אנו מציגים כאן שיטה תרבית תאים עבור גרימת מעברים-אפיתל mesenchymal (MET) בתאים סרקומה מבוסס על ביטוי אקטופי בשילוב של בני המשפחה microRNA-200 ו grainyhead דמוי 2 (GRHL2). שיטה זו מתאימה יותר להבנת ההשפעה הביולוגית של גמישות פנוטיפית על תוקפנות הסרטן וטיפולים.
גמישות פנוטיפית מתייחסת לתופעה שבה תא להשיג זמני תכונות של שושלת אחרת. במהלך התקדמות קרצינומה, גמישות פנוטיפית שמניע הפלישה, הפצת גרורות. ואכן, בעוד רוב המחקרים של גמישות פנוטיפית כבר בהקשר של קרצינומות נגזרות האפיתל, מתברר סרקומות, אשר המזנכימה במקורו, גם להפגין גמישות פנוטיפית, עם תת-קבוצה של סרקומות עוברת תופעה דומה mesenchymal- מעבר אפיתל (MET). הנה, פיתחנו שיטה המרכיבות את המשפחה miR-200 ו grainyhead דמוי 2 (GRHL2) לחקות תופעה זו נתקלה דמוי שנצפתה החולה סרקומה samples.We ברצף להביע GRHL2 ומשפחת miR-200 באמצעות התמרה התא transfection, בהתאמה , כדי להבין את הבסיס המולקולרי טוב יותר של מעברים פנוטיפי אלה בתאי סרקומה. תאי סרקומה להביע miR-200s ו GRHL2 הפגינו characterist האפיתל משופרICS במורפולוגיה התא ושינוי של סמנים ביולוגיים אפיתל mesenchymal. מחקרים עתידיים באמצעות שיטות אלה ניתן להשתמש כדי להבין את ההשלכות פנוטיפי טוב יותר של תהליכים MET-כמו על תאי סרקומה, כגון הגירה, פלישה, נטייה גרורתי, והתנגדות טיפול.
גמישות פנוטיפית מתייחסת מעבר הפיך בין פנוטיפים הסלולר, והוא מחולק בדרך כלל לשני סוגים, האפיתל אל המזנכימה (EMT) מעברים מעברי המזנכימה אל האפיתל (MET). גמישות פנוטיפית זה ממלא תפקיד חשוב בתהליכים נורמליים של יצורים רב-תאיים, כגון פיתוח ריפוי פצעים 1; עם זאת, מסלולים אותם ותוכניות ביטוי גנים יכולים גם לגרום למחלות, כגון סיסטיק (הנסקרת ב 2, 3, 4) וגרורות קרצינומה (הנסקרת ב אזכור 5, 6, 7, 8). במהלך גרורות, למשל, EMT משבש קוטביות בתא, תאי תאי אינטראקציות, ומקדמת פלישה 9, 10. יחד, EMT לתרוםהים למדינה פנוטיפי המאפשר הפצת תאים סרטניים. בנוסף, EMT גם מוביל שורה של שינויים פנוטיפי אחרים שמניעים פנוטיפ אגרסיבי, כולל הסרת הפיקוח של מטבוליזם תאי סרטן 6, התפתחות עמידות לתרופות 11, 12, יכולת גידול-ייזום מוגברת 13, 14 ו לארח התחמקות החיסון 15.
גמישות פנוטיפית נחקרה היטב להתקדמות קרצינומה; עם זאת, סרקומות גם להפגין גמישות פנוטיפית. מעניין, נראה כאילו חלק מאותם נהגים של גמישות פנוטיפית בקרצינומות גם לתרום פלסטיות סרקומה ואגרסיביות. למשל, בתאי הגידול במחזור (CTCs) מחולים סרקומה הוכחו להביע EpCAM, חלבון על פני התא שנמצא בדרך כלל ב- תאי האפיתל 16. Additionally, 250 דגימות סרקומה של רקמות רכות סווגו בתור אפיתל דמוי או המזנכימה דמוי מבוסס על ביטוי גנים. מטופלי החתימה ביומרקרים דמוי אפיתל היה פרוגנוזה טוב יותר מאשר חולה עם החתימה ביומרקרים דמוי המזנכימה 17. זה עולה בקנה אחד עם קרצינומה רב, בם חולה עם יותר קרצינומות דמויות אפיתל יש תוצאות טובות יותר בהשוואה לחולים עם גידולים המזנכימה דמוית יותר 18.
בעוד שחלק סרקומות להציג סמנים ביולוגיים ומסלולי ביטוי גנים עקביים עם MET, את הבסיס המולקולרי של גמישות פנוטיפית זה להישאר ממעטים להבין. כדי לחקור את המנגנונים ואת הנהגים של נפגשו סרקומה פיתחנו מודל של אינדוקציה MET באמצעות שני גורמים ספציפיים אפיתל, microRNA (Mir) -200 בני משפחה grainyhead דמוי 2 (GRHL2). מיר-200s הם משפחה של RNA ללא קידוד קטן המווסתים ביטוי גנים באמצעות קשירה 3' UTRs של messenger RNA ותרגום מניעה לתוך חלבון. משפחת miR-200 מורכבת משתי קבוצות משנה – אחד המכיל miR-141 לבין מיר-200a, והשני כולל miR-200B, miR-200C, ומיר-429. בני משפחת miR-200 מועשרים ברקמות האפיתל, ואת אובדן miR-200s קשורה גרורות קרצינומה 19. משפחת miR-200 הוא downregulated גם סרקומות של רקמות רכות לעומת הרקמות הבריאות 20. בדומה מיר-200s, GRHL2 הוא הרגולטור, כי הוא מפתח חשוב לפיתוח האפיתל 21. גורם שכפול GRHL2 פועל בשתי דרכים כדי upregulate גני האפיתל, כגון E-cadherin: 1) בתאי האפיתל, GRHL2 ישירות מדחיק את רגולטור EMT, ZEB1 22; ו 2) GRHL2 מפעיל תעתיק ישירות של גנים האפיתל 23. החקירות הקודמות שלנו הראו כי ביטוי משולב של miR-200s ו GRHL2 בתאי סרקומהגורם פנוטיפ MET-כמו 24. כאן, אנו מציגים פרוטוקול מפורט כדי ליצור מודל במבחנה של אינדוקציה נפגשו תאי סרקומה באמצעות ביטוי אקטופי של miR-200s ו GRHL2.
סרקומות הן נדירות, אבל מאוד סוגי סרטן אגרסיביים של השושלת המזנכימה. למרות השושלת המזנכימה שלהם, קבוצת משנה של סרקומות מופיע לעבור במעבר פנוטיפי למצב אפיתל דמוי יותר. יש מתג MET-ככה רלוונטי פרוגנוסטיים, כמו חולים עם גידולים אפיתל דמוית יותר הם פחות אגרסיביים 24…
The authors have nothing to disclose.
JAS מודה תמיכה ממכון הסרטן Duke, המעבדה לאונקולוגיה המין והשתן אוניברסיטת דיוק, ואת מחלקת אורתופדיה אוניברסיטת דיוק. HL נתמכה על ידי הקרן הלאומית למדע (NSF) המרכז לפיסיקה ביולוגית תיאורטית (NSF PHY-1,427,654) ו- NSF DMS-1,361,411, וכתוצאה CPRIT (מניעת סרטן ולמחקר במכון טקסס) Scholar ב Cancer Research של מדינת טקסס בבית רייס האוניברסיטה. KEW נתמכה על ידי MKJ NIH F32 CA192630 ו HL נהנו מן הדיונים שימושי עם מרי ג Farach-קרסון, JN Onuchic, סמיר M. Hanash, קנת ג'יי Pienta, ו דונלד ס קופי.
Countess automated counter | Life technologies | AMQAX1000 | |
Countess cell counting chamber slides | Invitrogen | C10283 | |
SimpliAmp Thermal Cycler | Thermo Fisher | A24811 | |
Odyssey Fc | LI-COR Inc | ||
ViiA7 Real Time PCR System | Thermo Fisher | 4453536 | |
PCR microplate | Corning | 321-29-051 | |
KAPA SYBR Fast Universal qPCR Kit | KAPA Biosystems | KK4602 | |
Starting Block (PBS) Blocking Buffer | Thermo Fisher | 37538 | BSA-based blocking buffer |
Agarose General Purpose LE | Genesee Scientific | 20-102 | |
10X Tris/Glycine/SDS Buffer | Bio-Rad Laboratories Inc | 161-0732 | Running buffer |
10X Tris/Glycine Buffer | Bio-Rad Laboratories Inc | 161-0734 | Transfer buffer |
RIPA Buffer | Sigma Life Sciences | SLBG8489 | |
Amersham Protran 0.45 μm nitrocellulose | GE Healthcare Lifesciences | 10600012 | |
Quick-RNA MiniPrep Kit | Genesee Scientific | 11-358 | |
Laemmli Sample Buffer (4X) | Bio-Rad Laboratories Inc | 1610747 | |
Mini Trans-Blot Cell | Bio-Rad Laboratories Inc | 1703930 | |
Mini-Protean Tetra Cell | Bio-Rad Laboratories Inc | 1658005EDU | |
DPBS | Life technologies | 14190-144 | |
0.05% Trypsin-EDTA | Life technologies | 11995-065 | |
DMEM | Life technologies | 11995-065 | |
Lipofectamine RNAi Max | Thermo Fisher | 13778150 | |
Lipofectamine 2000 Ragents | Thermo Fisher | 11668019 | |
Penicillin Streptomycin | Life technologies | 15140-122 | |
miRVana miRNA mimic negative control #1 | Thermo Fisher | 4464058 | neg miRNA |
hsa-miR-200 mirVana miRNA mimic | Thermo Fisher | 4464066 | miR200A |
has-miR-200 mirVana miRNA mimic | Thermo Fisher | 4404066 | miR200B |
has-miR-200 mirVana miRNA mimic | Thermo Fisher | 4404066 | miR200C |
Opti-MEM | Life technologies | 11088-021 | serum-free media |
anti-Ecadherin antibody | BD Bioscience | 610182 | |
anti-beta actin | Santa Cruz Biotechnology | sc-69879 | |
anti-EpCam | Ab Serotec | MCA18706 | |
anti-ZO1 | Invitrogen | 402200 | |
IRDye 800W | LI-COR Inc | 925-32210 | |
IRDye 680 | LI-COR Inc | 926-32223 | |
anti-mouse AlexaFluor 647 | Thermo Fisher | A211241 | |
anti-rabbit AlexaFluor 647 | Thermo Fisher | ab150075 | |
Halt Protease and Phosphatesse Inhibitor | Thermo Fisher | 1861281 | |
Precision Plus Protein Dual Color | Bio-Rad Laboratories Inc | 161-0374 | |
Partec CellTrics | Sysmex | 04-004-2326 | 30 μm filter for flow |
GAPDH-F | IDT | AGCCACATCGCTCAGACAC | |
GAPDH-R | IDT | GCCCAATACGACCAAATCC | |
Ecadherin-F | IDT | TGGAGGAATTCTTGCTTTGC | |
Ecadherin-R | IDT | CGCTCTCCTCCGAAGAAAC | |
ZEB1-F | IDT | GCATACAGAACCCAACTTGAACGTC | |
ZEB1-R | IDT | CGATTACACCCAGACTGC | |
NOTCH-F | IDT | GGCAATCCGAGGACTATGAG | |
NOTCH-R | IDT | CTCAGAACGCACTCGTTGAT | |
nitro blue tetrazolium | Sigma | N5514 | |
hexadimethrine bromide | Sigma | H9268 | polybrene |
3 mL syringe | BD Bioscience | 309657 | |
Sterile syringe filter | VWR | 28145-505 | |
5mL polypropylene round-bottom tube | 352063 | flow cytometry tubes | |
High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit | Thermo Fisher | 4368814 | reverse transcription kit |
4% paraformaldyhyde | Santa Cruz Biotechnology | sc-281612 | |
Triton-X100 | Sigma | 93443 | |
bovine serum albumin | Sigma | A7906 |