202190 (P38 inhibitor) | Sigma | S7067-25MG | |
Stemolecule CHIR99021 (GSK3β) | Reprocell | 04-0004-base | |
TMS (trimethoprim sulfate) | Sigma | T7883-5G | |
Reagents | |||
Acetic Acid, Glacial | Fisher Chemical | A38-500 | |
alpha-D(+)-Glucose, 99+%, anhydrous | Acros Organics | 170080010 | |
Cell Recovery Solution | Corning | 354253 | |
Collagen I, Rat Tail 3 mg/mL | Gibco | A10483-01 | |
FITC-CM-Dextran | Millipore Sigma | 68059-1G | |
Formaldehyde (37%) | Fisher Chemical | F79P-4 | |
Glutaraldehyde solution | Sigma | G5882 | |
HBSS (1x) | Gibco | 14025-076 | |
Matrigel Matrix For Organoid Culture | Corning | 356255 | Extracellular Membrane Matrix |
Paraformaldehyde, 97% | Alfa Aesar | A11313 | |
PBS, 1x (Phosphate-Buffered Saline) | Corning | 21-040-CM | |
TrypLE Express | Gibco | 12604-021 | Trypsin-like Protease |
Materials and Equipment | |||
15 mL Centrifuge Tube | Corning | 430766 | |
9" Pasteur Pipets | Fisherbrand | 13-678-6B | |
Corning Transwell 6.5 mm Polyester Membrane Inserts Preloaded in 24-Well Culture Plates, Pore Size: 0.4 µm, Sterile | Corning | 3470 | Permeable Support |
Millicell ERS (Probes) | Millipore Sigma | MERSSTX01 | |
Millicell ERS-2 Voltohmmeter | Millipore Sigma | MERS00002 | |
Panasonic incubator | Panasonic | MCO-170ML-PA | |
Parafilm M Wrapping Film | Bemis Company Inc | PM996/EMD | Flexible Laboratory Film |
Tissue Culture Plate 24 wells | Fisherbrand | FB012929 |