Summary

Visualizzazione virus Dengue attraverso Alexa Fluor Etichettatura

Published: July 09, 2011
doi:

Summary

Approfittando dei progressi nello sviluppo fluoroforo e tecnologia di imaging, un metodo semplice di Alexa Fluor etichettatura dei virus dengue è stato ideato per visualizzare le prime interazioni tra virus e cellule.

Abstract

Gli eventi presto l'interazione tra virus e cellule possono avere un'influenza profonda sul risultato di infezione. Determinare i fattori che influenzano questa interazione potrebbe portare a una migliore comprensione della patogenesi della malattia e quindi influenzare vaccino terapeutico o di progettazione. Quindi, lo sviluppo di metodi per sondare questa interazione potrebbe essere utile. Più recenti progressi della fluorofori sviluppo 1-3 e tecnologia di imaging 4 può essere sfruttato per migliorare le nostre attuali conoscenze sulla patogenesi dengue e quindi aprire la strada per ridurre i milioni di dengue che si verificano ogni anno.

Il virus dengue ha un involucro esterno costituito da un'impalcatura di 90 busta glicoproteina (E) dimeri che proteggono il serbatoio nucleocapside, che contiene un singolo filamento positivo di RNA del genoma 5. Le subunità proteiche identiche sulla superficie del virus può quindi essere etichettato con un colorante reattivo ammina e visualizzati tramite microscopia a immunofluorescenza. Qui, presentiamo un semplice metodo di etichettatura dei virus della dengue con Alexa Fluor succinimidile estere colorante sciolto direttamente in un buffer di bicarbonato di sodio che ha dato virus altamente vitali dopo etichettatura. Non esiste una procedura standardizzata per l'etichettatura dei virus vivo e protocollo del produttore esistente per l'etichettatura delle proteine ​​di solito richiede la ricostituzione di colorante in dimetilsolfossido. La presenza di dimetilsolfossido, anche in piccole quantità, in grado di bloccare l'infezione produttiva da virus e anche indurre citotossicità delle cellule 6. L'esclusione dell'uso di dimetilsolfossido in questo protocollo così ridotto questa possibilità. Alexa Fluor coloranti hanno fotostabilità superiore ed è meno sensibile al pH rispetto ai coloranti comuni, come la fluoresceina e rodamina 2, che li rende ideali per gli studi sulla captazione cellulare e il trasporto endosomali del virus. La coniugazione di Alexa Fluor colorante non ha influenzato il riconoscimento dei virus della dengue etichettati da virus-specifici anticorpi ed i suoi recettori putativi in cellule ospiti 7. Questo metodo potrebbe avere applicazioni utili in studi virologici.

Protocol

1. Alexa Fluor etichettatura dei virus dengue Prima che la reazione di marcatura, purificare virus della dengue con cuscino di saccarosio e preparare i reagenti necessari e le attrezzature, come indicato nel protocollo. Preparare fresca 0,2 M tampone bicarbonato di sodio, pH 8,5 (tampone etichettatura), e 1,5 M tampone idrossilammina, pH 8.3 (fermata reagente), poco prima di etichettatura e filtro sterilizzare con filtri per siringa 0.2μm. Diluire a circa 3×10 8 unità placca f…

Discussion

Anche se AF594 colorante è stato utilizzato in questo rapporto, una vasta gamma di fluorofori nella serie Alexa Fluor succinimidile esteri è disponibile con la chimica etichettatura simili. Questo potrebbe estendere l'applicazione dell'etichettatura di là di imaging. Citometria a flusso può essere usato come alternativa alla microscopia confocale per valutare il grado di etichettatura per fluorofori che può essere eccitato e individuate dalla macchina FACS.

Alexa Fluor coloranti…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Questo lavoro è stato finanziato dal Medical Consiglio Nazionale delle Ricerche, Singapore.

Materials

Name of the reagent Company Catalogue number Comments (optional)
Sodium bicarbonate Sigma-Aldrich S6297  
Hydroxylamine Sigma-Aldrich 159417  
Sodium hydroxide Merck 106498  
AF594 succinimidyl esters Molecular Probes, Invitrogen A20004  
PD-10 column GE Healthcare 17-0851-01  
Hepes Sigma-Aldrich H6147  
NaCl Sigma-Aldrich S3014  
EDTA Sigma-Aldrich E9884  
M-199 Invitrogen 11150  
FBS Hyclone SH30070.03  
4-well plate Nunc 176740  
Coverslips Einst 0111520  
Microscope slide Sail Brand 7105  
3H5 hybridoma ATCC HB46  
10x PBS 1st Base BUF-2040-10X1L  
Saponin Sigma-Aldrich S4521  
BSA Sigma-Aldrich A7906  
Magnesium chloride Sigma-Aldrich M2670  
Calcium chloride Sigma-Aldrich C3306  
Paraformaldehye Sigma-Aldrich 15,812-7  
Mowiol 4-88 Calbiochem 475904  
Dabco Sigma-Aldrich D27802  
Tabletop centrifuge Eppendorf 5424  
Confocal microscope Zeiss LSM 710  

To prepare M-199 growth medium, add 50ml of FBS, 5ml of sodium pyruvate and 5ml of non-essential amino acids to 500ml of M-199, sterile filter.

To prepare M-199 maintenance medium, add 15ml of FBS, 5ml of sodium pyruvate and 5ml of non-essential amino acids to 500ml of M-199, sterile filter.

References

  1. Olenych, S. G., Claxton, N. S., Ottenberg, G. K. &. a. m. p. ;. a. m. p., Davidson, M. W. The Fluorescent Protein Color Palette. Current Protocols in Cell Biology. 21.5, 1-34 (2007).
  2. Panchuk-Voloshina, N. Alexa dyes, a series of new fluorescent dyes that yield exceptionally bright, photostable conjugates. J Histochem Cytochem. 47, 1179-1188 (1999).
  3. Shaner, N. C., Patterson, G. H., Davidson, M. W. Advances in fluorescent protein technology. J Cell Sci. 120, 4247-4260 (2007).
  4. Lippincott-Schwartz, J., Patterson, G. H. Development and use of fluorescent protein markers in living cells. Science. 300, 87-91 (2003).
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  9. Huang, S. Analysis of proteins stained by Alexa dyes. Electrophoresis. 25, 779-784 (2004).
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Cite This Article
Zhang, S., Tan, H. C., Ooi, E. E. Visualizing Dengue Virus through Alexa Fluor Labeling. J. Vis. Exp. (53), e3168, doi:10.3791/3168 (2011).

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