ジャーナル
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Mappatura del genoma della cromatina accessibile in linfociti T umani primari da ATAC-Seq
JoVE Journal
遺伝学
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JoVE Journal 遺伝学
Mapping Genome-wide Accessible Chromatin in Primary Human T Lymphocytes by ATAC-Seq

Mappatura del genoma della cromatina accessibile in linfociti T umani primari da ATAC-Seq

DOI:

09:08 min

November 13, 2017

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  • 00:05標題
  • 00:54Purification of Naïve Human CD4+ Cells, Polarization to Th1 and TH2 Cells, and Nuclei Extraction
  • 03:18Transposition Reaction and Library Amplification
  • 04:33Size Selection of ATAC-seq Libraries
  • 06:48Results: Quality Control and Next Generation Sequencing Reads
  • 08:07Conclusion

概要

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Analisi per Transposase-accessibile della cromatina accoppiato con sequenziamento ad alta produttività (ATAC-seq) è un metodo di genoma per scoprire accessibile della cromatina. Questo è un protocollo di ATAC-seq passo dopo passo, da molecolari all'analisi computazionale del finale, ottimizzato per i linfociti umani (Th1/Th2). Questo protocollo può essere adottato da ricercatori senza precedente esperienza nei metodi di sequenziamento di nuova generazione.

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