Cis sont de courts fragments d’ADN non codant qui sont présents sur les mêmes chromosomes que les gènes qu’elles régulent. Ces fragments servent de sites de liaison pour les régulateurs transcriptionnels, protéines qui sont responsable du contrôle de la transcription des gènes et de l’expression différentielle des gènes entre les types de cellules chez les eucaryotes. Les séquences régulatrices Cis peuvent être proches du gène d’intérêt ou à des milliers de bases de la séquence d’ADN ; cependant, les séquences qui sont les plus éloignés sont souvent situées dans l’espace près du gène qu’ils régulent en raison de l’emballage serré de l’ADN dans le chromosome. Ceux qui sont proches dans la séquence régulent l’initiation de la transcription des gènes, tandis que ceux plus éloignés améliorent ou réduisent la transcription des gènes. de plusieurs séquences cis-régulatrices régulent la transcription de la plupart des gènes ; cependant, parfois, une seule séquence régulatrice cis- régule la transcription d’un gène.
Les facteurs de transcription se lient aux séquences régulatrices cis lorsque l’ADN est sous sa forme en double hélice. Les régulateurs transcriptionnels lient des séquences spécifiques, mais sont également capables de lier des séquences étroitement liées. La double hélice a deux types de sillons : le plus petit, le sillon mineur, et le plus grand, le sillon principal. Les facteurs de régulation sont plus susceptibles de se lier aux principaux sillons de l’ADN en raison de leur taille. Les régulateurs de transcription reconnaissent des séquences régulatrices cis spécifiques par les caractéristiques chimiques caractéristiques présentes sur les bords des paires de bases azotées. Par exemple, les bases ont différents donneurs et accepteurs de liaisons hydrogène exposés le long du sillon qui peuvent former des liaisons hydrogène avec les régulateurs transcriptionnels. Étant donné que de nombreuses interactions non covalentes sont également impliquées dans cette liaison, l’association est très stable.
