아미노산이번역 동안 리보솜에서 나올 때최초의 제1 단백질 구조를 형성하는데길이가 가변적인 체인 서열이다이 펩타이드 체인은 함께 모이는데두 아미노산의 아민과 카르복실 말단의 공유 결합으로이루어진다펩타이드가 길어지면, 수소 결합이 형성된다어떤 아미노산은 이웃과 결합하여가닥이 짧아지고 휘어지면서알파 나선이라는 나선형 구조를 만들어낸다다른 것들은 측면으로 결합하여 베타 구조라고 한다이러한 배열은 모두 단백질의이차적 구조로 알려져 있다추가 화학적 상호작용에는소수성 힘, 이온 결합 그리고아미노산 측기 사이에 일어나는이황화물 다리가 있는데그 상호작용이 증가하여 구상형의 3-D3차 조직이 되는데그것이 많은 단백질의 최종 기능 형태이다2개 이상의 폴리펩티드 체인이 3차 구조에서결합이 되면더 크고 복잡한 4차 구조가최적 상호작용을 위해 생겨난다