RNAは,DNAと比較して構造的および化学的に 安定性がはるかに低い可動性の比較的短命な分子です。RNAでは、5炭素糖リボースは 2番目の炭素にヒドロキシル基を持ち、デオキシリボースは1つの水素を持ちます。ヒドロキシル基の水素は、塩基性溶液で除去されやすくなっています。これが発生すると、残っている負に帯電した酸素が リン酸糖骨格を破壊します。さらに、RNAは通常一本鎖であるため、DNAの二重らせんよりも 構造的に不安定です。RNA分子はDNA分子よりもはるかに短いため、末端で分解されやすくなります。外的要因もRNAの安定性に影響します。例えば、RNaseと呼ばれる細胞質内の 特定のエキソヌクレアーゼは、翻訳されていないRNAを分解します。RNA結合タンパク質として知られる他のタンパク質は、特定のRNAヌクレオチド配列を認識して 結合することにより安定性に影響します。3プライム非翻訳領域、つまり3プライムUTRにある AUリッチ要素は,通常はAUUUAの繰り返しを含むmRNA転写産物のなかで,異なるクラスのRNA結合タンパク質を引き付けます。これらのタンパク質の中には、mRNAの安定性を高め、3プライムUTRに結合しているタンパク質の翻訳を増加させるものと 転写物を不安定化してより迅速に分解するものがあります。したがって、RNA分子が翻訳に 利用できる時間は可変で 複数の要因に依存します。