مثبطات النسخ تكون قادرة على تعطيل نسخ الجين وهي تتمتع بنطاق مميز يربط التسلسل المنظم على دى إن أيه والنطاق الآخر الذى يثبط النسخ. هذه البروتينات قادرة على منع النسخ من خلال آليات متنوعة. أبسط هذه الطرق هو منع المنشط من الإرتباط بالتسلسل التنظيمي سيز الخاص به من خلال واحدة من العديد من الآليات المختلفة.في بعض الحالات،المثبط يتحد بشكل تنافسي مع تسلسل منظم التسلسل التنظيمي،وبالتالي منع الربط بالمنشط. وفي حالات أخرى،يرتبط المثبط بموقع قريبا من موقع ربط المنشط،والنطاق المثبط الخاص به يتفاعل مع المنشط لمنعه من الربط بالتسلسل التنظيمي. كما يمكن أن يرتبط المثبط بشكل تنافسى إلى مواقع الربط الخاصة بعوامل النسخ العام الموجودة على دى إن أيه ويقوم بمنع تجميع آليات النسخ.المثبطات يمكنها أن ترتبط ايضا بالتسلسلات المنظمة سيز المثبطة الخاصة بها مانعة بذلك بدء النسخ حتى في وجود منشط في المنطقة التنظيمية. واحد من أكثر الآليات الشائعة المستخدمه بواسطة مثبطات النسخ تكون إستخدام نطاقه المثبط لتوظيف البروتينات المعروفة ب المثبطات المساعدة. المثبطات المساعدة غالبًا ما يكون لديها أنشطة إنزيمية يمكنها أن تمنع النسخ.العديد من المثبطات المساعدة تعمل كمادة هيستون دي أسيتيلاز،هيستون ميثيل ترانسفيراز،وغير ذلك من مٌعيدى تصميم الكروماتين ينتج عن هذه التعديلات التعبئة المحكمة فى دى إن أيه في النيكلوسوم وتقيد وصول عوامل النسخ والبوليميراز إلى مواقعهم التنظيمية وبالتالي تمنع النسخ.