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的转录分析<em>ç</em>。<em>线虫</em> RNA测序数据通过炫套房的银河项目
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JoVE Journal 遺伝学
Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project
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的转录分析<em>ç</em>。<em>线虫</em> RNA测序数据通过炫套房的银河项目

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•

10:19 min

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April 08, 2017

DOI:

10.3791/55473-v

DOI:
10.3791/55473-v

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10:19 min
April 08, 2017

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1小児科,University of Pittsburgh School of Medicine, Children’s Hospital of Pittsburgh

概要

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银河和大卫已经成为流行的工具，让没有生物信息学培训调查分析和解释RNA-Seq的数据。我们描述了一种协议，用于秀丽隐杆线虫的研究人员进行RNA测序实验，访问和使用银河处理数据集，并获得从使用DAVID的基因列表有意义的生物信息。

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C. ElegansRNA SequencingTranscriptomic AnalysisTuxedo SuiteGalaxy ProjectバイオインフォマティクスDifferential Gene ExpressionGene OntologyNGS RNA AnalysisFASTQData UploadWorkflow

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Amrit, F. R. G., Ghazi, A. Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project. J. Vis. Exp. (122), e55473, doi:10.3791/55473 (2017).

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