כשזרע נובט, השורשים נמתחים אל תוך האדמה והניצן לעבר האור, הצמחים גם משנים את הגידול שלהם כדי למקסם את חשיפת האור. איך צמחים מרגישים את כיוון האור ואיכותו? קולטנים רגישים לאור המכונים גם פוטורצפטורים מתווכים את תגובת הצמח לאור.פוטורצפטורים מכילים רכיב חלבון הקשור לפיגמנט סופג אור הנקרא הכרומופור. צמחים עשויים להכיל משפחות מרובות וגרסאות של פוטורצפטורים. יחד הם מגיבים לאורכי גל אור שנעים בין אולטרה סגול לאזורים האדומים הרחוקים של ספקטרום האור.כל כרומופור בפוטורצפטור ספציפי סופג אור באורך גל מסוים וגורם למבנה שינוי בקולטן. הפעלתה פוטורצפטורים מפעילה מפל איתות בתוך תאי הצמח. זה, בתורו, יכול להוביל לביטוי גנים המשפיע על צמיחת הצמחים והמורפולוגיה.לדוגמא, צמחים משנים את צמיחתם כתגובה לצל באמצעות משפחת פוטורצפטורים פיטוכרום. לכל פיטוכרום יש שתי צורות ברורות, בלתי ניתנות להמרה:ה-Pr לא פעיל מבחינה פיזיולוגית וה-Pfr הפעיל. Pr סופג אור אדום ומומר במהירות לצורת Pfr הפעילה Pfr סופג אור אדום רחוק ומומר בחזרה לצורת Pr לא פעילה.ההמרה הרצופה של Pr ו-Pfr מגיעה לשיווי משקל דינמי באור יום צמחים גבוהים מאוד יכולים לסנן את האור האדום מתוך ספקטרום האור ולהשאיר צמחים מתחתיו עם אור אדום רחוק יותר מאור שמש ישיר. מערכת הפיטוכרום מאפשרת לצמח לחוש את היחס בין אור אדום לאדום רחוק ולהתאים את גידול הצמח. כאשר שיווי המשקל של Pfr נע לעבר Pr, הצמח מתארך בחיפוש אחר אור.רמה גבוהה יותר של Pfr מעוררת צמיחה צדדית או הסתעפות בדרך זו מערכת הפיטוכרום מאפשרת לצמחים להתרחק מהצל ולכיוון האור.