Deze video beschrijft micro-injection, een veelgebruikte methode om transgene C. elegans stammen te creëren. In het voorbeeld zien we micro-injection gebruikt om een ribonucleoproteïne (RNP) complex voor CRISPR-bases genbewerking te introduceren.
Protocol
Het volgende protocol is een fragment uit Farboud et al, Enhanced Genome Editing with Cas9 Ribonucleoprotein in Diverse Cells and Organisms, J. Vis. Exp. (2018). 1. RNP-vergadering Ontwerp het experiment ruim van tevoren en verwerft alle RNA-, DNA- en eiwitcomponenten van tevoren. Probeer als eerste een van de positieve controles…
Representative Results
Tabel 1: Positieve controles voor voorlopige genoombewerkingsexperimenten. Deze tabel toont de belangrijkste informatie die nodig is om een eerste genoombewerkingsexperiment uit te voeren in elk van de cellen en organismen die in dit protocol worden beschreven. Het volgen van deze parameters zal waarschijnlijk een succesvol resultaat opleveren dat kan worden gebruikt om het protocol te testen of als basisl…
Materials
Reagents/Materials
DNA oligonucleotides
Integrated DNA Technologies
–
IDT will provide custom DNA sequences, including those in Table 1
Guide RNAs
Synthego
–
Synthego will provide high-quality sgRNAs for S. pyogenes Cas9, including custom sgRNAs containing the targeting sequences included in Table 1
Purified Cas9 protein (EnGen Cas9 NLS, S. pyogenes)
New England Biosciences
M0646T
If possible, purifying Cas9 in-house or purchasing from local core facilities is a less expensive option
OP50 Escherichia coli
Caenorhabditis Genetics Center
OP-50
https://cgc.umn.edu/
Nematode Growth Media agar in petri dishes
–
–
See Stiernagle, T (ref. 59)
Standard borosilicate glass capillaries with filament: 4 in (100 mm), 1/0.58 OD/ID
World Precision Instruments
1B100F-4
Single-barrel standard borosilicate glass capillaries: 6 in (152 mm), 2/1.12 OD/ID
World Precision Instruments
1B200-6
Cover glass; 24 × 50 mm
Thermo Fisher Scientific
12-544E
Cover glass; 22 × 22 mm
Thermo Fisher Scientific
12-518-105K
Apex LE agarose
Genesee Scientific
20-102
Halocarbon oil 700
Sigma-Aldrich
H8898-100ML
pCFJ90 plasmid
Addgene
19327
Capillary tubes with filament: 4 in (1.0 mm)
World Precision Instruments
T2100F-4
Petri dishes (100 × 15 mm)
–
9" pasteur pipettes
–
Nuclease-free water
–
Equipment
MZ75 Stereomicroscope
Leica
Out-of-production. Current model is the M80 Stereomicroscope