Somitogenesis è un processo di sviluppo ritmico che spazialmente modelli l'asse del corpo di embrioni dei vertebrati. In precedenza, abbiamo sviluppato linee di zebrafish transgenico che usano i giornalisti fluorescenti ad osservare i geni ciclici che guidano questo processo. Qui, la cultura dispersi cellule da queste linee e l'immagine dei loro oscillazioni nel corso del tempo in vitro.
La segmentazione è un processo morfogenetico periodica e sequenziale nei vertebrati. Questa formazione ritmica di blocchi di tessuto chiamato somiti lungo l'asse del corpo è la prova di un oscillatore genetica patterning embrioni. In zebrafish, il intracellulare orologio segmentazione di guida è composto da membri del suo / Hes fattore di trascrizione della famiglia organizzata in cicli di feedback negativo. Abbiamo recentemente generata transgenici linee reporter fluorescente per la HER1 gene ciclico che ricapitolare il modello spazio-temporale delle oscillazioni nel mesoderma presomitic (PSM). Utilizzando queste linee, abbiamo sviluppato un sistema di coltura in vitro che permette l'analisi in tempo reale di segmentazione oscillazioni orologio entro singolo, isolato cellule PSM. Rimuovendo il tessuto PSM da embrioni transgenici e quindi disperdere le cellule da oscillante regioni su piatti con fondo di vetro, abbiamo generato culture adatti per time-lapse imaging del segnale di fluorescenza dacelle di clock individuali. Questo approccio fornisce un quadro sperimentale e concettuale per la manipolazione diretta del clock di segmentazione con risoluzione unicellulare senza precedenti, consentendo sue proprietà cellule autonome ea livello di tessuto distinguere e sezionati.
La formazione periodica dei segmenti lungo l'asse del corpo vertebrati, o somitogenesis, è la prova di un oscillatore spaziale e temporale negli embrioni. Il meccanismo favorito controllo somitogenesis è concettualmente descritto da un modello "orologio e fronte d'onda" 1, in cui il "clock" costituito da oscillatori cellulari, ora pensato per essere guidato intracellulare dall'espressione ritmica di una serie di geni ciclici 2, scandisce la formazione dei somiti dal mesoderma presomitic (PSM). Come l'embrione si sviluppa, una maturazione "fronte d'onda" nel PSM muove di concerto con il tessuto regressione verso la parte posteriore, rallentando e arrestando oscillatori cellulari che passa 3. Insieme, questo sistema spatiotemporally dinamico è definito l'orologio segmentazione. Gli attuali approcci per studiare l'arco dell'orologio segmentazione tre livelli crescenti di organizzazione del oscillatore genetica in cellule singole a th accoppiamento localia verifica tra le cellule e, infine, alla regolamentazione globale delle informazioni di posizione nel collettivo tessuto PSM 4.
Precedenti studi suggeriscono la segmentazione oscillatore cellula-autonoma in zebrafish consiste di geni e prodotti proteici dalla trascrizione suoi / hes factorfamily, che si pensa a formare un anello di retroazione negativa attraverso la repressione trascrizionale 5-7. La via di segnalazione Delta / Notch sincronizza le oscillazioni tra cellule vicine e regola il periodo collettiva della popolazione 8-10. FGF segnalazione molecole prodotte in tailbud sembrano costruire un gradiente di tutti i zebrafish PSM, e sono quindi ipotizzato di contribuire a rallentare e arrestare le cellule oscillanti nel anteriore 11. Fino ad ora, i ruoli funzionali di ciascuna di tali molecole in somitogenesis sono stati studiati da mutazione genetica, iniezione morfolino, heat-shock sovraespressione e antagonista farmaco Treatimento di componenti e di segnalazione tra le cellule 5,7,10,12 di clock. Utilizzando queste perturbazioni, funzione orologio segmentazione è stato dedotto dalle descrizioni a livello di tessuto di difetti somite e la perdita di oscillazioni uniformi nell'espressione dei geni ciclici come HER1, her7, e delta C. Tuttavia, quasi tutti questi dati sono da embrioni fisse e non riescono a cogliere con precisione i cambiamenti che sono inerenti alla funzione dinamica del clock segmentazione. Più di recente, multiple-embrione time-lapse imaging ha rivelato i primi mutanti con periodo oscillatore alterato, ma queste osservazioni sono state anche fatta al 7,13 livello tissutale. Pertanto, non è stato osservato il comportamento dell'oscillatore cellula-autonoma ipotizzato durante somitogenesis.
Istantanee statiche di somitogenesis danno un quadro incompleto perché, intrinsecamente, il processo è guidato da un sistema oscillatorio. In precedenza il lavoro in cellule di topo e pulcino ha mostrato che i livelli di trascrizionee l'aumento delle proteine e la caduta, ma il campionamento un'oscillazione di circa 2 ore ogni 30 o 45 min limita necessariamente i dati raccolti e quindi le conclusioni che si possono trarre 14,15. Studio di altri oscillatori biologici, in particolare, orologi circadiani, si è allontanato dalle misure messe in scena di espressione genica e proteica di monitoraggio in tempo reale utilizzando fluorescenti e reporter bioluminescenti 16,17. Questi strumenti sono essenziali per dimostrare le proprietà di clock di singole cellule 18. Un reporter bioluminescenti del gene ciclico Hes1 è stato sviluppato e brevemente caratterizzato singole cellule topo PSM 19. Il periodo e la varianza media sono stati calcolati per un piccolo numero di cellule, mostrando che le oscillazioni persistono per più cicli in vitro. Tuttavia, questi studi non hanno quantitativamente affrontare la stabilità e robustezza della frequenza dell'oscillatore e ampiezza, se le cellule possono entrare spontaneamente o oscillazioni di uscita,e come le cellule mantengono le loro relazioni di fase. Inoltre, gli effetti di molecole di segnalazione presenti nell'embrione sull'orologio cellula-autonoma non sono stati testati direttamente. Di conseguenza, queste proprietà fondamentali dell'oscillatore singola cellula rimangono completamente sconosciuta.
Abbiamo recentemente sviluppato linee di pesci transgenici con BAC recombineering 20 a guidare Venere (YFP) reporter di fluorescenza di espressione HER1 30. Tali linee sfruttano gli spunti normativi del locus cromosomico integro in cui sono incorporati e ricapitolano le dinamiche temporali e modello spaziale di HER1. Questa innovazione consente il monitoraggio in tempo reale di espressione genica nell'embrione zebrafish sviluppo in vivo. Per studiare le proprietà fondamentali delle oscillazioni cellule autonome e come tale espressione è regolata nel corso del tempo, abbiamo recentemente sviluppato un metodo affidabile per isolare e registrare da cellule PSM in vitro. Questo protocol descrive come abbiamo utilizzato le nostre linee giornalista transgeniche per produrre colture di cellule disperse, da cui possiamo caratterizzare le oscillazioni del clock segmentazione zebrafish in celle singole. Possiamo quindi affrontare domande in sospeso nel campo non accessibili con analisi statica o livello tissutale, nonché manipolare direttamente l'orologio segmentazione a livello di singola cellula con molecole di segnalazione e inibitori.
Per studiare un processo cellulare che avviene nel corso dello sviluppo embrionale, biologi utilizzano tipicamente un approccio nel contesto dell'intero embrione. Tuttavia, per comprendere appieno come una singola cellula si comporta in un lasso di tempo di sviluppo, un metodo per esaminare e perturbare le singole celle di isolamento è anche estremamente utile. Generando colture cellulari PSM dispersi utilizzando embrioni transgenici zebrafish ora abbiamo uno strumento per studiare direttamente la natura autonoma delle cellule di oscillazioni genetiche orologio segmentazione in modo quantitativo. E 'possibile misurare dinamica delle oscillazioni nel nostro reporter fluorescente in centinaia di cellule in una varietà di condizioni.
Il periodo osservato di singole cellule in coltura è più lungo del periodo somitogenesis nell'embrione intatta. Osserviamo che un espianto PSM intatta nella cultura espone anche oscillazioni più lenti della embrione intatto (dati non mostrati), suggerendo that il periodo più lungo osservato in cellule isolate non è semplicemente a causa di danni da dispersione. Un periodo ed ampiezza variabili sono osservati in più di una serie temporale della singola cellula. La fonte di questa variabilità non è nota, ma dovrebbe rivelare importanti dettagli su circuiti ritmo, rendendo il dell'orologio segmentazione.
Con questo metodo possiamo studiare le componenti genetiche di segmentazione a livello cellulare, e le domande di indirizzo che sono difficili da esaminare l'intero embrione. Ad esempio, per aggiunta controllata di molecole conosciute segnalazione trovati negli embrioni alle nostre culture, possiamo esaminare i loro effetti sul singolo oscillatore cellulare PSM in un saggio robusto e riproducibile. Il nostro sistema di coltura PSM apre le porte ad una rigorosa valutazione di quali fattori, da soli o in combinazione promuovere oscillazioni in queste cellule, quali fattori inibiscono queste oscillazioni, e per testare l'interazione tra tali molecole. Con questi strumenti in mano, ci proponiamo divalutare i modelli esistenti di somitogenesis che si basano su dati a livello di tessuto pubblicati, così come l'uso sono risultati in singole cellule di generare previsioni che possono essere testati in tutto embrione.
A nostra conoscenza, questo è il primo protocollo di coltura cellulare primaria zebrafish per acuti registrazione time-lapse della fluorescenza in singole cellule; ulteriore sviluppo e perfezionamento di questo protocollo è senza dubbio possibile. Altri protocolli spesso utilizzano embrioni di zebrafish per generare linee cellulari stabili che possono essere trasfettate con i reporter ed utilizzate per l'imaging a lungo termine 27-29. Mentre le linee stabili sono utili per l'imaging di un processo che non è legata a tempi di sviluppo, come l'orologio circadiano, la questione della segmentazione embrionale richiede dell'immagine immediata mentre le cellule sono ancora nella loro oscillatorio, stato progenitore. Una volta che le cellule smettono di oscillare, assumono un destino cellula differenziata, e quando nel tessuto, dovrebbe essere incorporata in un somite. E 'possible che con il fattore di destra o fattori presenti in vitro da poter generare PSM-come le linee di zebrafish coltura cellulare che rimarrebbero oscillatorio, consentendo significativamente osservazioni a lungo termine, più perturbazioni sequenziali, o screening ad alto rendimento.
Ci aspettiamo che questo metodo di preparazione di colture primarie di cellule disperse per l'imaging time-lapse è particolarmente adatto per lo studio di ogni processo cellulare che si verifica entro un lasso di tempo di sviluppo che non è accessibile utilizzando linee cellulari di zebrafish stabili. L'isolamento di diversi tipi di cellule a stadi di sviluppo distinti da adeguate linee giornalista transgeniche, sia attraverso la dissezione o tramite FACS dopo dissociazione embrionale, potrebbe fornire le cellule di partenza. Alcuni ottimizzazione delle condizioni di coltura, guidati dalla origine embrionale delle cellule, può essere richiesto. Combinando questo protocollo flessibile e sensibile con la rapida crescita collezione di zebrafish transgenicolinee, speriamo di facilitare un approccio evolutivo vitro in biologia che è complementare ai metodi genetici e embriologici classici.
The authors have nothing to disclose.
Questo lavoro è stato supportato da un EMBO lungo termine fellowship (ABW), un National Science Foundation Internazionale Postdoctoral Research Fellowship (ABW), la Max Planck Gesellschaft (ABW, DS, JS, ACO), una borsa di studio scava-BB (AO), e il Consiglio europeo della ricerca nell'ambito delle Comunità europee del Settimo programma quadro STG-207634 (DS, ACO). Ringraziamo Ravi Desai per gli utili commenti sul manoscritto. Vorremmo anche ringraziare la funzione di espressione della proteina MPI-CBG per la produzione del frammento zebrafish Fibronectin1, il personale della struttura pesce MPI-CBG per la cura e la manutenzione delle nostre linee di pesce e la funzione di microscopia ottica MPI-CBG per il supporto di immagini.
Name of Reagent/Material | Company | Catalog Number | Comments |
Epifluorescence microscope | Olympus | Model: SZX16 | |
Epifluorescence microscope | X-cite Illumination | Series: 120Q | |
Dissection microscope | Olympus | Model: SZX12 | |
Fine forceps no. 55 | Fine Science Tools | 11295-51 | |
Glass transfer pipettes | Assistent | 567/2 | |
35 mm plastic petri dishes | Greiner | 627102 | |
60 mm plastic petri dishes | Greiner | 628102 | |
Sylgard polymer | SASCO | 266727 | |
Manipulation tools | Made in-house | For description of manipulation tools Ref. 22 | |
Microsurgical knife | World Precision Instruments | 500249 | |
L15 medium | Invitrogen | 57322 | |
Penicillin/streptomyocin | PAA | P11-010 | |
Fetal bovine serum | Invitrogen | 257322 | |
0.05% trypsin / 0.02% EDTA | PAA | L11-004 | |
Gel loading tips | Fisher Scientific | 253188 | |
Sigmacote | Sigma Aldrich | 254589 | |
Micropipette set | Gilson International | F167300 | |
Zebrafish Fibronectin1 70 kD fragment | MPI-CBG protein facility | Generated in-house from construct based on previously published work Ref. 23-25 | |
Glass bottom imaging dishes | Mattek (single well) | P35G-1.5-14-C | |
Glass bottom imaging dishes | Greiner (CellView -multi-well) | 262502 | |
E3 medium without methylene blue | Made in-house | From The Zebrafish Book, 5th Ed. Ref. 26 | |
Plastic transfer pipettes | Ratiolab | 260011 | |
Warner heating/cooling chamber | Warner Instruments | TC-324B/344B | |
EM-CCD camera | Andor | Model: iXOn 888 | |
Wide-field fluorescence microscope with Venus filter set | Zeiss | Model: Axiovert 200M | |
Wide-field fluorescence microscope with Venus filter set | NeoFluor 40x, NA 0.75 | ||
Wide-field fluorescence microscope with Venus filter set | Lumencor Light Engine | Model: Spectra X | |
Wide-field fluorescence microscope with Venus filter set | |||
Wide-field fluorescence microscope with Venus filter set | BrightLine HC 575/15 | F39-575 |