Las células madre pluripotentes inducidas por el hombre (HiPSCs) se consideran una herramienta poderosa para la detección de drogas y químicos y para el desarrollo de nuevos modelos in vitro para pruebas de toxicidad, incluyendo neurotoxicidad. Aquí, se describe un protocolo detallado para la diferenciación de hiPSCs en neuronas y glia.
Las células madre pluripotentes humanas pueden diferenciarse en varios tipos de células que pueden aplicarse a ensayos de toxicidad in vitro basados en humanos. Una ventaja importante es que la reprogramación de células somáticas para producir células madre pluripotentes inducidas por humanos (hiPSCs) evita las cuestiones éticas y legislativas relacionadas con el uso de células madre embrionarias humanas (hESCs). Los HiPSCs pueden ampliarse y diferenciarse eficazmente en diferentes tipos de células neuronales y gliales, sirviendo como sistemas de prueba para pruebas de toxicidad y, en particular, para la evaluación de diferentes vías implicadas en la neurotoxicidad. Este trabajo describe un protocolo para la diferenciación de hiPSCs en cultivos mixtos de células neuronales y gliales. Se definen las vías de señalización que son reguladas y / o activadas por diferenciación neuronal. Esta información es fundamental para la aplicación del modelo celular al nuevo paradigma de pruebas de toxicidad, en el que se evalúan los productos químicos en base a su capacidad paraRturb vías biológicas. Como prueba de concepto, la rotenona, un inhibidor del complejo respiratorio mitocondrial I, se utilizó para evaluar la activación de la vía de señalización Nrf2, un regulador clave del mecanismo de defensa celular impulsado por el elemento antioxidante-respuesta (ARE) contra el estrés oxidativo .
El informe 1 del Consejo Nacional de Investigación de EE. UU. Preveía un nuevo paradigma de pruebas de toxicidad en el que las pruebas de toxicidad reglamentarias cambiarían de un enfoque basado en cambios fenotípicos observados en animales a un enfoque centrado en ensayos in vitro mecánicos utilizando células humanas. Los derivados de células madre pluripotenciales (PSC) pueden representar alternativas a los modelos de células cancerosas, ya que las células obtenidas pueden parecerse más a las condiciones fisiológicas de los tejidos humanos y proporcionar herramientas más relevantes para estudiar los efectos adversos inducidos por productos químicos. Los dos tipos principales de cultivos PSC que son más prometedores para las pruebas de toxicidad son las células madre embrionarias humanas (hESCs) y las células madre pluripotentes inducidas por humanos (hiPSCs), que actualmente se utilizan ampliamente en las áreas de investigación básica y medicina regenerativa 2 , 3 . Esta experiencia puede ahora ser aprovechada para el desarrollo de una nueva clase de toxicoloPruebas in vitro in vitro dirigidas a identificar las vías fisiológicas perturbadas implicadas en el desarrollo de efectos adversos in vivo . Sin embargo, es improbable que todos los Estados miembros de la UE y los países de todo el mundo apliquen métodos de prueba para las evaluaciones de seguridad reglamentarias basadas en CCEL debido a posibles preocupaciones éticas ya diversas políticas legislativas nacionales que regulan el uso de células derivadas de embriones.
HiPSCs comparten características similares a las hESCs 4 , 5 y poseen un gran potencial para los métodos in vitro , tanto para la identificación de objetivos terapéuticos, así como para las evaluaciones de seguridad. Además, la tecnología hiPSC mitiga las limitaciones de un grupo limitado de donantes y las preocupaciones éticas asociadas con las células derivadas de embriones. Un desafío importante para los hiPSCs es la demostración de que estas células pueden generar de forma reproducible una gama significativa de derivados de células toxicológicamente relevantes,Con características y respuestas típicas de tejidos humanos. Los niveles predefinidos de los marcadores seleccionados se utilizan generalmente para caracterizar las poblaciones de células después del proceso de diferenciación y para proporcionar conocimientos sobre la estabilidad del proceso de diferenciación.
Los trabajos previos evaluaron la idoneidad de los hiPSC para generar cultivos mixtos de células neuronales y gliales y evaluar los efectos de la rotenona, un inhibidor del complejo respiratorio mitocondrial I, sobre la activación de la vía Nrf2, un regulador clave de los mecanismos de defensa antioxidante en Muchos tipos de células 6 , 7 .
Este trabajo describe un protocolo utilizado para la diferenciación de hiPSCs en cultivos mixtos neuronales y gliales, proporcionando detalles sobre las vías de señalización (nivel de genes y proteínas) que se activan tras la diferenciación neuronal / glial. Además, el trabajo muestra resultados representativos que demuestranHiPSC derivados neuronal y glial modelo de la célula se puede utilizar para evaluar Nrf2 señalización activación inducida por aguda (24 h) de tratamiento con rotenona, lo que permite la evaluación de la inducción del estrés oxidativo.
IMR90 fibroblastos fueron reprogramados en hiPSCs en I-Stem (Francia) por la transducción viral de 2 factores de transcripción (Oct4 y Sox2) utilizando pMIG vectores [ 6] . También se pueden aplicar modelos análogos de hiPSC. Los protocolos que se describen a continuación resumen todas las etapas de diferenciación de los hiPSCs en células madre neuronales (NSCs) y aún más en cultivos mixtos de neuronas postmitoticas y células gliales (pasos 1 y 2). El protocolo) 8 .
En los pasos 3 y 4 se describe un protocolo adicional para el aislamiento, expansión, crioconservación y una mayor diferenciación de NSC en neuronas mixtas y células gliales (también se refieren al EURL ECVAM DBALM weB sitio para una descripción detallada de este protocolo) 9 . El paso 5 describe los análisis que se pueden hacer para evaluar la identidad fenotípica de las células durante las diversas etapas de compromiso y diferenciación.
Este trabajo describe un protocolo robusto y relativamente rápido para la diferenciación de IMR90-HiPSCs en neuronas post-mitótico y células gliales. Los protocolos de diferenciación neuronal previamente publicados basados en hESCs y hiPSCs suelen producir altos porcentajes de precursores neuronales 25 , 26 y un número significativo de células diana neuronales 27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 32 , 33 . Análogamente, el protocolo de diferenciación descrito aquí es adecuado para generar cultivos heterogéneos de células neuronales GABAérgicas, glutamatérgicas y dopaminérgicas, junto con glia y una discreta proporción de células nestina + . La presencia de glutamatergic (~ 35-42%) y GABAérgico (~ 15-20%) las células neurales sugiere queEsta cultura posee prosencéfalo, rasgos corticales y la presencia de un número discreto de neuronas dopaminérgicas (~ 13-20%) también puede indicar la especificidad del mesencéfalo. Además, la permanencia de una proporción modesta de células nestin + puede resultar adecuado para el estudio de la neurogénesis y los posibles efectos de los productos químicos en NSCs, que se limitan principalmente al hipocampo y la zona subventricular (SVZ) del prosencéfalo 34 . Otros análisis inmunocitoquímicos y de expresión génica ayudarían a definir mejor la especificidad regional de los derivados celulares diferenciados.
Los dos pasos más críticos en el protocolo de diferenciación descritos en este documento son: (i) el corte de colonias hiPSC en fragmentos homogéneos (que es crítico para la generación de EBs con tamaños homogéneos) y (ii) el corte de estructuras neuroectodérmicas ) Para la diferenciación NSC, que requiere una habilidad manual significativaY precisión para evitar la recolección de células mesodérmicas y endodérmicas que pueden reducir las proporciones de neuronas y células gliales obtenidas tras la diferenciación.
Es crucial caracterizar los fenotipos de las células durante la expansión (como colonias indiferenciadas o NSCs) y durante todas las etapas de diferenciación. En particular, los perfiles de expresión de genes y proteínas de los derivados de células neuronales / glial deberían mostrar una regulación positiva y activación de vías de señalización relacionadas con las neuronas, mientras que la expresión de marcadores de pluripotencia debería disminuir.
La generación de EBs y derivados neuroectodérmicos (rosetas) puede ser manualmente desafiante y propenso a la variabilidad. Por esta razón, hemos desarrollado un protocolo para la expansión de roseta derivados NSCs y su posterior diferenciación en células neuronales / glial.
Las posibles limitaciones de este protocolo de diferenciación son principalmente (i) el relativamente bajo porcentaje de dDerivaciones glial ifferenciadas y (ii) la falta de funciones de red neuronal maduras (como se muestra por la falta de ráfagas). Además, subpoblaciones específicas de astrocitos pueden funcionar como progenitores primarios o NSC 35 . Aunque nestin / GFAP doble positivo de las células no se observaron en este cultivo celular diferenciado (datos no presentados), se plantea la hipótesis de que las células GFAP + en estos cultivos mixtos son progenitores astrocíticos y astrocitos. Es plausible que al extender el tiempo de diferenciación, el número de astrocitos pueda aumentar, y su morfología puede llegar a ser más madura, como ya se indicó en trabajos previos del grupo de Zhang 36 , 37 .
En el nuevo paradigma de pruebas de toxicidad, el conocimiento sobre las perturbaciones químicas de las vías biológicas es de suma importancia cuando se evalúa la adversidad química. Por lo tanto, los sistemas de ensayo in vitro debenRelacionan los efectos adversos con los trastornos de las vías de señalización, de acuerdo con el concepto de la vía de resultado adverso (AOP). Como prueba de concepto, la rotenona puede usarse para evaluar la activación de la vía Nrf2, que está implicada en la defensa celular contra el estrés oxidativo o electrofílico 38 , y el estrés oxidativo es un evento clave importante y común en varios AOPs relevantes para Neurotóxica del desarrollo y del adulto 39 .
La rodamona debería provocar la activación de la vía Nrf2, que puede demostrarse mediante la translocación nuclear de la proteína Nrf2 y el aumento de la expresión de las enzimas diana Nrf2, incluyendo NQO1 y SRXN1. Se ha encontrado que la rotenona induce un aumento dependiente de la dosis de los niveles de proteína GFAP, indicativo de la activación de astrocitos 40 , 41 . Rotenona también disminuye el número de células dopaminérgicas (TH + ), lo que está de acuerdo con previIn vitro e in vivo que muestran la muerte celular dopaminérgica dependiente de rotenona, ya que este tipo de neurona es particularmente sensible al estrés oxidativo 21 , 22 , 23 .
En conclusión, este hiPSC derivado neuronal y glial modelo de cultivo celular es una valiosa herramienta para evaluar los efectos neurotóxicos de los productos químicos que provocan el estrés oxidativo resultante en la activación de la vía Nrf2. Dado que este protocolo de diferenciación permite la generación de cultivos mixtos de células neuronales (neuronas GABAérgicas, dopaminérgicas y glutamatérgicas) y astrocitos, puede resultar adecuado para estudiar la diafonía entre neuronas y glía en condiciones fisiológicas y patológicas, como en las enfermedades neurodegenerativas Por ejemplo, enfermedad de Parkinson). Por otra parte, la presencia de una proporción significativa de NSCs puede ayudar a evaluar los posibles efectos de los productos químicos en el prog neuralEn los que se sabe que son el principal objetivo de las mutaciones inducidas químicamente o infecciones virales [ 42] .
The authors have nothing to disclose.
Los autores desean agradecer al Dr. Marc Peschanski (I-Stem, Évry, Francia), por proporcionar los IMR90-hiPSCs; La Dra. Giovanna Lazzari y la Dra. Silvia Colleoni (Avantea srl, Cremona, Italia); Dra. Simone Haupt (Universidad de Bonn, Alemania); Dr. Tiziana Santini (Instituto Italiano de Tecnología, Roma), por brindar asesoramiento sobre evaluación de tinción por inmunofluorescencia; La Dra. Benedetta Accordi, la Dra. Elena Rampazzo y el Dr. Luca Persano (Universidad de Padua, Italia), por sus contribuciones al análisis RPPA ya la validación de anticuerpos. Financiación: este trabajo fue apoyado por el proyecto financiado por la UE "SCR & Tox" (Convenio de subvención N ° 266753).
Complete hiPSC medium: | |||
mTeSR1 Basal Medium | Stem Cell Technologies | 05851 | (Step 1.2.6). Complete mTeSR1 is stable when stored at 2 – 8°C for up to 2 weeks. 5X Supplements can be dispensed into working aliquots and stored at -20°C. Use frozen aliquots within 3 months. |
mTeSR1 5X Supplements | Stem Cell Technologies | 05852 | |
Matrigel hESC-qualified Matrix | Corning | 354277 | 1:100 (Step 1.1). Thaw Matrigel on ice, prepare 200 ul aliquots and store them in -80°C. For coating, dilute 200ul aliquot in 20 ml of DMEM/F12 medium. |
CryoStem Freezing Medium | Stemgent | 01-0013-50 | Freeze ~ 100 fragments/250 ul/vial (Step 1.2.1) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
hiPSC EB medium: | |||
Knockout DMEM | Thermo-Fisher | 10829-018 | (Step 2.1.7) |
Knockout Serum Replacement (KOSR) | Thermo-Fisher | 10828-028 | 20% final concentration (Step 2.1.7) |
Non-Essential Amino Acids | Thermo-Fisher | 11140-035 | (Step 2.1.7) |
Penicillin/Streptomycin | Thermo-Fisher | 15140-122 | 50 U/mL final concentration (Step 2.1.7) |
L-Glutamine 200 mM Solution | Thermo-Fisher | 25030-081 | 2 mM final concentration (Step 2.1.7) |
β-Mercaptoethanol | Thermo-Fisher | 31350-010 | 50 µM final concentration (Step 2.1.7) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Complete neuroepithelial induction medium (NRI): | |||
DMEM/F12 | Thermo-Fisher | 3133-038 | (Step 2.3.1) |
Non-Essential Amino Acids | Thermo-Fisher | 11140-035 | (Step 2.3.1) |
N2 Supplement | Thermo-Fisher | 17502-048 | (Step 2.3.1) |
Penicillin/Streptomycin | Thermo-Fisher | 15140-122 | 50 U/mL final concentration (Step 2.3.1) |
Heparin Grade I-A, ≥180 USP units/mg | Sigma-Aldrich | H3149-100KU | 2 µg/ml final concentration (Step 2.3.1) |
bFGF | Thermo-Fisher | 13256-029 | 20 ng/ml final concentration added before use (Step 2.3.1) |
Matrigel Basement Membrane Matrix | Corning | 354234 | 1:100 (Step 2.2). Thaw Matrigel on ice, prepare 200 ul aliquots and store them in -80°C. For coating, dilute 200 ul aliquot in 20 ml of cold DMEM/F12 medium. |
Laminin | Sigma-Aldrich | L2020 | 1:100 (Step 2.2). Dilute in PBS 1X. |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Complete Neuronal Differentiation medium (ND): | |||
Neurobasal Medium | Thermo-Fisher | 21103049 | (Step 2.4.11) |
B-27 Supplements (50x) | Thermo-Fisher | 17504044 | (Step 2.4.11) |
N2 Supplement | Thermo-Fisher | 17502-048 | (Step 2.4.11) |
Penicillin/Streptomycin | Thermo-Fisher | 15140-122 | 50 U/mL final concentration (Step 2.4.11) |
GDNF | Thermo-Fisher | PHC7045 | 1 ng/ml final concentration. Added before use. (Step 2.4.11) |
BDNF | Thermo-Fisher | PHC7074 | 2.5 ng/ml final concentration. Added before use. (Step 2.4.11) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Neural induction medium (NI): | |||
DMEM/F12 | Thermo-Fisher | 3133-038 | (Step 3.3) |
Non-Essential Amino Acids | Thermo-Fisher | 11140-035 | (Step 3.3) |
N2 Supplement | Thermo-Fisher | 17502-048 | (Step 3.3) |
Penicillin/Streptomycin | Thermo-Fisher | 15140-122 | 50 U/mL final concentration (Step 3.3) |
Heparin Grade I-A, ≥180 USP units/mg | Sigma-Aldrich | H3149-100KU | 2 µg/ml final concentration (Step 3.3) |
B-27 Supplement (50X), minus vitamin A | Thermo-Fisher | 12587010 | (Step 3.3) |
L-Glutamine 200 mM Solution | Thermo-Fisher | 25030-081 | 2 mM final concentration (Step 3.3) |
bFGF | Thermo-Fisher | 13256-029 | 10 ng/ml final concentration. Added before use (Step 3.3) |
EGF | Thermo-Fisher | PHG6045 | 10 ng/ml final concentration. Added before use (Step 3.3) |
BDNF | Thermo-Fisher | PHC7074 | 2.5 ng/ml final concentration. Added before use (Step 3.3) |
Defined Trypsin Inhibitor (DTI) | Thermo-Fisher | R007-100 | Pre-warm at 37°C. Add an equal amount of DTI to Trypsin-EDTA (Step 3.10) |
Trypsin-EDTA (0.5%), no phenol red | Thermo-Fisher | 15400054 | 1:10. Dilute Trypsin-EDTA in PBS 1x (without calcium and magnesium), pre-warm the solution at 37°C (Step 3.8) |
CryoStor cell cryopreservation medium | Sigma-Aldrich | C2874-100ML | (Step 4.2) |
Trypan Blue (0.4%) | Sigma-Aldrich | T8154-100ML | multiple manufacturers/suppliers |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
TaqMan Probesets and reagents for gene expression analysis: | |||
RNAqueous-Micro kit | Thermo-Fisher | AM1931 | (Step 5.1.6) |
High Capacity cDNA Reverse Transcription Kits | Thermo-Fisher | 4368814 | |
TaqMan Gene Expression Master Mix | Thermo-Fisher | 4369016 | |
GFAP | Thermo-Fisher | Hs00909233_m1 | |
MAP2 | Thermo-Fisher | Hs00258900_m1 | |
NQO1 | Thermo-Fisher | Hs02512143_s1 | |
SRXN1 | Thermo-Fisher | Hs00607800_m1 | |
HMOX1 | Thermo-Fisher | Hs01110250_m1 | |
GSR | Thermo-Fisher | Hs00167317_m1 | |
PAX6 | Thermo-Fisher | Hs01088112_m1 | |
NES | Thermo-Fisher | Hs00707120_s1 | |
GRIA1 | Thermo-Fisher | Hs00181348_m1 | |
GAP43 | Thermo-Fisher | Hs00967138_m1 | |
GABRA3 | Thermo-Fisher | Hs00968132_m1 | |
GABRA1 | Thermo-Fisher | Hs00168058_m1 | |
NR4A2 | Thermo-Fisher | Hs00428691_m1 | |
TH | Thermo-Fisher | Hs00165941_m1 | |
GAPDH | Thermo-Fisher | Hs02758991_g1 | |
ACTB | Thermo-Fisher | Hs99999903_m1 | |
MAPT | Thermo-Fisher | Hs00902194_m1 | |
SYP | Thermo-Fisher | Hs00300531_m1 | |
NANOG | Thermo-Fisher | Hs04260366_g1 | |
POU5F1 (OCT4) | Thermo-Fisher | Hs04195369_s1 | |
SOX1 | Thermo-Fisher | Hs01057642_s1 | |
AFP | Thermo-Fisher | Hs00173490_m1 | |
KRT18 | Thermo-Fisher | Hs01941416_g1 | |
NPPA | Thermo-Fisher | Hs00383230_g1 | |
T | Thermo-Fisher | Hs00610080_m1 | |
NCAM1 | Thermo-Fisher | Hs00941821_m1 | |
NR4A1 | Thermo-Fisher | Hs00374226_m1 | |
PHOX2A | Thermo-Fisher | Hs00605931_mH | |
PHOX2B | Thermo-Fisher | Hs00243679_m1 | |
NARG2 | Thermo-Fisher | Hs00973298_g1 | |
SLC18A3 | Thermo-Fisher | Hs00268179_s1 | |
SLC5A7 | Thermo-Fisher | Hs00222367_m1 | |
ISL1 | Thermo-Fisher | Hs00158126_m1 | |
LHX3 | Thermo-Fisher | Hs01033412_m1 | |
TaqMan Human Protein Kinase Array | Thermo-Fisher | 4418721 | |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Antibodies and reagents for immunostaining: | |||
B-III-tubulin (Tuj1) | Covance | MMS-435P | 1:500 (Step 5.2.5). Other antibodies may also be used. |
MAP2 | Sigma Aldrich | M4403 | 1:500 |
NF200 | Sigma Aldrich | N4142 | 1:1000 |
GFAP | Acris Antibodies GmbH | AP02002SU-N | 1:500 |
Nestin | Sigma-Aldrich | N5413 | 1:200 |
synaptophysin (SYN) | Abcam | AB14692 | 1:200 |
Tau | Thermo-Fisher | MA5-12808 | 1:100 |
Nrf2 | Abcam | AB62352 | 1:200 |
Keap1 | Abcam | AB66620 | 1:200 |
sulfiredoxin1 (SRXN1) | Abcam | AB92298 | 1:200 |
NAD(P)H quinone oxidoreductase 1 (NQO1) | Abcam | AB2346 | 1:200 |
OCT4 | Millipore | MAB4401 | 1:100 |
SSEA3 | Millipore | MAB4303 | 1:100 |
Tra1-60 | Millipore | MAB4360 | 1:250 |
Tyrosine hydroxylase (TH) | Millipore | AB152 | 1:200 |
Gamma-aminobutyric acid (GABA) | Sigma-Aldrich | A0310 | 1:100 |
Vesicular glutamate transporter 1 (VGlut1) | Abcam | AB72311 | 1:500 |
Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | P6148-500G | 4% (4% formaldehyde can also be used) |
DPBS, no calcium, no magnesium | Thermo-Fisher | 14190144 | |
Triton-X-100 Solution | Sigma-Aldrich | 93443-100ML | 0.1% |
BSA 35% | Sigma-Aldrich | A7979-50ML | 3.5% |
Donkey anti-Rabbit IgG (H+L) Cross Adsorbed Secondary Antibody, DyLight 594 conjugate | Thermo-Fisher | SA5-10040 | 1:500. (Step 5.2.7) Other fluorochrome-conjugated secondary antibodies may also be used. In this case, appropriate dilutions should be tested by the enduser. |
Donkey anti-Mouse IgG (H+L) Cross Adsorbed Secondary Antibody, DyLight 488 conjugate | Thermo-Fisher | SA5-10166 | 1:500 |
Donkey anti-Goat IgG (H+L) Cross Adsorbed Secondary Antibody, DyLight 488 conjugate | Thermo-Fisher | SA5-10086 | 1:500 |
DAPI Solution (1 mg/ml) | Thermo-Fisher | 62248 | 1:1000 (Step 5.2.7) |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Antibodies for Reverse Phase Protein Array (RPPA): | |||
4E-BP1 (S65) | Abcam | AB81297 | 1:250 (Note after step 5.2.8) |
Akt (T308) | Cell Signaling | 9275 | 1:100 |
Akt (S473) | Cell Signaling | 9271 | 1:100 |
AMPKalpha (T172) | Cell Signaling | 2531 | 1:100 |
AMPKbeta1 (S108) | Cell Signaling | 4181 | 1:100 |
ATF-2 (T71) | Cell Signaling | 9221 | 1:100 |
c-Jun (S63) | Cell Signaling | 9261 | 1:200 |
c-Jun (S73) | Cell Signaling | 9164 | 1:200 |
c-Kit (Y719) | Cell Signaling | 3391 | 1:250 |
CREB (S133) | Cell Signaling | 9191 | 1:100 |
EGFR (Y1068) | Cell Signaling | 2234 | 1:50 |
ErbB2/HER2 (Y1248) | Cell Signaling | 2247 | 1:100 |
ERK 1/2, p44/42 (T202/Y204) | Cell Signaling | 9101 | 1:2000 |
GSK-3alpha (S21) | Cell Signaling | 9337 | 1:50 |
Jak1 (Y1022/1023) | Cell Signaling | 3331 | 1:100 |
Lck (Y505) | Cell Signaling | 2751 | 1:500 |
LKB1 (S428) | Cell Signaling | 3051 | 1:100 |
mTOR (S2448) | Cell Signaling | 5536 | 1:100 |
NFkB p65 (S536) | Cell Signaling | 3031 | 1:50 |
p70 S6 Kinase (T389) | Cell Signaling | 9205 | 1:200 |
PDK1 (S241) | Cell Signaling | 3061 | 1:100 |
PKA C (T197) | Cell Signaling | 4781 | 1:250 |
PRAS40 (T246) | BioSource | 44-1100 | 1:2000 |
PTEN (S380) | Cell Signaling | 9551 | 1:500 |
Smad1 (S463/465), Smad5 (S463/465), Smad8 (S426/428) | Cell Signaling | 9511 | 1:500 |
Src (Y527) | Cell Signaling | 2105 | 1:500 |
Src Family (Y416) | Cell Signaling | 2101 | 1:200 |
Stat1 (Y701) | Cell Signaling | 9171 | 1:200 |
Stat3 (S727) | Cell Signaling | 9134 | 1:200 |
Zap-70 (Y319) | Enogene | E011159 | 1:100 |
βCatenin (S33/37/T41) | Cell Signaling | 9561 | 1:250 |
CREB | Upstate Biotechnologies | 06-863 | 1:100 |
Fos B | Cell Signaling | 2251 | 1:200 |
GRB2 | Cell Signaling | 3972 | 1:2000 |
HSP70 | Stressgen | SPA-810 | 1:100 |
c-Jun | Cell Signaling | 9165 | 1:100 |
Kip1/p27 | BD | 610241 | 1:100 |
Lck | Cell Signaling | 2984 | 1:250 |
Mcl-1 | Cell Signaling | 4572 | 1:80 |
Musashi | Cell Signaling | 2154 | 1:100 |
NOTCH1 | Cell Signaling | 3439 | 1:100 |
PTEN | Cell Signaling | 9552 | 1:500 |
SGK1 | Abnova | PAB4590 | 1:250 |
Zap-70 | Cell Signaling | 2705 | 1:250 |
β-Catenin | Abcam | AB32572 | 1:1000 |
Dll4 | Abcam | AB7280 | 1:500 |
Shh | Abcam | AB53281 | 1:250 |
HIF-1α | BD | 610958 | 1:50 |
NUMB PAN-ISO | Upstate Biotechnologies | 07-207 | 1:400 |
NUMB-L | Chemicon | AB15145 | 1:750 |
Cyclin B | BD | 610220 | 1:75 |
c-Myc | Calbiochem | OP-10 | 1:100 |
BCIP/NBT Kit | Thermo-Fisher | 002209 | (Note after step 5.2.8). Kit used to measure alkaline phosphatase activity, similar kits can be used. |
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Antibodies for Flow Cytometry: | |||
SSEA1 Antibody, Pacific Blue conjugate | Thermo-Fisher | MHCD1528 | 1:100 (Note after step 5.2.8) |
SSEA4 Antibody (MC813-70), Alexa Fluor 647 | Thermo-Fisher | SSEA421 | 1:100 |
Name | Company | Catalog number | Comments |
Specific instruments, tools and softwares: | |||
Countess Automated Cell Counter | Thermo-Fisher | C10227 | Neubauer chamber or other suitable glass hemocytometer can be used. |
MEA1060-Inv-BC | Multichannel Systems | MEA1060-Inv-BC | (Step 5.3) |
MEA1060-BC control software | Multichannel Systems | MEA1060-BC | (Step 5.3) |
NeuroExplorer | Multichannel Systems | NeuroExplorer (NE) | (Step 5.3) For post-processing of MEA data |
Multielectrode arrays (MEA) | Multichannel Systems | 60MEA100/10iR-Ti-gr | (Step 5.3) Single-well MEA chip |
ArrayScan XTI High Content Platform | Thermo-Fisher | ASN00002P | (Step 5.2.8) Mean fluorescence can be quantified by using specific ArrayScan algorithms (e.g., Cytotoxicity V.4 and NucTrans V.4 bioapplications). It is recommended to take minimum 20 pictures/well, and have 7-8 internal replicates per condition |
7900HT Fast Real-Time PCR System | Thermo-Fisher | 4351405 | (Step 5.1.6) |
BD ULTRA-FINE Needle Insulin Syringe (with 30G needle) | BD | 328280 | (Steps 1.3.1, 2.1.2, and 2.4.1) |
StemPro EZPassage Disposable Stem Cell Passaging Tool | ThermoFisher | 23181010 | This colony cutting tool can be used as an alternative to the use of 30G needle 1 mL syringes (Step 1.3.1) |
Ultra-Low attachment Petri dish (60 mm) | Corning | 10010582 | (Step 2.1.8) Also other brands can be used. |
Mr. Frosty Freezing container | Sigma-Aldrich | C1562-1EA |